• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 前のページに戻る

FIB/SEMを用いたヌクレオソームトモグラフィーによる染色体内部構造の解明

研究課題

研究課題/領域番号 25252064
研究種目

基盤研究(A)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 応用分子細胞生物学
研究機関鳥取大学 (2016-2017)
大阪大学 (2013-2015)

研究代表者

福井 希一  鳥取大学, 染色体工学研究センター, 特任教授 (00311770)

研究分担者 若生 俊行  国立研究開発法人農業生物資源研究所, その他部局等, 主任研究員 (80373257)
近江戸 伸子  神戸大学, 人間発達環境学研究科, 教授 (30343263)
高田 英昭  国立研究開発法人産業技術総合研究所, 生命工学領域, 主任研究員 (20455207)
内山 進  大阪大学, 工学研究科, 教授 (90335381)
研究期間 (年度) 2013-04-01 – 2018-03-31
研究課題ステータス 完了 (2017年度)
配分額 *注記
43,940千円 (直接経費: 33,800千円、間接経費: 10,140千円)
2017年度: 4,810千円 (直接経費: 3,700千円、間接経費: 1,110千円)
2016年度: 9,880千円 (直接経費: 7,600千円、間接経費: 2,280千円)
2015年度: 9,880千円 (直接経費: 7,600千円、間接経費: 2,280千円)
2014年度: 9,880千円 (直接経費: 7,600千円、間接経費: 2,280千円)
2013年度: 9,490千円 (直接経費: 7,300千円、間接経費: 2,190千円)
キーワード染色体 / 高次構造 / ヌクレオソーム / 染色体スキャフォールド / FIB/SEM / ナノテクノロジー / 3次元構築 / ヒト / クロマチン線維 / 染色体軸 / 構造解析 / 透過電子顕微鏡 / トモグラフィー / ナノバイオ / 可視化 / 生物・生体工学 / 電子顕微鏡 / バイオテクノロジー / マイクロテクノロジー / 構造化照明顕微鏡 / FIB/SEM / 細胞・組織 / ゲノム / クロマチン / 収束イオンビーム/走査電子顕微鏡 / ヘリウムイオン顕微鏡 / イオン液体
研究成果の概要

3世紀に渡って謎のままである染色体の内部構造について、ヌクレオソームの位置を可視化することにより明らかにすることを試みた。その為、イオンビームを用いて染色体のスライスを作製し、その断面像を画像解析した。その結果、ヌクレオソームの配列に規則性は見出せず、染色体内部でヌクレオソームはほぼランダムに分布していると考えられた。同時に行った染色体軸の解析では、複数のタンパク質の軸が互いに絡み合っていることを見出し、剛性と柔軟性を共に兼ね備えた構造であることを明らかにした。

報告書

(6件)
  • 2017 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2016 実績報告書
  • 2015 実績報告書
  • 2014 実績報告書
  • 2013 実績報告書
  • 研究成果

    (43件)

すべて 2018 2017 2016 2015 2014 2013 その他

すべて 国際共同研究 (3件) 雑誌論文 (17件) (うち国際共著 7件、 査読あり 17件、 オープンアクセス 7件、 謝辞記載あり 2件) 学会発表 (20件) (うち国際学会 10件、 招待講演 4件) 図書 (3件)

  • [国際共同研究] 国立ナノテクノロジー研究所/マッギル大学(カナダ)

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [国際共同研究] カセサート大学(タイ)

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [国際共同研究] ノンラム大学(ベトナム)

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [雑誌論文] Development of a quantitative pachytene chromosome map and its unification with somatic chromosome and linkage maps of rice (Oryza sativa L.)2018

    • 著者名/発表者名
      Ohmido Nobuko、Iwata Aiko、Kato Seiji、Wako Toshiyuki、Fukui Kiichi
    • 雑誌名

      PLOS ONE

      巻: 13 号: 4 ページ: e0195710-e0195710

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0195710

    • NAID

      120006466551

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Interdependency and phosphorylation of KIF4 and condensin I are essential for organization of chromosome scaffold2017

    • 著者名/発表者名
      Poonperm Rawin、Takata Hideaki、Uchiyama Susumu、Fukui Kiichi
    • 雑誌名

      PLOS ONE

      巻: 12 号: 8 ページ: e0183298-e0183298

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0183298

    • NAID

      120006995026

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Calcium depletion destabilises kinetochore fibres by the removal of CENP-F from the kinetochore2017

    • 著者名/発表者名
      Phengchat Rinyaporn、Takata Hideaki、Uchiyama Susumu、Fukui Kiichi
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 7 号: 1 ページ: 7355-7355

    • DOI

      10.1038/s41598-017-07777-6

    • NAID

      120006995023

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Calcium ions function as a booster of chromosome condensation.2016

    • 著者名/発表者名
      Phengchat, R., Takata, H., Morii, K., Inada, N., Murakoshi, H., Uchiyama, S., and Fukui, K.
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 6 号: 1 ページ: 38281-38281

    • DOI

      10.1038/srep38281

    • NAID

      120006995007

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Contribution of nanotechnology to chromosome science2016

    • 著者名/発表者名
      Fukui Kiichi
    • 雑誌名

      Chromosome Science

      巻: 19 号: 1-4 ページ: 51-56

    • DOI

      10.11352/scr.19.51

    • NAID

      130006837151

    • ISSN
      1344-1051, 2185-0852
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structural analysis of human chromosome by FIB/SEM2016

    • 著者名/発表者名
      Sasakura Soma、Yoshida Akiyo、Wako Toshiyuki、Kaneyoshi Kohei、Poonperm Rawin、Ogawa Shinichi、Kato Jun、Otsuka Yuji、Takata Hideki、Uchiyama Susumu、Fukui Kiichi
    • 雑誌名

      Chromosome Science

      巻: 19 号: 1-4 ページ: 25-31

    • DOI

      10.11352/scr.19.25

    • NAID

      130006837148

    • ISSN
      1344-1051, 2185-0852
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] The effect of magnesium ions on chromosome structure as observed by scanning electron microscopy (SEM) and scanning transmission electron microscope (STEM) tomography2016

    • 著者名/発表者名
      Dwiranti Astari、Takata Hideaki、Uchiyama Susumu、Fukui Kiichi
    • 雑誌名

      Chromosome Science

      巻: 19 号: 1-4 ページ: 19-23

    • DOI

      10.11352/scr.19.19

    • NAID

      130006837145

    • ISSN
      1344-1051, 2185-0852
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Towards single particle imaging of human chromosomes at SACLA.2015

    • 著者名/発表者名
      Robinson. I, Schwenke. J, Yusuf. M, Estandarte. A, Zhang. F, Chen. B, Clark. J, Song. C, Nam. D, Joti. Y, Tono. K, Yabashi. M, Ratnasari. G, Kaneyoshi. K, Takata. H, and Fukui. K
    • 雑誌名

      J. Phys. B At Mol. Opt. Phys.

      巻: 48 号: 24 ページ: 244007-244007

    • DOI

      10.1088/0953-4075/48/24/244007

    • NAID

      120006995009

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Chromosome Scaffold is a Double-Stranded Assembly of Scaffold Proteins.2015

    • 著者名/発表者名
      Poonperm R, Takata H, Hamano T, Matsuda A, Uchiyama S, Hiraoka Y, Fukui K
    • 雑誌名

      Sci. Rep.

      巻: 5 号: 1 ページ: 11916-11916

    • DOI

      10.1038/srep11916

    • NAID

      120006995010

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Effects of dehydration and drying steps on human chromosome interior revealed by focused ion beam/scanning electron microscopy (FIB/SEM)2015

    • 著者名/発表者名
      Kaneyoshi, K., Fukuda, S., Dwiranti, A., Kato, J., Otsuka, Y., Takata, H., Uchiyama, S., Ogawa, S. and Fukui, K.
    • 雑誌名

      Chromosome Science

      巻: 18 ページ: 23-28

    • NAID

      130005114058

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著 / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Stimulated Raman spectral microscope using synchronized Er- and Yb-fiber lasers.2014

    • 著者名/発表者名
      1.Nose, K., Kishi, T., Ozeki, Y., Kanematsu, Y., Takata, H., Fukui, K., Takai, Y. and Itoh, K.
    • 雑誌名

      Jpn. J. Appl. Phys.

      巻: 53 ページ: 052401-052401

    • NAID

      210000143745

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Localization of transgene-derived friabilins in rice endosperm cells.2014

    • 著者名/発表者名
      2.Fujiwara, M., Suzuki, G., Kudo, D., Oba, H., Wada, Y., Wada, H., Wada, N., Rahman, S., Fukui, K. and Mukai, Y.
    • 雑誌名

      Plant Biotechnology

      巻: 31 ページ: 67-70

    • NAID

      130003382506

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] The effect of magnesium ions on chromosome structure as observed by helium ion microscopy.2014

    • 著者名/発表者名
      3.Dwiranti, A., Hamano, T., Takata, H., Nagano, S., Guo, H., Onishi, K., Wako, T., Uchiyama, S. and Fukui, K.
    • 雑誌名

      Microsc. Microanal.

      巻: 20 ページ: 184-188

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Chromosome interior observation by focused ion beam/scanning electron microscopy (FIB/SEM) using ionic liquid technique.2014

    • 著者名/発表者名
      4.Hamano, T., Dwiranti, A., Kaneyoshi, K., Fukuda, S., Kometani, R., Nakao, M., Takata, H., Uchiyama, S., Ohmido, N. and Fukui, K.
    • 雑誌名

      Microsc. Microanal.

      巻: 20 ページ: 1340-1347

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Stimulated Raman spectral microscope using synchronized Er- and Yb-fiber lasers.2014

    • 著者名/発表者名
      Nose, K., Kishi, T., Ozeki, Y., Kanematsu, Y., Takata, H.,Fukui, K., Takai, Y. and Itoh, K.
    • 雑誌名

      Japanese Journal of Applied Physics

      巻: 53 号: 5 ページ: 52401-52401

    • DOI

      10.7567/jjap.53.052401

    • NAID

      210000143745

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] The effect of magnesium ions on chromosome structure as observed by Helium Ion Microscopy.2013

    • 著者名/発表者名
      Dwiranti, A., Hamano, T., Takata, H., Nagano, S., Hongxuan Guo, Onishi, K., Wako, T., Uchiyama, S. and Fukui, K.
    • 雑誌名

      Microsc. Microanal.

      巻: 20 ページ: 184-188

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] ASURA (PHB2) interacts with scc1 through chromatin.2013

    • 著者名/発表者名
      Equilibrina, I., Matsunaga, S., Morimoto, A., Hashimoto, T. Uchiyama, S., Fukui, K.
    • 雑誌名

      Cytogenet. Genome Res.

      巻: 139 ページ: 225-233

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] Structural analysis of human chromosomes by micro- and nano-technology2018

    • 著者名/発表者名
      Fukui Kiichi
    • 学会等名
      The 35th Annual Conference of the Microscopy Society of Thailand
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 界を超えた染色体の類似性について2017

    • 著者名/発表者名
      福井 希一
    • 学会等名
      第1回木村資生記念進化学セミナー
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Condensins as important compornents for chromosome2017

    • 著者名/発表者名
      Fukui Kiichi
    • 学会等名
      SMC proteins. Chromosome organizers from bacteria to human
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Chromosome research, historical perspectives2016

    • 著者名/発表者名
      Kiichi Fukui
    • 学会等名
      3rd Japan-UK Chromosome Workshop
    • 発表場所
      大阪大学
    • 年月日
      2016-02-11
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Three dimensional chromosome structure observed by STEM2016

    • 著者名/発表者名
      Kohei Kaneyoshi
    • 学会等名
      3rd Japan-UK Chromosome Workshop
    • 発表場所
      大阪大学
    • 年月日
      2016-02-11
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Chromosome structure observation by helium ion microscopy2016

    • 著者名/発表者名
      Soma Sasakura
    • 学会等名
      3rd Japan-UK Chromosome Workshop
    • 発表場所
      大阪大学
    • 年月日
      2016-02-11
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] ヘリウム/ネオンイオン顕微鏡技術によるヒト染色体の観察・加工2016

    • 著者名/発表者名
      小川 真一、笹倉 颯馬、兼吉 航平、高田 英明、内山 進、福井 希一
    • 学会等名
      第77回応用物理学会秋季学術講演会
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] ナノテクノロジーを用いた染色体高次構造へのアプローチ2016

    • 著者名/発表者名
      福井 希一
    • 学会等名
      第89回日本生化学会大会
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Approach to Chromosome Structure by Ga FIB/SEM and Ne FIB/HIM2016

    • 著者名/発表者名
      Sasakura Soma、Yoshida Akiyo、Kaneyoshi Kohei、 Dwiranti Astari、Takata Hideaki、Uchiyama Susumu、Otsuka Yuji、Ogawa Shinichi、Fukui Kiichi
    • 学会等名
      MNC 2016 29th International Microprocesses and Nanotechnology Conference
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Chromosome scaffold has double stranded assembly of the scaffold proteins2015

    • 著者名/発表者名
      Rawin Poonperm
    • 学会等名
      第38回日本分子生物学会年会・第88回日本生化学会大会 合同大会
    • 発表場所
      神戸国際会議場
    • 年月日
      2015-12-02
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] Effects of dehydration and critical point drying on human chromosome inner structure observed by FIB/SEM2015

    • 著者名/発表者名
      Kohei Kaneyoshi
    • 学会等名
      28th International Microprocesses and Nanotechnology Conference
    • 発表場所
      富山国際会議場
    • 年月日
      2015-11-12
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Chromosome: Fascinating target for biological scientists2015

    • 著者名/発表者名
      Kiichi Fukui
    • 学会等名
      70th Korean Association of Biological Sciences
    • 発表場所
      Seoul National University
    • 年月日
      2015-08-12
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Inner chromosome structure observed by FIB/SEM2015

    • 著者名/発表者名
      Kohei Kaneyoshi
    • 学会等名
      2nd UK-Japan Chromosome Workshop
    • 発表場所
      Kasesart University
    • 年月日
      2015-05-01
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Contribution of nano-technology to the chromosome science2015

    • 著者名/発表者名
      Kiichi Fukui
    • 学会等名
      The 5th Asian chromosome colloquium
    • 発表場所
      Kasetsart University
    • 年月日
      2015-04-29
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Chromosome scaffold structure revealed by 3D-SIM and FIB/SEM2014

    • 著者名/発表者名
      Rawin POONPERM, Hideaki TAKATA, Toru HAMANO, Atsushi MATSUDA, Susumu UCHIYAMA, Yasushi HIRAOKA and Kiichi Fukui
    • 学会等名
      第65回染色体学会
    • 発表場所
      倉敷市芸文館
    • 年月日
      2014-10-24 – 2014-10-25
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Chromosome inner structure revealed by Focused Ion Beam/Scanning Electron Microscopy(FIB/SEM)2014

    • 著者名/発表者名
      S. FUKUDA, K.KANEYOSHI, R. POONPERM, T.HAMANO, H.TAKATA, S.UCHIYAMA and K.FUKUI
    • 学会等名
      第65回染色体学会
    • 発表場所
      倉敷市芸文館
    • 年月日
      2014-10-24 – 2014-10-25
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] H3 serine 10 phosphorylation is required for formation of condensed chromosome2014

    • 著者名/発表者名
      kota INOUE,Ilma EQUILIBRINA, Yukako TANAKA, Krayukhina ELENA, Yuya ISHIKAWA, Akihiro KAWAMOTO, Takayuki KATO, Keiichi NAMBA, Isao SUETAKE, Shoji TAJIMA, Hideaki TANAKA, Susumu UCHIYAMA, and Kiichi FUKUI
    • 学会等名
      第65回染色体学会
    • 発表場所
      倉敷市芸文館
    • 年月日
      2014-10-24 – 2014-10-25
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Chromosome observation by scanning electron microscopy using ionic liquids.2013

    • 著者名/発表者名
      Dwiranti, A., Mochizuki, E., Kuwabata, S., Takaoka, A., Uchiyama, S., Fukui,K.
    • 学会等名
      19th International Chromosome Conference
    • 発表場所
      Bologna Universitate
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] Direct visualization of inside of barley and human chromosomes2013

    • 著者名/発表者名
      Fukui, K.
    • 学会等名
      Triticeae Cytogenetics: Past, Present, and Future
    • 発表場所
      Masukawa Hall, Kyoto Univ.
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Chromosome condensation induced by a divalent cation, Ca2+, in vitro and in vivo.2013

    • 著者名/発表者名
      Phengchat, R., Takata, H., Uchiyama S., Fukui, K.
    • 学会等名
      The 64th Annual Meeting of the Society of Chromosome Research
    • 発表場所
      Kuroda Hall, Toyama Univ.
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [図書] ビジュアルバイオテクノロジー2017

    • 著者名/発表者名
      福井希一他監訳
    • 総ページ数
      261
    • 出版者
      化学同人
    • ISBN
      9784759819205
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [図書] バーバラマクリントックの生涯2016

    • 著者名/発表者名
      大坪 久子、田中 順子、土本 卓、福井 希一
    • 総ページ数
      136
    • 出版者
      養賢堂
    • ISBN
      9784842505527
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [図書] Advances in Imaging Methods on Plant Chromosomes. In: S Dutta Gupta, Yasuomi Ibaraki eds., Plant Image Analysis: Fundamentals and Applications.2014

    • 著者名/発表者名
      Wako, T., Kato, S., Ohmido, N., Fukui, K.
    • 総ページ数
      400
    • 出版者
      CRC Press, Boca Raton, FL, USA
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書

URL: 

公開日: 2013-05-15   更新日: 2022-05-18  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi