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第3のレプリコンを保有する新奇なコレラ菌O1株のゲノミクス解析

研究課題

研究課題/領域番号 24790414
研究種目

若手研究(B)

配分区分基金
研究分野 細菌学(含真菌学)
研究機関大阪大学

研究代表者

岡田 和久  大阪大学, 微生物病研究所, 特任助教 (40420434)

研究期間 (年度) 2012-04-01 – 2014-03-31
研究課題ステータス 完了 (2013年度)
配分額 *注記
4,420千円 (直接経費: 3,400千円、間接経費: 1,020千円)
2013年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
2012年度: 2,730千円 (直接経費: 2,100千円、間接経費: 630千円)
キーワードVibrio cholerae / コレラ菌 / タイ / コレラ
研究概要

我々は本研究においてコレラ菌が保有する二つの環状染色体 [Ch1(3.0 Mb)とCh2(1.0 Mb)]に加えて、0.9 Mbのレプリコン(Ch3)を保有するコレラ菌O1を3株見出した。Ch3を保有するTSY216株のゲノムと流行型コレラ菌O1株のものを比較した。両株の染色体は高く保存されていた。一方でCh3は両染色体と共有する領域が存在しなかった。Ch3には1031個のORFと全20種類のアミノ酸に対応するtRNA遺伝子がコードされていたが、Ch3の起源や機能については不明である。本研究で示した大規模遺伝子セットの獲得は、新型のコレラ菌 O1の出現の機会を与えるかもしれない。

報告書

(3件)
  • 2013 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2012 実施状況報告書
  • 研究成果

    (7件)

すべて 2014 2013

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件) 学会発表 (4件) (うち招待講演 1件) 図書 (2件)

  • [雑誌論文] Vibrio cholerae O1 Isolate with Novel Genetic Background, Thailand?Myanmar2013

    • 著者名/発表者名
      Okada K, Roobthaisong A, Swaddiwudhipong W, Hamada S, Chantaroj S
    • 雑誌名

      Emerg Infect Dis

      巻: 19 ページ: 1015-1017

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] タイにおけるVibrio choleraeの疫学 : 分子生物学的-遺伝学的解析2014

    • 著者名/発表者名
      岡田和久
    • 学会等名
      第87回日本細菌学会総会
    • 発表場所
      東京、日本
    • 年月日
      2014-03-28
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] Roobthaisong A, Chantaroj S, Hamada S, Emergence of Vibrio cholerae O1 carrying a gigantic replicon in Thailand2014

    • 著者名/発表者名
      Okada K, Natakuathung W, Na-Ubol M
    • 学会等名
      Asian-African Research Forum on Emerging and Reemerging infections 2014
    • 発表場所
      Sendai, Japan(Oral)
    • 年月日
      2014-01-22
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] タイにおけるVibrio choleraeの疫学:分子生物学的-遺伝学的解析2014

    • 著者名/発表者名
      岡田 和久
    • 学会等名
      第87回日本細菌学会総会
    • 発表場所
      タワーホール船堀、東京都
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Emergence of Vibrio cholerae O1 carrying a gigantic replicon in Thailand2014

    • 著者名/発表者名
      Okada K., Natakuathung W., Na-Ubol M., Roobthaisong A., Chantaroj S., Hamada S.
    • 学会等名
      Asian-African Research Forum on Emerging and Reemerging infections 2014
    • 発表場所
      仙台国際センター、宮城県
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [図書] タイでコレラに挑む.感染・炎症・免疫43:2013

    • 著者名/発表者名
      岡田和久、浜田茂幸
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [図書] 感染・炎症・免疫2013

    • 著者名/発表者名
      岡田 和久、浜田 茂幸
    • 総ページ数
      13
    • 出版者
      鳥居薬品株式会社
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書

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公開日: 2013-05-31   更新日: 2019-07-29  

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