ＰＣＲクランプ法を用いたＮＯＴＣＨ１遺伝子変異の高感度迅速検出システムの開発

• 研究課題/領域番号: 24790797
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 基金
• 研究分野: 呼吸器内科学
• 研究機関: 北海道大学
• 研究代表者: 朝比奈 肇 北海道大学, 大学病院, 助教 (90374298)
• 研究期間 (年度): 2012-04-01 – 2014-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2013年度)
• 配分額: 4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円); 2013年度: 2,080千円 (直接経費: 1,600千円、間接経費: 480千円); 2012年度: 2,080千円 (直接経費: 1,600千円、間接経費: 480千円)
• キーワード: 肺癌 / Notch

研究概要

PNA-LNA PCR clamp法による Notch1遺伝子変異の高感度検出システムの開発を試みた。
点突然変異を有する変異Notch 1遺伝子のみを特異的に増幅するために、PCR clamp法を利用することとした。変異部位の正常DNAに対応する相補的な配列のPNAを用いたclamp primerを設計し、また続いて変異型を検出するために、変異に対応するfluorogenic probeとして、mutant probeを設計（Mutant probeでは野生型と変異型を厳密に区別するために、変異部位に対応する場所にLNAを用いる）することを検討したが、いずれも成功しなかった。