多遺伝子座マイクロサテライト情報サービスとin silico多型解析ツールの展開

• 研究課題/領域番号: 24K09426
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 基金
• 応募区分: 一般
• 審査区分: 小区分43060:システムゲノム科学関連
• 研究機関: 東京情報大学
• 研究代表者: 田中 啓介 東京情報大学, 総合情報学部, 准教授 (60747294)
• 研究期間 (年度): 2024-04-01 – 2027-03-31
• 研究課題ステータス: 交付 (2024年度)
• 配分額: 4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円); 2026年度: 910千円 (直接経費: 700千円、間接経費: 210千円); 2025年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円); 2024年度: 2,470千円 (直接経費: 1,900千円、間接経費: 570千円)
• キーワード: マイクロサテライト / データベース / 多型解析 / 次世代シーケンサー / DNAマーカー

研究開始時の研究の概要

生命の設計図とも言われるDNA配列は、4種類の塩基からなるA・T・G・Cの文字列によって表現されている。DNA配列中には、「マイクロサテライト」と呼ばれる反復する領域（例えば、AGAGAG…）がいくつも存在しており、系統や個体間で独自の反復パターンを示すことから指紋領域として知られている。そのため、この反復領域は農学・法科学などにおけるDNAマーカー開発や個体識別技術、そのほか生態保全や遺伝資源の保存・管理として役立つことにも期待される。そこで本研究は、以前に実施した様々な生物種からなるマイクロサテライトデータベースのさらなる拡張、さらに系統や個体間を識別するための解析ツールの構築を目指す。