全ゲノム解析を基盤とした薬剤感受性試験による流行ESBL産生大腸菌早期検出法の開発

• 研究課題/領域番号: 24K13345
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 基金
• 応募区分: 一般
• 審査区分: 小区分58010:医療管理学および医療系社会学関連
• 研究機関: 日本医療大学
• 研究代表者: 望月 真希 日本医療大学, 保健医療学部, 教授 (60452976)
• 研究期間 (年度): 2024-04-01 – 2027-03-31
• 研究課題ステータス: 交付 (2024年度)
• 配分額: 4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円); 2026年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円); 2025年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円); 2024年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
• キーワード: 全ゲノム解析 / ESBL産生大腸菌

研究開始時の研究の概要

本研究では、北海道内医療施設患者から採取した ESBL 産生大腸菌の①分子疫学解析(質量分析/POT 試験)と②次世代シーケンス(NGS)による全ゲノム解析からAMR 遺伝子情報と病原因子構造の解明と統計化を行なう。次いで、③薬剤感受性試験結果とAMR遺伝子情報、構造遺伝子間のパターン化/相関性を提示する。上記成果の相互関係からNGSによる全ゲノム解析に依存せず、臨床検査現場で慣用的な薬剤感受性試験のみからESBL産生菌流行種を特定可能な監視システムの基盤を構築する。