疾患機序解明に向けた時系列多因子摂動データを用いた遺伝子発現制御ネットワーク解析

• 研究課題/領域番号: 24K18099
• 研究種目: 若手研究
• 配分区分: 基金
• 審査区分: 小区分43060:システムゲノム科学関連
• 研究機関: 東京大学
• 研究代表者: 長岡 勇也 東京大学, 定量生命科学研究所, 特任研究員 (90979048)
• 研究期間 (年度): 2024-04-01 – 2027-03-31
• 研究課題ステータス: 交付 (2024年度)
• 配分額: 4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円); 2026年度: 1,170千円 (直接経費: 900千円、間接経費: 270千円); 2025年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円); 2024年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
• キーワード: シングルセル解析 / バイオインフォマティクス / 細胞分化

研究開始時の研究の概要

生物の生命活動はゲノム三次元構造や遺伝子発現が適切に制御されることで成り立っている。この制御にはコヒーシン複合体が非常に重要な役割を担っており、機能を果たす過程で30種類を超える因子と相互作用する。コヒーシンと関連因子の機能欠失はコヒーシン病と総称される多様な疾患の発症原因になるが、詳細な発症機序は未だ不明である。本研究では、CRISPR interference (CRISPRi) を用いたシングルセルノックダウンスクリーニング系「Perturb-seq」とヒトiPS細胞を用いた細胞分化系を組み合わせた「分化時系列Perturb-seq」を確立し、コヒーシン病の発症機序解明を目指す。