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ゲノム編集技術を用い、ゲノム不安定性に与えるクロマチン構造の役割を解明する

研究課題

研究課題/領域番号 25281019
研究種目

基盤研究(B)

配分区分一部基金
応募区分一般
研究分野 放射線・化学物質影響科学
研究機関大阪大学

研究代表者

藤原 智子 (石川智子 / 石川 智子 / 藤原 智子(石川智子))  大阪大学, 医学(系)研究科(研究院), 助教 (70402922)

連携研究者 藤堂 剛  大阪大学, 大学院医学系研究科, 教授 (90163948)
研究期間 (年度) 2013-04-01 – 2016-03-31
研究課題ステータス 完了 (2015年度)
配分額 *注記
17,420千円 (直接経費: 13,400千円、間接経費: 4,020千円)
2015年度: 5,330千円 (直接経費: 4,100千円、間接経費: 1,230千円)
2014年度: 5,330千円 (直接経費: 4,100千円、間接経費: 1,230千円)
2013年度: 6,760千円 (直接経費: 5,200千円、間接経費: 1,560千円)
キーワードメダカ / 損傷メモリー / 遺伝的不安定性 / マイクロサテライト不安定性 / 環境ストレス / エピジェネティック変化 / クロマチン構造変化 / ゲノム編集技術
研究成果の概要

放射線や化学変異原により誘発される遺伝的不安定性は、発ガン等長い潜伏期を経て発症する生体影響には極めて重要な要因である。その要因は何らかの損傷メモリーと考えられているが、その実体は明らかでない。エピジェネティック変化が損傷メモリーに関与しているかを検証できる実験系の構築を目指した。損傷により誘発される遺伝的不安定性を検出する系としてCRISPRを利用し、特定のゲノム領域に二重鎖切断を誘発し、マイクロサテライト不安定性を検出する系を確立した。損傷メモリーの形成・維持に関与すると考えられる遺伝子群の変異体のうちレスキューの必要なATR、DNA-PKcsについてはレスキュー用のBACの作製を行った。

報告書

(4件)
  • 2015 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2014 実績報告書
  • 2013 実績報告書
  • 研究成果

    (46件)

すべて 2016 2015 2014 2013

すべて 雑誌論文 (7件) (うち査読あり 7件、 オープンアクセス 4件) 学会発表 (38件) (うち国際学会 8件、 招待講演 1件) 図書 (1件)

  • [雑誌論文] Viable neuronopathic Gaucher disease model in medaka (Oryzias latipes) displays axonal accumulation of alpha-synuclein2015

    • 著者名/発表者名
      Norihito Uemura, Masato Koike, Satoshi Ansai, Masato Kinoshita, Tomoko Ishikawa-Fujiwara, Hideaki Matsui, Kiyoshi Naruse, Naoaki Sakamoto, Yasuo Uchiyama, Takeshi Todo, Shunichi Takeda, Hodaka Yamakado, Ryosuke Takahashi
    • 雑誌名

      PLoS Genetics

      巻: 11 号: 4 ページ: 1-14

    • DOI

      10.1371/journal.pgen.1005065

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Loss of follicle-stimulating hormone receptor function causes masculinization and sippression of ovarian development in genetically female medaka.2014

    • 著者名/発表者名
      Murozumi N, Nakashima R, Hirai T, Kamei Y, Ishikawa-Fujiwara T, Todo T, Kitano T.
    • 雑誌名

      Endocrinology

      巻: 155(8) 号: 8 ページ: 3136-45

    • DOI

      10.1210/en.2013-2060

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] The Cryptochrome/Photolyase Family in aquatic organisms.2014

    • 著者名/発表者名
      Oliveri P, et al.
    • 雑誌名

      Mar Genomics

      巻: pii: S1874-7787(14) ページ: 22-1

    • DOI

      10.1016/j.margen.2014.02.001

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書 2013 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Human papillomavirus and p53 mutations in head and neck squamous cell carcinoma among Japanese population.2014

    • 著者名/発表者名
      Maruyama H, Yasui T, Ishikawa-Fujiwara T, Morii E, Yamamoto Y, Yoshii T, Takenaka Y, Nakahara S, Todo T, Hongyo T, Inohara H.
    • 雑誌名

      Cancer Sci.

      巻: 105(4) 号: 4 ページ: 409-417

    • DOI

      10.1111/cas.12369

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] p53-Dependent suppression of genome instability in germ cells.2014

    • 著者名/発表者名
      Otozai S, Ishikawa-Fujiwara T, Oda S, Kamei Y, Ryo H, Sato A, Nomura T, Mitani H, Tsujimura T, Inohara H, Todo T.
    • 雑誌名

      Mutat Res,

      巻: 760 ページ: 24-32

    • DOI

      10.1016/j.mrfmmm.2013.12.004

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Circadian and Circalunar Clock Interactions in a Marine Annelid.2013

    • 著者名/発表者名
      Zantke J, et al.
    • 雑誌名

      Cell Rep.

      巻: 5(1) 号: 1 ページ: 99-113

    • DOI

      10.1016/j.celrep.2013.08.031

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] ATF6α/β-mediated adjustment of ER chaperone levels is essential for development of the notochord in medaka fish.2013

    • 著者名/発表者名
      Ishikawa T, Okada T, Ishikawa-Fujiwara T, Todo T, Kamei Y, Shigenobu S, Tanaka M, Saito TL, Yoshimura J, Morishita S, Toyoda A, Sakaki Y, Taniguchi Y, Takeda S, Mori K.
    • 雑誌名

      Mol Biol Cell

      巻: 24(9) 号: 9 ページ: 1387-1395

    • DOI

      10.1091/mbc.e12-11-0830

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] Targeted Inactivation of Oryzias latipes Rev1 Gene2016

    • 著者名/発表者名
      Tomoko I Fujiwara, Yoshihiro Fujikawa, Kumi Nakamura, Takeshi Todo
    • 学会等名
      International Meeting on Aquatic Model Organisms for Human Disease and Toxicology Research
    • 発表場所
      愛知
    • 年月日
      2016-03-18
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Comprehensive establishment of TLS polymerase mutants using TALENs in Medaka fish.2016

    • 著者名/発表者名
      Fujikawa Y, Ishikawa-Fujiawara T, Sakuma T, Yamamoto T, Todo T
    • 学会等名
      International Meeting on Aquatic Model Organisms for Human Disease and Toxicology Research
    • 発表場所
      愛知
    • 年月日
      2016-03-18
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] TALENsを利用したメダカTLSポリメラーゼ遺伝子群変異体の網羅的作製2015

    • 著者名/発表者名
      藤川芳宏、藤原(石川)智子、佐久間哲史、山本卓、藤堂剛
    • 学会等名
      日本環境変異原学会第44回大会
    • 発表場所
      福岡
    • 年月日
      2015-11-27
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] Targeted inactivation of translesion DNA synthesis polymerase genes in Medaka fish using TALENs.2015

    • 著者名/発表者名
      Fujikawa Y, Ishikawa-Fujiawara T, Sakuma T, Yamamoto T, Todo T
    • 学会等名
      Conference on Transposition and Genome Engineering 2015
    • 発表場所
      奈良
    • 年月日
      2015-11-17
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Establishment of translesion DNA synthesis polymerase gene mutants in Medaka fish using TALENs.2015

    • 著者名/発表者名
      Fujikawa Y, Ishikawa-Fujiawara T, Sakuma T, Yamamoto T, Todo T
    • 学会等名
      The 7th Asia and Oceania Conference on Photobiology
    • 発表場所
      Taipei
    • 年月日
      2015-11-15
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] TALENsによるメダカTLS polymerase 遺伝子破壊2015

    • 著者名/発表者名
      藤川芳宏、藤原(石川)智子、佐久間哲史、山本卓、藤堂剛
    • 学会等名
      第1回放射線ワークショップ
    • 発表場所
      富山
    • 年月日
      2015-10-16
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] ゲノム編集技術を用いた紫外線感受性変異体の作成2015

    • 著者名/発表者名
      藤原(石川)智子、藤川芳宏、白石絵吏、藤堂剛
    • 学会等名
      第21回小型魚類研究会
    • 発表場所
      大阪
    • 年月日
      2015-09-19
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] ゲノム編集技術(TALENs)を用いた損傷乗越えDNA合成ポリメラーゼ(Rev3L, Rev)変異体メダカの作製2015

    • 著者名/発表者名
      藤川芳宏、藤原(石川)智子、佐久間哲史、山本卓、藤堂剛
    • 学会等名
      第21回小型魚類研究会
    • 発表場所
      大阪
    • 年月日
      2015-09-19
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] メダカにおけるゲノム編集技術(TALENs)を用いた損傷乗り越えDNA合成ポリメラーゼ(Rev3L、Rev7)変異体の作製2015

    • 著者名/発表者名
      藤川芳宏、藤原(石川)智子、佐久間哲史、山本卓、藤堂剛
    • 学会等名
      変異機構研究会・第28回夏の学校
    • 発表場所
      愛知
    • 年月日
      2015-07-25
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] モデル生物を使った紫外線感受性解析系の確立2015

    • 著者名/発表者名
      藤原(石川)智子
    • 学会等名
      第37回日本光医学・光生物学会
    • 発表場所
      宮崎
    • 年月日
      2015-07-17
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] メダカにおける新規cryptochromeの機能解析2015

    • 著者名/発表者名
      藤原(石川)智子、藤川芳宏、白石絵吏、藤堂剛
    • 学会等名
      第37回日本光医学・光生物学会
    • 発表場所
      宮崎
    • 年月日
      2015-07-17
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] ゲノム編集技術TALENを利用したメダカのRev3L, Rev7遺伝子変異体の作製2015

    • 著者名/発表者名
      藤川芳宏、藤原(石川)智子、佐久間哲史、山本卓、藤堂剛
    • 学会等名
      第37回日本光医学・光生物学会
    • 発表場所
      宮崎
    • 年月日
      2015-07-17
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] Targeted Inactivation of Rev1 Gene2015

    • 著者名/発表者名
      Tomoko I Fujiwara, Yoshihiro Fujikawa, Kumi Nakamura, Takeshi Todo
    • 学会等名
      The 15th International Congress of Radiation Research
    • 発表場所
      Kyoto
    • 年月日
      2015-05-25
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] p53-Dependent Suppression of Genome Instability in Germ Cells2015

    • 著者名/発表者名
      Tomoko Ishikawa-Fujiwara, Shinji Otozai, Shoji Oda, Hiroshi Mitani, Takeshi Todo
    • 学会等名
      The 15th International Congress of Radiation Research
    • 発表場所
      Kyoto
    • 年月日
      2015-05-25
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Genome Editing in Medaka: Targeted Inactivation of TLS polymerase genes using TALENs.2015

    • 著者名/発表者名
      Fujikawa Y, Ishikawa-Fujiawara T, Nakamura K, Sakuma T, Yamamoto T, Todo T
    • 学会等名
      The 15th International Congress of Radiation Research
    • 発表場所
      Kyoto
    • 年月日
      2015-05-25
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] In vivo and In vitro Analysis of Testis-ova Formation due to the Irradiation in p53 De¬cient Medaka Testis2015

    • 著者名/発表者名
      Kento Nagata, Ayaka Nishitani, Takako Yasuda, Tomomi Asaka, Shoji Oda, Yutaka Suzuki, Tomoko I Fujiwara, Takeshi Todo, Hiroshi Mitani
    • 学会等名
      The 15th International Congress of Radiation Research
    • 発表場所
      Kyoto
    • 年月日
      2015-05-25
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Molecular mechanism of mutagenesis in Medaka fish2015

    • 著者名/発表者名
      Tomoko Ishikawa-Fujiwara, Yoshihiro Fujikawa, Eri Shiraishi, Takeshi Todo
    • 学会等名
      International Symposium on Genome Science 2015
    • 発表場所
      東京・一橋講堂
    • 年月日
      2015-01-20 – 2015-01-21
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] CRISPR/Cas9システムによるメダカ光回復酵素遺伝子変異体の樹立2014

    • 著者名/発表者名
      藤原(石川) 智子、藤川 芳宏、藤堂 剛
    • 学会等名
      第57回日本放射線影響学会
    • 発表場所
      鹿児島・鹿児島県民交流センター
    • 年月日
      2014-10-01 – 2014-10-03
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] メダカ生殖細胞における放射線誘発遺伝的不安定性の解析2014

    • 著者名/発表者名
      藤原(石川) 智子、音在 信治、尾田 正二、三谷 啓志、猪原 秀典、藤堂 剛
    • 学会等名
      第57回日本放射線影響学会
    • 発表場所
      鹿児島・鹿児島県民交流センター
    • 年月日
      2014-10-01 – 2014-10-03
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] TALENs によるメダカにおける TLS ポリメラーゼ遺伝子群変異体の網羅的作製2014

    • 著者名/発表者名
      藤川 芳宏、藤原(石川) 智子、佐久間 哲史、山本 卓、藤堂 剛
    • 学会等名
      第57回日本放射線影響学会
    • 発表場所
      鹿児島・鹿児島県民交流センター
    • 年月日
      2014-10-01 – 2014-10-03
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Functional conversion of (6-4) photolyase and CPD photolyase2014

    • 著者名/発表者名
      Daichi Yamada, Junpei Yamamoto, Tomoko Ishikawa, Tomohiro Suzuki, I M. Mahaputra Wijaya, Tatsuya Iwata, Elizabeth D. Getzoff, Takeshi Todo, Shigenori Iwai and Hideki Kandori
    • 学会等名
      第52回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      北海道・札幌コンベンションセンター
    • 年月日
      2014-09-25 – 2014-09-27
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] ゲノム編集技術:CRISPR/Cas9システムによるメダカ光回復酵素遺伝子変異体の樹立2014

    • 著者名/発表者名
      藤原(石川) 智子、藤川 芳宏、藤堂 剛
    • 学会等名
      第18回日本光生物学協会年会
    • 発表場所
      大阪・大阪市立大学学術総合センター
    • 年月日
      2014-08-22 – 2014-08-23
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] TALENsを利用した遺伝子破壊によるメダカの損傷乗り越えDNA合成ポリメラーゼ遺伝子変異体の作成2014

    • 著者名/発表者名
      藤川 芳宏、藤原(石川) 智子、佐久間 哲史、山本 卓、藤堂 剛
    • 学会等名
      第18回日本光生物学協会年会
    • 発表場所
      大阪・大阪市立大学学術総合センター
    • 年月日
      2014-08-22 – 2014-08-23
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] 変異導入による(6-4)光回復酵素からCPD光回復酵素への機能転換2014

    • 著者名/発表者名
      山田 大智、山元 淳平、.I. M. Mahaputra Wijaya、岩田 達也、鈴木智大、石川 智子、Elizabeth D. Getzoff、藤堂 剛、岩井 成憲、神取 秀樹
    • 学会等名
      第18回日本光生物学協会年会
    • 発表場所
      大阪・大阪市立大学学術総合センター
    • 年月日
      2014-08-22 – 2014-08-23
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] CRISPR/Cas9システムによるメダカ光回復酵素遺伝子変異体の樹立2014

    • 著者名/発表者名
      藤原(石川) 智子、 藤川 芳宏、 藤堂 剛
    • 学会等名
      第36回光医学光生物学会
    • 発表場所
      大阪・大阪大学医学部学友会館
    • 年月日
      2014-07-25 – 2014-07-26
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] メダカにおけるゲノム編集技術(TALENs)を用いた損傷乗り越えDNA合成ポリメラーゼ遺伝子群変異体の作製2014

    • 著者名/発表者名
      藤川 芳宏、藤原(石川) 智子、佐久間 哲史、山本 卓、藤堂 剛
    • 学会等名
      第36回光医学光生物学会
    • 発表場所
      大阪・大阪大学医学部学友会館
    • 年月日
      2014-07-25 – 2014-07-26
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] メダカにおける人工ヌクレアーゼ(TALEN)を用いた損傷乗り越えポリメラーゼ変異体の作製2013

    • 著者名/発表者名
      藤川芳宏、藤原(石川)智子、佐久間哲史、山本卓、藤堂剛
    • 学会等名
      日本環境変異原学会第42回大会
    • 発表場所
      岡山市
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] Targeted Inactivation of Rev1 gene2013

    • 著者名/発表者名
      Tomoko Ishikawa-Fujiwara, Kumi Nakamura, Yoshihiro Fujikawa, Takeshi Todo
    • 学会等名
      The 6th Asia and Oceania Conference on Photobiology
    • 発表場所
      Sydney, Australia
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] The molecular structure and damaged-DNA repair activity affected by the chromophore binding2013

    • 著者名/発表者名
      Kazunori Zikihara, Kohei Kasakawa, Tomoko Ishikawa, Kristin Tessmar-Raible, Satoru Tokutomi, Takeshi Todo
    • 学会等名
      The 6th Asia and Oceania Conference on Photobiology
    • 発表場所
      Sydney, Australia
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] Targeted Inactivation of DNA photolyase family genes using CRISPR system2013

    • 著者名/発表者名
      Tomoko Ishikawa-Fujiwara, Kumi Nakamura, Yoshihiro Fujikawa, Takeshi Todo
    • 学会等名
      The 6th Asia and Oceania Conference on Photobiology
    • 発表場所
      Sydney, Australia
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] ゲノム編集技術(CRISPR)を利用したメダカ光回復酵素遺伝子変異体の作製2013

    • 著者名/発表者名
      藤原 石川 智子、藤川 芳宏、中村 公美、藤堂  剛
    • 学会等名
      日本放射線影響学会第56回大会
    • 発表場所
      青森市
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] ゲノム編集技術(TALEN)を用いたメダカにおけるTLS ポリメラーゼ変異体の網羅的作製2013

    • 著者名/発表者名
      藤川 芳宏、藤原(石川) 智子、中村 公美、佐久間 哲史、山本  卓、藤堂  剛
    • 学会等名
      日本放射線影響学会第56回大会
    • 発表場所
      青森市
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] ゲノム編集技術TALEN を用いた特異的欠損部位変異の作製方法の樹立;メダカRev1 BRCT ドメイン欠損変異体作製2013

    • 著者名/発表者名
      中村 公美、藤原(石川) 智子、佐久間 哲史、山本  卓、藤堂  剛
    • 学会等名
      日本放射線影響学会第56回大会
    • 発表場所
      青森市
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] DNA-PK 自己リン酸化異常時におけるp53のDSB 修復経路選択への関わり2013

    • 著者名/発表者名
      大西 壽子、漆原 佑介、藤原 智子、尾田 正二、藤堂  剛、三谷 啓志
    • 学会等名
      日本放射線影響学会第56回大会
    • 発表場所
      青森市
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] Genome editing in medaka: targeted inactivation of DNA photolyase family genes using CRISPR system2013

    • 著者名/発表者名
      Tomoko Ishikawa-Fujiwara, Yoshihiro Fujikawa, Kumi Nakamura, Takeshi Todo
    • 学会等名
      18th Japanese Medaka and Zebrafish Meeting
    • 発表場所
      仙台市
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] Genome editing in medaka: targeted inactivation of TLS polymerase genes usingTALENs2013

    • 著者名/発表者名
      Yoshihiro Fujikawa, Tomoko Ishikawa-Fujiwara, Kumi Nakamura, Tetsushi Sakuma, Takashi Yamamoto, Takeshi Todo
    • 学会等名
      18th Japanese Medaka and Zebrafish Meeting
    • 発表場所
      仙台市
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] Genome editing in medaka: targeted inactivation of Rev1 gene by TALEN2013

    • 著者名/発表者名
      Kumi Nakamura, Yoshihiro Fujikawa, Tomoko Ishikawa-Fujiwara, Tetsushi Sakuma, Takashi Yamamoto, Takeshi Todo
    • 学会等名
      18th Japanese Medaka and Zebrafish Meeting
    • 発表場所
      仙台市
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] ATF6α/β-mediated adjustment of ER chaperone levels is essential for development of the notochord in medaka fish2013

    • 著者名/発表者名
      Tokiro Ishikawa, Tetsuya Okada, Tomoko Ishikawa-Fujiwara, Takeshi Todo, Yasuhiro Kamei, Shuji Shigenobu, Minoru Tanaka, Taro L. Saito, Jun Yoshimura, Shinichi Morishita, Atsushi Toyoda, Yoshiyuki Sakaki, Yoshihito Taniguchi, Shunichi Takeda, Kazutoshi Mori
    • 学会等名
      18th Japanese Medaka and Zebrafish Meeting
    • 発表場所
      仙台市
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [図書] 光老化科学の最前線 第11章「DNA光化学と概日リズム」2015

    • 著者名/発表者名
      藤原(石川)智子、藤堂剛
    • 総ページ数
      301
    • 出版者
      シーエムシー出版
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書

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公開日: 2013-05-21   更新日: 2019-07-29  

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