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メチル化異常による先天奇形症候群における5-ヒドロキシメチルシトシンの役割の解明

研究課題

研究課題/領域番号 24890229
研究種目

研究活動スタート支援

配分区分補助金
研究分野 小児科学
研究機関慶應義塾大学

研究代表者

山澤 一樹  慶應義塾大学, 医学部, 助教 (10338113)

研究期間 (年度) 2012-08-31 – 2014-03-31
研究課題ステータス 採択後辞退 (2013年度)
配分額 *注記
2,990千円 (直接経費: 2,300千円、間接経費: 690千円)
2013年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2012年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
キーワードエピジェネティクス / メチル化 / 先天異常 / ゲノムインプリンティング
研究概要

近年、ゲノムDNA中に発見された5-ヒドロキシメチルシトシン(5-hydroxymethyl C: 5hmC)は、5-メチルシトシン(5-methyl C: 5mC)の酸化産物であり、DNA脱メチル化機構の一翼を担っていることから、「第6のDNA塩基」として注目されている。しかしながら、ヒトメチル化異常疾患において、5hmCの解析は現在まで全くなされていない。メチル化異常によるヒト先天奇形症候群症例を集積し、原因となっているインプリンティング調節領域のメチル化異常において5hmCがどのように関与しているかを解明することが本研究の目的である。
低メチル化または高メチル化のエピ変異に起因するゲノムインプリンティング異常関連疾患約300症例の末梢血からDNAを抽出し、5mCおよび5hmC特異的抗体を用いた免疫沈降法を行った。沈降サンプルに対し各インプリンティング調節領域 (ICR) にプライマーを設定し、定量PCRを用いてICRごとに5mCおよび5hmCのアレル別の分布を調べた。最初に免疫沈降法の条件検討を綿密に行い、5mCと5hmCの交差反応を最小限に最適化した。現在解析が進行中であるが、これまでの解析の結果、ICRにおいては5mCと5hmCは同アレルに存在することが判明した。この結果は、5hmCが脱メチル化と関連し、特に低メチル化のエピ変異において何らかの役割を果たす可能性を示唆する。別の手法(酸化バイサルファイト法)による解析の準備も同時に進めており、ゲノムインプリンティングと5mC/5hmCの挙動の関連が解明されることが今後期待される。

現在までの達成度 (区分)
理由

翌年度、交付申請を辞退するため、記入しない。

今後の研究の推進方策

翌年度、交付申請を辞退するため、記入しない。

報告書

(1件)
  • 2012 実績報告書
  • 研究成果

    (2件)

すべて 2013 2012

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件) 学会発表 (1件)

  • [雑誌論文] Molecular and clinical studies in 138 Japanese patients with Silver-Russell syndrome2013

    • 著者名/発表者名
      T. Fuke, S. Mizuno, T. Nagai, T. Hasegawa, R. Horikawa, Y. Miyoshi, K. Muroya, T. Kondoh, C. Numakura, S. Sato, K. Nakabayashi, C. Tayama, K. Hata, S. Sano, K. Matsubara, M. Kagami, K. Yamazawa, T. Ogata
    • 雑誌名

      PLoS. One

      巻: 8 号: 3 ページ: e60105-e60105

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0060105

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] インプリンティング調節領域におけるアレル特異的な5-ヒドロキシメチルシトシンの分布の解明2012

    • 著者名/発表者名
      山澤一樹
    • 学会等名
      日本人類遺伝学会 第57回大会
    • 発表場所
      京王プラザホテル(東京)
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書

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公開日: 2012-11-27   更新日: 2019-07-29  

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