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転写制御機構に基づく催奇形因子作用機序の解明

研究課題

研究課題/領域番号 24K23417
研究種目

研究活動スタート支援

配分区分基金
審査区分 0902:内科学一般およびその関連分野
研究機関熊本大学

研究代表者

鄒 兆南  熊本大学, 生命資源研究・支援センター, 助教 (21000647)

研究期間 (年度) 2024-07-31 – 2026-03-31
研究課題ステータス 交付 (2024年度)
配分額 *注記
2,860千円 (直接経費: 2,200千円、間接経費: 660千円)
2025年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2024年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
キーワード高グルコース培養胚 / 転写制御 / 薬物の作用機序 / ビッグデータ / 局所オミクス / 空間レギュロミクス / 初期発生 / 先天異常
研究開始時の研究の概要

母体環境に起因する胎児の形態異常の発生プロセスを解明するために、マウス初期胚をモデルとして、高グルコースなどの環境要因摂動下での胚の微小領域における、トランスクリプトームとエピゲノム解析を行う。その結果をもとに、環境要因に応答し、ROI特異的に変動する遺伝子発現とエピゲノムランドスケープを抽出する。ROI特異的な転写制御を司るマスターレギュレータを特定するために、ChIP-Atlasを活用した転写因子エンリッチメント解析を行う。

研究実績の概要

妊娠中の高グルコースや葉酸不足などの環境要因が胎児の先天性心疾患や神経管閉鎖障害などの先天異常を引き起こす。本研究では、これらの環境因子がどのようにして心臓や神経管などの局所領域における遺伝子発現制御を変化させ、先天異常を誘発するかという作用機序の改名を目指した。その第一段階として、高グルコース条件におけるマウス初期胚の培養系を確立し、これを用いたトランスクリプトーム解析に成功した。

現在までの達成度
現在までの達成度

2: おおむね順調に進展している

理由

母体高血糖マウス胚および高グルコース培養胚における遺伝子発現の変化を明らかにした。

今後の研究の推進方策

これまで行ってきた Bulk 解析では、局所領域に限局した情報を取得できないため、今後は PIC を用いて化合物投与や疾患へ特異的に反応する組織のみの遺伝子発現変動情報の抽出に取り組む。

報告書

(1件)
  • 2024 実施状況報告書
  • 研究成果

    (4件)

すべて 2025 2024

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 1件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (2件) (うち国際学会 1件)

  • [雑誌論文] Hyperglycaemia induces diet-dependent defects of the left-right axis by lowering intracellular pH2025

    • 著者名/発表者名
      Matsuoka Ryohei、Kitajima Keiko、Nii Takenobu、Zou Zhaonan、Tanaka Kaori、Joo Kunihiko、Ohkawa Yasuyuki、Ohga Shouichi、Meno Chikara
    • 雑誌名

      Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Molecular Basis of Disease

      巻: 1871 号: 1 ページ: 167550-167550

    • DOI

      10.1016/j.bbadis.2024.167550

    • 関連する報告書
      2024 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] ChIP-Atlas 3.0:世界最大のエピゲノムデータ解析インフラ2024

    • 著者名/発表者名
      鄒 兆南、沖 真弥
    • 巻
      42
    • ページ
      2554
    • DOI

      10.18958/7539-00005-0001730-00

    • 関連する報告書
      2024 実施状況報告書
  • [学会発表] 転写制御に基づく創薬と疾患発症機序解析2024

    • 著者名/発表者名
      鄒 兆南、沖 真弥
    • 学会等名
      第47回日本分子生物学会
    • 関連する報告書
      2024 実施状況報告書
  • [学会発表] Elucidating disease-associated mechanisms triggered by pollutants using large-scale ChIP-Seq data2024

    • 著者名/発表者名
      Zhaonan Zou, Shinya Oki
    • 学会等名
      APBJC2024
    • 関連する報告書
      2024 実施状況報告書
    • 国際学会

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公開日: 2024-08-01   更新日: 2025-12-26  

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