遺体の口腔内細菌叢解析による病原性微生物の感染性評価

• 研究課題/領域番号: 24K13237
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 基金
• 応募区分: 一般
• 審査区分: 小区分57080:社会系歯学関連
• 研究機関: 東京医科歯科大学
• 研究代表者: 斉藤 久子 東京医科歯科大学, 大学院医歯学総合研究科, 准教授 (10292674)
• 研究分担者: 櫻田 宏一 東京医科歯科大学, 大学院医歯学総合研究科, 教授 (10334228) ; 鵜沼 香奈 東京医科歯科大学, 大学院医歯学総合研究科, 准教授(キャリアアップ) (30586425)
• 研究期間 (年度): 2024-04-01 – 2027-03-31
• 研究課題ステータス: 交付 (2024年度)
• 配分額: 3,900千円 (直接経費: 3,000千円、間接経費: 900千円); 2026年度: 650千円 (直接経費: 500千円、間接経費: 150千円); 2025年度: 1,170千円 (直接経費: 900千円、間接経費: 270千円); 2024年度: 2,080千円 (直接経費: 1,600千円、間接経費: 480千円)
• キーワード: 病原性微生物 / 遺体 / 口腔内細菌叢 / 感染性評価

研究開始時の研究の概要

遺体の口腔内スワブを用いて、次世代シークケンサー（NGS）によるメタゲノム解析を行い、梅毒、淋菌、髄膜炎菌、リステリアなどの同属の細菌叢を調査する。細菌叢解析の結果から、シークエンサーによる塩基配列解析によって細菌種を同定する。
これらの細菌に対して、EMA(ethidium monoazide)-PCR法による生菌迅速検出もしくは培養法により感染性評価を行い、これらの方法の精度を検討する。
死体状況、既往歴、死因との口腔内細菌叢調査及び病原性微生物の存在、感染力の有無について各種データの解析及び統合を行い、研究成果を公表する。