ねじれ応答から探るDNA高次構造形成における局所配列の力学的役割

• 研究課題/領域番号: 24K06975
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 基金
• 応募区分: 一般
• 審査区分: 小区分13040:生物物理、化学物理およびソフトマターの物理関連
• 研究機関: 東京農工大学
• 研究代表者: 村山 能宏 東京農工大学, 工学(系)研究科(研究院), 准教授 (60334249)
• 研究期間 (年度): 2024-04-01 – 2027-03-31
• 研究課題ステータス: 交付 (2024年度)
• 配分額: 4,550千円 (直接経費: 3,500千円、間接経費: 1,050千円); 2026年度: 910千円 (直接経費: 700千円、間接経費: 210千円); 2025年度: 1,040千円 (直接経費: 800千円、間接経費: 240千円); 2024年度: 2,600千円 (直接経費: 2,000千円、間接経費: 600千円)
• キーワード: DNA / 高次構造 / ねじれ

研究開始時の研究の概要

本研究では、「遺伝子発現に寄与する数千塩基対（kbp）規模の高次構造は力学的に調節可能か？」という問いに答えるために、数十から数百bpの局所配列が挿入された１本のDNAをねじり、二重らせん構造を持つDNAがさらにねじられることで形成される“超らせん構造”を観測する。挿入された塩基配列の違いにより、形成される超らせんの位置や大きさに変化が生じるのかを明らかにする。