化学修飾を含むmRNA配列設計の基盤技術

• 研究課題/領域番号: 24H00737
• 研究種目: 基盤研究(A)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 審査区分: 中区分62:応用情報学およびその関連分野
• 研究機関: 東京大学
• 研究代表者: 浅井 潔 東京大学, 大学院新領域創成科学研究科, 教授 (30356357)
• 研究分担者: 佐藤 健吾 東京電機大学, システム デザイン 工学部, 教授 (20365472) ; 上田 宏生 東京大学, 先端科学技術研究センター, 特任講師 (70821916) ; 阿部 洋 名古屋大学, 理学研究科, 教授 (80415067)
• 研究期間 (年度): 2024-04-01 – 2028-03-31
• 研究課題ステータス: 交付 (2024年度)
• 配分額: 47,970千円 (直接経費: 36,900千円、間接経費: 11,070千円); 2024年度: 14,170千円 (直接経費: 10,900千円、間接経費: 3,270千円)
• キーワード: RNA修飾塩基 / 配列設計 / 翻訳効率

研究開始時の研究の概要

mRNAの翻訳量・安定性を最適化するための配列設計は、mRNAの工学・医学応用に重要な課題である。しかしながら、mRNA配列の設計自由度を最大限に活かした配列設計は実現していない。また、RNAの修飾はその構造・機能に影響を与えることが知られているが、mRNAの修飾と翻訳量との関係は、未だ解明が不十分である。本研究では、化学修飾を含むmRNAを合成して翻訳量・安定性を測定し、シークエンサによるRNA修飾検出技術を用いた情報解析によって、化学修飾を含むmRNAの性能予測技術と、深層生成モデル用いたmRNAの設計技術の開発を行う。