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速度論的解析に基づくデータ駆動型の細菌間相互作用ネットワーク推定

研究課題

研究課題/領域番号 24K08168
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
審査区分 小区分27040:バイオ機能応用およびバイオプロセス工学関連
研究機関横浜国立大学

研究代表者

鈴木 市郎  横浜国立大学, 大学院工学研究院, 講師 (90303081)

研究期間 (年度) 2024-04-01 – 2027-03-31
研究課題ステータス 交付 (2024年度)
配分額 *注記
4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円)
2026年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
2025年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2024年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
キーワードマイクロバイオーム / データ駆動型解析 / 比増殖速度 / 相互作用ネットワーク / 硝化細菌
研究開始時の研究の概要

伝統的発酵産業や排水処理、環境浄化など、多様な微生物から成る「微生物叢」を用いたバイオプロセスは様々に利用されている。
本研究では、硝化細菌群集を用いたアンモニア除去プロセスを対象に、申請者らがすでに構築した細菌叢組成の時系列データから各細菌の増殖パラメータを求める解析法を基に、細菌叢内で増殖する各細菌間の相互作用ネットワークを可視化する、簡便かつ新たなデータ駆動型のマイクロバイオーム解析法を構築する。
それにより、微生物叢を用いたバイオプロセスの機構をより深く考察し、その効率化・高機能化に寄与することを目指す。

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公開日: 2024-04-05   更新日: 2024-06-24  

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