炎症性腸疾患関連癌のDNAメチル化解析とcfDNAを用いた早期診断システムの開発

• 研究課題/領域番号: 24K02517
• 研究種目: 基盤研究(B)
• 配分区分: 基金
• 応募区分: 一般
• 審査区分: 小区分55020:消化器外科学関連
• 研究機関: 東京大学
• 研究代表者: 石原 聡一郎 東京大学, 医学部附属病院, 教授 (00376443)
• 研究分担者: 佐々木 和人 東京大学, 医学部附属病院, 講師 (00781238) ; 横山 雄一郎 東京大学, 医学部附属病院, 助教 (20880222) ; 品川 貴秀 東京大学, 医学部附属病院, 助教 (20972706) ; 江本 成伸 東京大学, 医学部附属病院, 助教 (30803267) ; 室野 浩司 東京大学, 医学部附属病院, 講師 (70773951) ; 野澤 宏彰 東京大学, 医学部附属病院, 准教授 (80529173)
• 研究期間 (年度): 2024-04-01 – 2028-03-31
• 研究課題ステータス: 交付 (2024年度)
• 配分額: 18,460千円 (直接経費: 14,200千円、間接経費: 4,260千円); 2027年度: 3,770千円 (直接経費: 2,900千円、間接経費: 870千円); 2026年度: 3,770千円 (直接経費: 2,900千円、間接経費: 870千円); 2025年度: 5,460千円 (直接経費: 4,200千円、間接経費: 1,260千円); 2024年度: 5,460千円 (直接経費: 4,200千円、間接経費: 1,260千円)
• キーワード: 炎症性腸疾患関連癌 / DNAメチル化解析

研究開始時の研究の概要

我々はこれまでに多種類の癌において、独自のメチル化パネル作成技術を用いて人工知能（AI）により血中cell-free DNA（cfDNA）を解析する、癌早期診断ツールの開発を行ってきた。炎症性腸疾患に合併する消化管癌（IBD関連癌）におけるDNAのメチル化パターンは散発性癌とは異なっている可能性があり、本研究ではまず、IBD関連癌の網羅的メチル化解析を行い、散発性大腸癌のメチル化プロファイルとの比較を行い、その違いを明らかにしたい。引き続いて、メチル化マーカーの候補からcfDNA検出用のメチル化パネルを作成し、患者血液検体を用いてAI診断モデルを作成し、さらにはその性能を検証する予定である。