研究課題/領域番号 |
24810010
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研究種目 |
研究活動スタート支援
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配分区分 | 補助金 |
研究分野 |
ゲノム生物学
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研究機関 | 金沢大学 |
研究代表者 |
広瀬 修 金沢大学, 電子情報学系, 助教 (30549671)
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研究期間 (年度) |
2012-08-31 – 2014-03-31
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研究課題ステータス |
完了 (2013年度)
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配分額 *注記 |
3,120千円 (直接経費: 2,400千円、間接経費: 720千円)
2013年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
2012年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
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キーワード | レクチン / 複合糖鎖 / 判別分析 / 機械学習 / 結合予測 |
研究概要 |
糖鎖は単糖類が重合した物質で,特に複合糖鎖と呼ばれる糖鎖は細胞表面などに存在する糖タンパク質に結合し,発生・分化・免疫・癌化・感染といった生体内のあらゆる局面で重要な役割を果たす.糖鎖に対する構造解析法の近年の急激な進展によって,糖鎖や糖鎖認識タンパク質であるレクチンに関する情報が急速に蓄積しつつあり,糖鎖生物学の飛躍的な進展が期待されている.本研究課題期間に特にレクチンに関して以下の様な進捗があった.(1)タンパク質データベースからのレクチンの配列情報の取得およびキュレーション.(2)局所フィッシャー判別分析による配列情報からのレクチン予測.(3)レクチンを特徴付けるアミノ酸配列の推定.
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