細胞によるRNAポリメラーゼⅡ転写産物のソーティング機構

• 研究課題/領域番号: 25251004
• 研究種目: 基盤研究(A)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 分子生物学
• 研究機関: 京都大学
• 研究代表者: 大野 睦人 京都大学, ウイルス・再生医科学研究所, 教授 (80201979)
• 連携研究者: 谷口 一郎 京都大学, ウイルス・再生医科学研究所, 助教 (00467432)
• 研究期間 (年度): 2013-10-21 – 2018-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2017年度)
• 配分額: 44,720千円 (直接経費: 34,400千円、間接経費: 10,320千円); 2017年度: 8,710千円 (直接経費: 6,700千円、間接経費: 2,010千円); 2016年度: 8,710千円 (直接経費: 6,700千円、間接経費: 2,010千円); 2015年度: 8,710千円 (直接経費: 6,700千円、間接経費: 2,010千円); 2014年度: 8,710千円 (直接経費: 6,700千円、間接経費: 2,010千円); 2013年度: 9,880千円 (直接経費: 7,600千円、間接経費: 2,280千円)
• キーワード: RNAポリメラーゼⅡ / RNA核外輸送 / mRNA / U snRNA / hnRNP / UsnRNA / ｈｎRNP / RNAﾎﾟﾘﾒﾗｰｾﾞⅡ / U ｓｎRNA / RNAポリメラーゼII

研究成果の概要

hnRNP Cの4量体の発現低下した細胞中では、U snRNA輸送因子が結合してしまったような異常mRNAの核外輸送が停止されることが分かっている。このようなmRNA複合体の異常を感知して発現を止める新規核内mRNA監視機構を明らかにする。4量体の活性と拮抗するPHAXに着目して解析したところ、U snRNAの核外輸送因子というかなり特殊な機能を持つと思われていたPHAXの発現低下が、ゲノムの不安定化を引き起こすことが明らかになった。この原因として、DNA損傷応答に重要なヒストンH2AXの発現が低下していることが分かり、PHAXのDNA損傷応答における重要性が明らかになった。

研究成果

• [雑誌論文] Ribosomal protein uS7/Rps5 serine-223 in protein kinase-mediated phosphorylation and ribosomal small subunit maturation (2018)
  • 著者名/発表者名: Tomioka Makoto、Shimobayashi Mitsugu、Kitabatake Makoto、Ohno Mutsuhito、Kozutsumi Yasunori、Oka Shogo、Takematsu Hiromu
  • 雑誌名: SCIENTIFIC REPORT 巻: 8 号: 1 ページ: 1244-1244
  • DOI: 10.1038/s41598-018-19652-z
  • NAID: 120006510286
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Transport Granules Bound with Nuclear Cap Binding Protein and Exon Junction Complex Are Associated with Microtubules and Spatially Separated from eIF4E Granules and P Bodies in Human Neuronal Processes (2017)
  • 著者名/発表者名: Wang Dan O.、Ninomiya Kensuke、Mori Chihiro、Koyama Ayako、Haan Martine、Kitabatake Makoto、Hagiwara Masatoshi、Chida Kazuhiro、Takahashi Shin-Ichiro、Ohno Mutsuhito、Kataoka Naoyuki
  • 雑誌名: Front Mol. Biosci. 巻: 4 ページ: 4-93
  • DOI: 10.3389/fmolb.2017.00093
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Dendritic transport element of human arc mRNA confers RNA degradation activity in a translation-dependent manner. (2016)
  • 著者名/発表者名: Ninomiya K, Ohno M, Kataoka N.
  • 雑誌名: Genes Cells 巻: 21 号: 11 ページ: 1263-1269
  • DOI: 10.1111/gtc.12439
  • 査読あり
• [雑誌論文] Exportin-5 mediates nuclear export of SRP RNA in vertebrates (2015)
  • 著者名/発表者名: Takeiwa T, Taniguchi I, Ohno M
  • 雑誌名: Genes to Cells 巻: 20 号: 4 ページ: 281-291
  • DOI: 10.1111/gtc.12218
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] 適正なＲＮＡ核外輸送複合体形成の保証機構 (2015)
  • 著者名/発表者名: 谷口一郎、大野睦人
  • 雑誌名: 生化学 巻: 第８７巻第１号 ページ: 68-74
• [雑誌論文] Identification of the specific interactors of the human lariat RNA debranching enzyme 1 protein. (2015)
  • 著者名/発表者名: Masaki S, Yoshimoto R, Kaida D, Hata A, Satoh T, Ohno M, Kataoka N
  • 雑誌名: Int. J. Mol. Sci 巻: 16 号: 2 ページ: 3705-21
  • DOI: 10.3390/ijms16023705
  • NAID: 120005555507
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Crt10 directs the cullin-E3 ligase Rtt101 to nonfunctional 25S rRNA decay (2015)
  • 著者名/発表者名: Sakata T, Fujii K, Ohno M, Kitabatake M
  • 雑誌名: Biochem. Biophys. Res. Commu 巻: 457 号: 1 ページ: 90-4
  • DOI: 10.1016/j.bbrc.2014.12.072
  • NAID: 120005567895
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] HIV-1 Rev protein specifies the viral RNA export pathway by suppressing TAP/NXF1 recruitment (2014)
  • 著者名/発表者名: Taniguchi I, Mabuchi N, Ohno M
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res 巻: 42 号: 10 ページ: 6645-58
  • DOI: 10.1093/nar/gku304
  • NAID: 120005458278
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Analysis of RNA localization and export in Xenopus oocytes and mammalian cells (2014)
  • 著者名/発表者名: Taniguchi, I., McCloskey, A. and Ohno, M
  • 雑誌名: Methods Cell Biol 巻: 122 ページ: 395-413
• [雑誌論文] p54nrb/ NonO and PSF promote U snRNA nuclear export by accelerating its export complex assembly (2014)
  • 著者名/発表者名: Izumi, H., McCloskey, A., Shinmyozu, K., Ohno, M
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res 巻: 42 号: 6 ページ: 3998-4007
  • DOI: 10.1093/nar/gkt1365
  • NAID: 120005439166
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] RNAの長さに隠された秘密 (2013)
  • 著者名/発表者名: ﾏｸﾛｰｽｷｰ亜紗子、谷口一郎、大野睦人
  • 雑誌名: 実験医学 巻: 31 No.7 ページ: 135-143
• [学会発表] Systematic analysis of hnRNP C domains in sorting RNA polymerase II transcripts. (2017)
  • 著者名/発表者名: Dantsuji, S., Taniguchi, I. and Ohno,
  • 学会等名: 15th International Student Seminar
  • 発表場所: Kyoto, Japan
  • 年月日: 2017-02-23
  • 国際学会
• [学会発表] 環状RNA（circRNA）の核外輸送機構の解明 (2017)
  • 著者名/発表者名: 芳本 玲、谷口 一郎、大野 睦人、前田 明
  • 学会等名: 第40回日本分子生物学会年会
• [学会発表] mRNA様long noncoding RNAの核局在化機構の解析 (2017)
  • 著者名/発表者名: 竹岩俊彦、大野睦人
  • 学会等名: RNAフロンティアミーティング2017
• [学会発表] Identification of RNA helicase used in U snRNA export (2017)
  • 著者名/発表者名: Taniguchi I, Ohno M.
  • 学会等名: 第19回日本RNA学会年会
• [学会発表] Systematic analysis of hnRNP C domains in sorting RNA polymerase II transcripts (2017)
  • 著者名/発表者名: Dantsuji S, Taniguchi I, Ohno M.
  • 学会等名: 第19回日本RNA学会年会
• [学会発表] Nuclear export versus nuclear retention of RNA. (2016)
  • 著者名/発表者名: Ohno, M.
  • 学会等名: IVR retreat
  • 発表場所: Otsu, Shiga, Japan
  • 年月日: 2016-12-21
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Exportin-5 mediates nuclear export of SRP RNA in vertebrates. (2016)
  • 著者名/発表者名: Takeiwa, T, and Ohno, M.
  • 学会等名: 18th RNA meeting
  • 発表場所: Kyoto, Japan
  • 年月日: 2016-06-28
  • 国際学会
• [学会発表] Quality Control of Eukaryotic Ribosomes (2016)
  • 著者名/発表者名: Kitabatake M., Sakata T., Ohno M.
  • 学会等名: The 18th Tokyo RNA Club - Ribosome and Translational Apparatus
  • 発表場所: Tokyo University, Tokyo, Japan
  • 年月日: 2016-01-14
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Selective ubiquitination and degradation of defective 60S particles. (2016)
  • 著者名/発表者名: Kitabatake, M., Sakata, T. and Ohno, M.
  • 学会等名: RNA2016 satellite-symposium
  • 発表場所: Kyoto, Japan
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] HIV-1 Rev protein specifies the viral RNA export pathway by suppressing TAP/NXF1 recruitment (2015)
  • 著者名/発表者名: Taniguchi, I. and Ohno, M
  • 学会等名: East Asia Joint Symposium 2015
  • 発表場所: Okinawa Institute of Science and Technology Graduate University, Okinawa, Japan
  • 年月日: 2015-11-11
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] A cellular mechanism that sorts RNA transcripts according to their lengths (2015)
  • 著者名/発表者名: Ohno, M
  • 学会等名: The 10th International Symposium for the Inter-institutional Network (ISIIN)
  • 発表場所: Hokkaido University, Sapporo, Hokkaido, Japan
  • 年月日: 2015-07-23
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] 真核生物60Sリボソームの品質管理とストレス応答経路との関わり (2015)
  • 著者名/発表者名: 北畠真、坂田知子、藤井耕太郎、大野睦人
  • 学会等名: 第３回 RIBOSOME MEETING
  • 発表場所: ANAホリディ・インリゾート宮崎(宮崎県宮崎市)
  • 年月日: 2015-03-17 – 2015-03-18
• [学会発表] HIV-1のRevタンパク質はTAP/NXF1のリクルートを抑制することによりウイルスRNAの核外輸送経路を規定する (2014)
  • 著者名/発表者名: 谷口一郎、馬渕直人、大野睦人
  • 学会等名: 第16回日本RNA学会
  • 発表場所: ウインクあいち（愛知県名古屋市）
  • 年月日: 2014-07-23 – 2014-07-25
• [学会発表] Exportin-5がSRP RNAの核外輸送に果たす役割 (2014)
  • 著者名/発表者名: 竹岩俊彦, 大野睦人
  • 学会等名: 第16回日本RNA学会
  • 発表場所: ウインクあいち（愛知県名古屋市）
  • 年月日: 2014-07-23 – 2014-07-25
• [学会発表] ショウジョウバエにおけるRNA polymerase II転写産物の仕分け機構の解析 (2014)
  • 著者名/発表者名: 鈴木完、谷口一郎、大野睦人
  • 学会等名: 第16回日本RNA学会
  • 発表場所: ウインクあいち（愛知県名古屋市）
  • 年月日: 2014-07-23 – 2014-07-25
• [学会発表] Inhibition of mRNA export through dispersion of nucleoporins. (2013)
  • 著者名/発表者名: Ohno M, McCloskey A
  • 学会等名: 第36回日本分子生物学会
  • 発表場所: 神戸市
  • 招待講演
• [学会発表] RNAi-mediated depletion of hnRNP C revealed a novel surveillance mechanism of proper mRNP formation. (2013)
  • 著者名/発表者名: Ohno M, McCloskey A
  • 学会等名: RNA Sciences in Cell and Developmental Biology
  • 発表場所: 神戸市
  • 招待講演
• [図書] ノンコーディングRNA（廣瀬哲郎・泊幸秀 編）「ncRNAの生合成経路（21章）」 (2016)
  • 著者名/発表者名: 竹岩俊彦、谷口一郎、大野睦人
  • 総ページ数: 10
  • 出版者: 化学同人