肺大細胞神経内分泌癌におけるYAP1発現の不均一性にecDNAは関わっているのだろうか？

• 研究課題/領域番号: 24K10152
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 基金
• 応募区分: 一般
• 審査区分: 小区分49020:人体病理学関連
• 研究機関: 筑波大学
• 研究代表者: 臺 知子 筑波大学, 附属病院, 研究員 (20835194)
• 研究分担者: 松原 大祐 筑波大学, 医学医療系, 教授 (80415554)
• 研究期間 (年度): 2024-04-01 – 2027-03-31
• 研究課題ステータス: 交付 (2024年度)
• 配分額: 4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円); 2026年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円); 2025年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円); 2024年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
• キーワード: LCNEC / ecDNA / YAP1

研究開始時の研究の概要

本研究は、non-NE型の細胞とNE型の細胞が混在するLCNEC症例の全ゲノムシーケンスデータから変異、構造異常、ecDNAの検出を行う。検出された癌遺伝子の増幅はFISH及び免疫染色法を用いて検証する。さらに同じ症例の空間的トランスクリプトームデータからYAP1の発現とその関係する分子の発現について解析を行う。non-NE細胞群とNE細胞群が混在する症例とそうではない症例においてecDNAの割合が違うのか、ecDNAにある癌遺伝子が下流の遺伝子発現に関わっているのか、ecDNAを含め総合的に探索することを目的とする。