統合オミックス解析によるレトロトランスポゾン由来の新規免疫疾患関連RNAの同定

• 研究課題/領域番号: 24K10050
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 基金
• 応募区分: 一般
• 審査区分: 小区分48040:医化学関連
• 研究機関: 東京医科歯科大学
• 研究代表者: 上田 真保子 東京医科歯科大学, 難治疾患研究所, 助教 (60760353)
• 研究期間 (年度): 2024-04-01 – 2027-03-31
• 研究課題ステータス: 交付 (2024年度)
• 配分額: 4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円); 2026年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円); 2025年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円); 2024年度: 1,040千円 (直接経費: 800千円、間接経費: 240千円)
• キーワード: レトロトランスポソン / トランスクリプトーム / オミックス / 疾患関連遺伝子 / 新規遺伝子

研究開始時の研究の概要

本研究では、インターフェロンで活性化される免疫細胞から新規RNAを同定するとともに、最近完全解読された「T2Tゲノム」に特有の領域に存在する、レトロトランスポゾン由来のRNAも同定し、その機能と疾患への関与を網羅的に評価する。そのため、疾患オミックスデータ（eQTL-GWAS）をもちいた解析、ゲノム編集とシングルセル解析を組み合わせた分子機能解析（CRISPR-seq）、タンパク質の発現解析を実施する。これにより、機能を持つレトロトランスポゾン由来の新規RNAとその免疫関連疾患における役割を明らかにし、病態解明と新創薬標的の探索を行う。