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「その場」実験マイクロデバイスによるシングルセル・エピジェネティクス解析技術開発

研究課題

研究課題/領域番号 25286035
研究種目

基盤研究(B)

配分区分一部基金
応募区分一般
研究分野 ナノマイクロシステム
研究機関東京大学

研究代表者

小穴 英廣  東京大学, 工学(系)研究科(研究院), 准教授 (20314172)

連携研究者 鷲津 正夫  東京大学, 大学院工学系研究科, 教授 (10201162)
オケヨ ケネディ  東京大学, 大学院工学系研究科, 助教 (10634652)
研究期間 (年度) 2013-04-01 – 2016-03-31
研究課題ステータス 完了 (2015年度)
配分額 *注記
19,760千円 (直接経費: 15,200千円、間接経費: 4,560千円)
2015年度: 4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円)
2014年度: 4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円)
2013年度: 10,400千円 (直接経費: 8,000千円、間接経費: 2,400千円)
キーワードゲノム / DNA / マイクロ流体デバイス / バイオテクノロジー / マイクロ・ナノデバイス / シングルセル / エピジェネティクス
研究成果の概要

本研究において、我々は個々の細胞から染色体/クロマチンを単離し、エピゲノム解析するための新たな手法を開発した。即ち、顕微鏡下で細胞から染色体/クロマチンを断片化させずに単離し、溶液条件を制御することで染色体/クロマチンを解きほぐしてクロマチンファイバーとし、これを展開して直線状の形態を取らせる事のできるマイクロ流体デバイスを開発した。このマイクロデバイス内では、取り出した染色体/クロマチンに対する免疫蛍光染色が可能となっている。ここで開発した手法は、個々の細胞中のゲノムに対する後天的修飾について直接調べるという1細胞エピゲノム解析への応用が期待される。

報告書

(4件)
  • 2015 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2014 実績報告書
  • 2013 実績報告書
  • 研究成果

    (13件)

すべて 2016 2015 2014 2013 その他

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件) 学会発表 (12件) (うち国際学会 3件、 招待講演 5件)

  • [雑誌論文] Non-destructive handling of individual chromatin fibers isolated from single cells in a microfluidic device utilizing an optically driven microtool.2013

    • 著者名/発表者名
      Oana H, Nishikawa K, Matsuhara H, Yamamoto A, Yamamoto TG, Haraguchi T, Hiraoka Y, Washizu M.
    • 雑誌名

      Lab on a Chip.

      巻: 14 号: 4 ページ: 696-704

    • DOI

      10.1039/c3lc51111a

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] A MICROFLUIDIC PLATFORM FOR ANALYSIS OF SINGLE CHROMATIN FIBERS: TOWARD SINGLE CELL EPIGENETIC STUDY2016

    • 著者名/発表者名
      Hidehiro Oana, Hiroki Mori, Kennedy O. Okeyo and Masao Washizu
    • 学会等名
      The Eighth International Conference on Microtechnologies in Medicine and Biology
    • 発表場所
      大韓民国, ソウル
    • 年月日
      2016-04-20
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Development of a Method for Investigation of Individual Intact Chromatin Fibers Isolated from Single Cells in a Microfluidic Channel2016

    • 著者名/発表者名
      Hidehiro Oana, Hiroki Mori, Kennedy O. Okeyo and Masao Washizu
    • 学会等名
      SELECTBIO Conference, Single Molecule & Single Cell Analysis
    • 発表場所
      スペイン王国, マドリッド
    • 年月日
      2016-03-15
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] マイクロ流路を用いたクロマチン展開挙動の計測法の開発2016

    • 著者名/発表者名
      森 裕貴,オケヨ ケネディ オモンディ, 鷲津 正夫,小穴 英廣
    • 学会等名
      日本機械学会第28回バイオエンジニアリング講演会
    • 発表場所
      東京工業大学大岡山キャンパス 東京都目黒区
    • 年月日
      2016-01-10
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] Non-destructive Handling of Individual Intact Chromatin Fibers Isolated from Single Cells in a Microfluidic Device - Toward Single Cell Epigenetic Study by Microscopy2015

    • 著者名/発表者名
      Hidehiro Oana
    • 学会等名
      15th Asia-Pacific International Symposium on Microscale Separations and Analysis
    • 発表場所
      National Cheng Kung University, Tainan, Taiwan
    • 年月日
      2015-11-15
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Immunofluorescence Staining and Extending of Individual Intact Chromatin Fibers Isolated from Single Cells utilizing a Microfluidic Device2014

    • 著者名/発表者名
      Hidehiro Oana
    • 学会等名
      The 8th International Workshop on Approaches to Single-Cell Analysis
    • 発表場所
      ケニア,ナイロビ市
    • 年月日
      2014-09-11
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] マイクロ流体デバイスを用いた動物細胞のクロマチンファイバー単離・伸長手法の研究2014

    • 著者名/発表者名
      伊藤哲久・ケネディ オケヨ ・鷲津正夫 ・小穴英廣
    • 学会等名
      第29回化学とマイクロ・ナノシステム学会
    • 発表場所
      東京都文京区日本女子大学
    • 年月日
      2014-05-23
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] 相同組換えタンパクをプローブに用いた標的塩基配列の顕微鏡下リアルタイム探索2014

    • 著者名/発表者名
      東郷智之 ・ケネディ オケヨ ・小穴英廣 ・鷲津正夫
    • 学会等名
      第29回化学とマイクロ・ナノシステム学会
    • 発表場所
      東京都文京区日本女子大学
    • 年月日
      2014-05-23
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Development of an Optically Driven Microtool for Micromanipulation and Investigation of Individual Chromatin Fibers in a Microfluidic Device2014

    • 著者名/発表者名
      Hidehiro Oana
    • 学会等名
      Advances in Microfluidics & Nanofluidics 2014 (AMN2014)
    • 発表場所
      中華民国,台北市
    • 年月日
      2014-05-21
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 抗体修飾マイクロビーズを用いたゲノムDNA・蛋白質複合体の単分子操作技術の開発

    • 著者名/発表者名
      若林貴之ら
    • 学会等名
      第27回化学とマイクロ・ナノシステム研究会
    • 発表場所
      宮城県仙台市東北大学
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] 微細操作技術のシングルセル・エピゲノム解析への応用

    • 著者名/発表者名
      小穴英廣
    • 学会等名
      第2回イノバイオ研究会セミナー
    • 発表場所
      東京都文京区東京大学
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 微細加工・微細操作技術のシングルセルベース ゲノム研究への応用

    • 著者名/発表者名
      小穴英廣
    • 学会等名
      次世代マイクロ化学チップ研究会
    • 発表場所
      東京都文京区東京大学
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] NON-INVASIVE HANDLING OF CHROMATIN FIBERS ISOLATED FROM INDIVIDUAL CELLS IN A MICROCHANNEL UTILIZING AN OPTICALLY DRIVEN MICROTOOL

    • 著者名/発表者名
      小穴英廣ら
    • 学会等名
      17th International Conference on Miniaturized Systems for Chemistry and Life Sciences
    • 発表場所
      ドイツ連邦共和国フライブルク
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書

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公開日: 2013-05-21   更新日: 2019-07-29  

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