酸化還元酵素の阻害活性予測モデルの開発

• 研究課題/領域番号: 24K08357
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 基金
• 応募区分: 一般
• 審査区分: 小区分32010:基礎物理化学関連
• 研究機関: 広島市立大学
• 研究代表者: 齋藤 徹 広島市立大学, 情報科学研究科, 准教授 (80747494)
• 研究期間 (年度): 2024-04-01 – 2027-03-31
• 研究課題ステータス: 交付 (2024年度)
• 配分額: 4,550千円 (直接経費: 3,500千円、間接経費: 1,050千円); 2026年度: 1,170千円 (直接経費: 900千円、間接経費: 270千円); 2025年度: 1,170千円 (直接経費: 900千円、間接経費: 270千円); 2024年度: 2,210千円 (直接経費: 1,700千円、間接経費: 510千円)
• キーワード: 金属酵素 / 相対的結合自由エネルギー / 50%阻害濃度 / SQM/ML / AIモデル

研究開始時の研究の概要

本研究では、酸化還元酵素-リガンド結合における相対的結合自由エネルギーの定量的予測法を提案し、中心金属イオンのスピン状態の変化や配位子交換を伴う酸化還元酵素に適用する。阻害剤候補物質の相対的結合自由エネルギーの計算データを目的変数、構造・物性データを説明変数とした機械学習SQM/MLを実施する。これにより、阻害剤候補物質の化合物名もしくは構造情報から50%阻害濃度を即座に推定可能な予測モデルを構築する。