非典型相互作用を記述する３次元関数の算出とin silico SBDD/FBDD技術への応用

• 研究課題/領域番号: 24K15167
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 基金
• 応募区分: 一般
• 審査区分: 小区分62010:生命、健康および医療情報学関連
• 研究機関: 昭和大学
• 研究代表者: 早川 大地 昭和大学, 薬学部, 講師 (20761141)
• 研究期間 (年度): 2024-04-01 – 2027-03-31
• 研究課題ステータス: 交付 (2024年度)
• 配分額: 4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円); 2026年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円); 2025年度: 520千円 (直接経費: 400千円、間接経費: 120千円); 2024年度: 2,860千円 (直接経費: 2,200千円、間接経費: 660千円)
• キーワード: 非典型分子間相互作用 / in silico SBDD/FBDD

研究開始時の研究の概要

ハロゲン結合や弱い水素結合をはじめとした非典型分子間相互作用は、タンパク質構造に基づいた医薬分子設計(SBDD)やFragment-based drug design(FBDD)において考慮する意義のある相互作用である。様々なフラグメント分子について、非典型相互作用が形成される方向と強さ(エネルギー)を知ることができれば、非典型相互作用を考慮したSBDD/FBDDを実施する際に役立つ。本研究では、これらの方向と強さを記述する3次元関数を、量子化学計算に基づいて明らかにする。更に、タンパク質表面に非典型相互作用を介して結合するフラグメント分子を、同３次元関数に基づいて予測する方法を検討する。