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ウイルスヌクレオソーム標識実験法によるウイルス発現調節メカニズムの解析

研究課題

研究課題/領域番号 24790438
研究種目

若手研究(B)

配分区分基金
研究分野 ウイルス学
研究機関京都大学

研究代表者

蝦名 博貴  京都大学, ウイルス研究所, 助教 (60541951)

研究期間 (年度) 2012-04-01 – 2014-03-31
研究課題ステータス 完了 (2013年度)
配分額 *注記
4,420千円 (直接経費: 3,400千円、間接経費: 1,020千円)
2013年度: 2,080千円 (直接経費: 1,600千円、間接経費: 480千円)
2012年度: 2,340千円 (直接経費: 1,800千円、間接経費: 540千円)
キーワードHIV / 潜伏感染 / クロマチン / ゲノム編集 / HSV / ライブイメージング
研究概要

本研究の目的は、細胞ゲノムに組込まれたウイルスクロマチンをLacO/LacIシステムにて標識し、ウイルス発現制御メカニズムを明らかにすることである。その第一段階として、ゲノム編集CRISPR/Cas9法を用いたHIVプロウイルス改変技術を確立した。CRISPR/Cas9法を用いることでT細胞の潜伏HIVプロウイルスの改変が可能であることを明らかにした。HIV LTRを標的とすることでウイルスプロモーターの不活性化、ならびに、プロウイルスの抜き取りが可能であることを明らかにした。また、相同組替え修復経路を利用したCRISPR/Cas9法によりHIVプロウイルス相同組替えにも成功した。

報告書

(3件)
  • 2013 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2012 実施状況報告書
  • 研究成果

    (29件)

すべて 2013 2012 2011 その他

すべて 雑誌論文 (6件) (うち査読あり 6件) 学会発表 (18件) 備考 (5件)

  • [雑誌論文] Harnessing the CRISPR/Cas9 system to disrupt latent HIV-1 provirus2013

    • 著者名/発表者名
      Ebina H, Misawa N, Kanemura Y, Koyanagi Y
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 3 ページ: 2510-2510

    • NAID

      120005324896

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Harnessing the CRISPR/Cas9 system to disrupt latent HIV-1 provirus.2013

    • 著者名/発表者名
      Ebina H, Misawa N, Kanemura Y, Koyanagi Y.
    • 雑誌名

      Sci. Rep.

      巻: 3 号: 1 ページ: 2510-2510

    • DOI

      10.1038/srep02510

    • NAID

      120005324896

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Integrase-independent HIV-1 infection is augmented under conditions of DNA damage and produces a viral reservoir2012

    • 著者名/発表者名
      Ebina H, Kanemura Y, Suzuki Y, Urata K, Misawa N, Koyanagi Y
    • 雑誌名

      Virology

      巻: 427(1) ページ: 44-50

    • NAID

      120004007474

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] The hematopoietic cell-specific Rho GTPase inhibitor ARHGDIB/D4GDI limits HIV-1 replication2012

    • 著者名/発表者名
      Watanabe T, Urano E, Miyauchi K, Ichikawa R, Hamatake M, Misawa N, Sato K, Ebina H, Koyanagi Y, Komano J
    • 雑誌名

      AIDS Res Hum Retroviruses

      巻: 28(8) ページ: 913-22

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Integrase-independent HIV-1 infection is augmented under conditions of DNA damage and produces a viral reservoir2012

    • 著者名/発表者名
      Ebina H, Kanemura Y, Suzuki Y, Urata K, Misawa N, Koyanagi Y
    • 雑誌名

      Virology

      巻: 427 号: 1 ページ: 44-50

    • DOI

      10.1016/j.virol.2012.02.004

    • NAID

      120004007474

    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Rho GTPase inhibitorARHGDIB/D4GDI limits HIV-1 replication2011

    • 著者名/発表者名
      Watanabe T, Urano E, Koyanagi Y, KomanoJ, 10人中9番目
    • 雑誌名

      AIDS Research and Human Retroviruses

      巻: (印刷中) 号: 8 ページ: 1-10

    • DOI

      10.1089/aid.2011.0180

    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] Development of the CRISPR/Cas9 system editing for latent HIV-1 provirus2013

    • 著者名/発表者名
      蝦名博貴、三沢尚子、金村優香、小柳義夫
    • 学会等名
      第36回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] ゲノム編集技術による潜伏HIVプロウイルスの制御と除去2013

    • 著者名/発表者名
      蝦名博貴、三沢尚子、金村優香、小柳義夫
    • 学会等名
      第27回日本エイズ学会学術集会
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] ゲノム編集技術による潜伏HIVプロウイルスの制御と除去2013

    • 著者名/発表者名
      蝦名博貴
    • 学会等名
      第3回ゲノム編集研究会
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] I型IFN発現制御におけるSAMHD1の新規機能の解析2013

    • 著者名/発表者名
      金村優香、蝦名博貴、小柳義夫
    • 学会等名
      第36回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] Novel function of SAMHD1 to involve in regulation of type I interferon induction.2013

    • 著者名/発表者名
      金村優香, Peter Gee, 蝦名博貴, Yoo Ji Seung, 藤田尚志, 小柳義夫.
    • 学会等名
      第36回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      神戸
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] Development of the CRISPR/Cas9 system editing for latent HIV-1 provirus.2013

    • 著者名/発表者名
      Ebina, H., Misawa, N., Kanemura, Y., Koyanagi, Y.
    • 学会等名
      第36回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      神戸
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] ゲノム編集技術による潜伏HIVプロウイルスの制御と除去2013

    • 著者名/発表者名
      蝦名博貴, 三沢尚子, 金村優香, 小柳義夫.
    • 学会等名
      第27回日本エイズ学会学術集会
    • 発表場所
      熊本
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] ゲノム編集技術による潜伏HIVプロウイルスの制御と除去2013

    • 著者名/発表者名
      蝦名博貴.
    • 学会等名
      第3回ゲノム編集研究会
    • 発表場所
      広島
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] DNA damage induces illegitimate integration of HIV-1 in the presence of integrase inhibitor, leading to produce a viral reservoir2012

    • 著者名/発表者名
      Ebina H, Kanemura Y, Suzuki Y, Urata K, Misawa N, Koyanagi Y
    • 学会等名
      37^<th> Retroviruses Meeting Cold Spring Harbor
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] インテグラーゼ非依存的なHIV cDNAの組込み機構2012

    • 著者名/発表者名
      蝦名博貴
    • 学会等名
      第14回白馬シンポジウム
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] 生細胞におけるHIV cDNAの可視化とイメージング2012

    • 著者名/発表者名
      蝦名博貴、金村優香、小柳義夫
    • 学会等名
      第35回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] HIV cDNAの可視化とライブイメージングの確立2012

    • 著者名/発表者名
      蝦名博貴、金村優香、小柳義夫
    • 学会等名
      第60回日本ウイルス学会学術集会
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] ウイルス感染により誘導されるIFNの発現制御とウイルス複製におけるSAMHD1の役割2012

    • 著者名/発表者名
      金村優香, Peter Gee,蝦名博貴,小柳義夫
    • 学会等名
      第35回日本分子生物学年会
    • 発表場所
      福岡、4P-0447
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] DNA damage induces illegitimate integration of HIV-1 in the presence of integrase inhibitor, leading to produce a viral reservoir.

    • 著者名/発表者名
      Ebina H., Kanemura Y., Suzuki Y., Urata K., Misawa N. and Koyanagi Y.
    • 学会等名
      37th Retroviruses Meeting Cold Spring Harbor
    • 発表場所
      New York (USA)
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [学会発表] インテ グラーゼ非依存的なHIV cDNAの組込み機構.

    • 著者名/発表者名
      蝦名博貴
    • 学会等名
      第14回白馬シンポジウム
    • 発表場所
      京都
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [学会発表] HIV cDNAの 可視化とライブイメージングの確立.

    • 著者名/発表者名
      蝦名博貴、金村優 香、小柳義夫.
    • 学会等名
      第60回日本ウイルス学会学術集会
    • 発表場所
      大阪
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [学会発表] 生細胞 におけるHIV cDNAの可視化とイメージング

    • 著者名/発表者名
      蝦名博貴、金村優 香、小柳義夫.
    • 学会等名
      第35回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      福岡
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [学会発表] ウイルス感 染により誘導されるIFNの発現制御とウイルス複製におけるSAMHD1の役割

    • 著者名/発表者名
      金村優香、Peter Gee、蝦名博貴、小柳義夫
    • 学会等名
      第35回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      福岡
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [備考]

    • URL

      http://www.virus.kyoto-u.ac.jp/virus/kansenbyoutai.html

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [備考]

    • URL

      http://www.virus.kyoto-u.ac.jp/Lab/KoyanagiHP/saito/TOP.html

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [備考] 京都大学 ウイルス研究所 附属ヒトレトロウイルス研究施設 ウイルス病態研究領域

    • URL

      http://www.virus.kyoto-u.ac.jp/virus/kansenbyoutai.html

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [備考] 京都大学 ウイルス研究所 ウイルス病態研究領域 小柳研究室

    • URL

      http://www.virus.kyoto-u.ac.jp/Lab/KoyanagiHP/saito/TOP.html

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [備考] 京都大学 ウイルス研究所 ウイルス病態研究領域 小柳研究室

    • URL

      http://www.virus.kyoto-u.ac.jp/Lab/KoyanagiHP/saito/TOP.html

    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書

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公開日: 2013-05-31   更新日: 2019-07-29  

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