研究課題
基盤研究(C)
微生物の多様性を生み出すしくみとして遺伝子の水平移動に着目し、そのゲノム上の痕跡であるゲノミックアイランドの動態を比較ゲノム解析により解明する。この目的のため、ゲノム上の遺伝子の並びが種内で保存された構造を、種内全体で共有される「コアゲノム」と、一部の株のみで共有される短い「アイランド」に分けて抽出し、それらの並び順を異種間で網羅的に比較する。これを用いて、どのような遺伝子群が、どのような生物種間で移動しているかを解析し、普遍的な特徴を抽出できるかを検討する。