「高速・高精度な水和理論」を用いたリガンド結合予測の精度向上

• 研究課題/領域番号: 24K09389
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 基金
• 応募区分: 一般
• 審査区分: 小区分43040:生物物理学関連
• 研究機関: 東北大学
• 研究代表者: 吉留 崇 東北大学, 工学研究科, 准教授 (90456830)
• 研究期間 (年度): 2024-04-01 – 2027-03-31
• 研究課題ステータス: 交付 (2024年度)
• 配分額: 4,550千円 (直接経費: 3,500千円、間接経費: 1,050千円); 2026年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円); 2025年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円); 2024年度: 1,170千円 (直接経費: 900千円、間接経費: 270千円)
• キーワード: 水和 / 深層学習 / リガンド結合

研究開始時の研究の概要

本研究の目的は、独自の「高速・高精度な水和理論」である「gr Predictor」と「Deep GIST」を用いて、ドッキングソフトに「水和」を顕に考慮することによって、リガンド結合ポーズの予測精度を向上させることである。水を顕に考慮したスコア関数と水を顕に考慮したタンパク質-リガンド複合体の構造生成法を開発し、2つを組み合わせることにより、リガンド結合ポーズ予測精度が既存のものよりも高いドッキングソフトを開発する。