発展的ガウス過程回帰分析に基づく大規模蛍光プローブライブラリーの創成と応用

• 研究課題/領域番号: 24K17799
• 研究種目: 若手研究
• 配分区分: 基金
• 審査区分: 小区分37030:ケミカルバイオロジー関連
• 研究機関: 東京大学
• 研究代表者: 橘 椋 東京大学, 大学院薬学系研究科(薬学部), 助教 (20984628)
• 研究期間 (年度): 2024-04-01 – 2027-03-31
• 研究課題ステータス: 交付 (2024年度)
• 配分額: 4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円); 2026年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円); 2025年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円); 2024年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
• キーワード: 蛍光プローブ / ペプチド / ガウス過程回帰 / ベイズ最適化

研究開始時の研究の概要

従来のpeptidase蛍光プローブと比較して長いペプチド鎖を有する大規模な蛍光プローブライブラリーをin silicoで構築し、計算化学・ガウス過程回帰に基づく実験計画法を応用して、実際に合成することが不可能な１億種を超える個数の蛍光プローブ群を現実的な実験量の範囲内で効率的に評価する方法を確立する。蛍光プローブの構造展開可能性やプロテオミクス解析における表現力を高め、これまでのライブラリー戦略では達成困難であったpeptidaseプローブの構造最適化・優良ペプチド鎖の探索を行い、新たな創薬標的の探索や薬物動態のコントロールを目指す。