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新規遺伝子解析法によるヒルシュスプルング病の包括的原因遺伝子解析

研究課題

研究課題/領域番号 24K11779
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
審査区分 小区分55010:外科学一般および小児外科学関連
研究機関自治医科大学

研究代表者

照井 慶太  自治医科大学, 医学部, 教授 (70375773)

研究分担者 齋藤 武  千葉県がんセンター(研究所), がん治療開発グループ がん遺伝創薬研究室, 主任医長 (20406044)
川口 雄之亮  千葉大学, 医学部附属病院, 助教 (20896625)
下島 直樹  国立研究開発法人国立成育医療研究センター, 小児外科系専門診療部, 診療部長 (30317151)
関根 章博  千葉大学, 大学院医学研究院, 特任教授 (30425631)
真下 陽一  千葉大学, 大学院医学研究院, 技術専門職員 (90422253)
研究期間 (年度) 2024-04-01 – 2029-03-31
研究課題ステータス 交付 (2024年度)
配分額 *注記
4,550千円 (直接経費: 3,500千円、間接経費: 1,050千円)
2028年度: 910千円 (直接経費: 700千円、間接経費: 210千円)
2027年度: 910千円 (直接経費: 700千円、間接経費: 210千円)
2026年度: 910千円 (直接経費: 700千円、間接経費: 210千円)
2025年度: 910千円 (直接経費: 700千円、間接経費: 210千円)
2024年度: 910千円 (直接経費: 700千円、間接経費: 210千円)
キーワード遺伝子解析
研究開始時の研究の概要

①GWAS解析を行い,従来法で診断不能な症例を選定する.②健常人コントロールとして公開ヒト遺伝子データベースを取得し,加工可能な状態に変換する.③HSCR罹患者と健常人コントロールのアレル頻度をSNPごとに比較し,コントールの信頼区間99%の範囲からの外れ値となるSNPを抽出する.抽出されたSNPをマンハッタンプロットに描出し,関連性の高い遺伝子座を抽出する.抽出された遺伝子座のターゲットシークエンスを行い,原因遺伝子と変異パターンを同定する.④得られた候補遺伝子からHSCR遺伝子診断サポート体制を構築する.⑤遺伝情報と連動したHSCR情報バンクを構築し公開する.

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公開日: 2024-04-05   更新日: 2024-06-24  

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