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リプログラミングに伴うゲノム不安定性の解析

研究課題

研究課題/領域番号 25290068
研究種目

基盤研究(B)

配分区分一部基金
応募区分一般
研究分野 ゲノム生物学
研究機関国立研究開発法人放射線医学総合研究所

研究代表者

荒木 良子  国立研究開発法人放射線医学総合研究所, 研究基盤センター, 室長 (40392211)

連携研究者 藤森 ゆう子 (法喜 ゆう子)  放射線医学総合研究所, 研究基盤センター・研究基盤技術部, 研究員 (50415402)
砂山 美里  放射線医学総合研究所, 研究基盤センター・研究基盤技術部, 技術員 (20625115)
杉浦 真由美  放射線医学総合研究所, 研究基盤センター・研究基盤技術部, 主任研究員 (60397841)
宇田 昌広  放射線医学総合研究所, 研究基盤センター・研究基盤技術部, 技術員 (30625893)
研究期間 (年度) 2013-04-01 – 2016-03-31
研究課題ステータス 完了 (2015年度)
配分額 *注記
18,330千円 (直接経費: 14,100千円、間接経費: 4,230千円)
2015年度: 4,810千円 (直接経費: 3,700千円、間接経費: 1,110千円)
2014年度: 5,590千円 (直接経費: 4,300千円、間接経費: 1,290千円)
2013年度: 7,930千円 (直接経費: 6,100千円、間接経費: 1,830千円)
キーワードリプログラミング / iPS細胞 / 点突然変異 / ES細胞
研究成果の概要

iPS 細胞のゲノム異常は、免疫原性および腫瘍原性に関わる問題である。我々は、iPS細胞におけるde novo点突然変異を高効率に検出できる解析システムを構築し、全ゲノム内の変異の量、質、分布、そして、それらの発生時期の同定を行った。iPS細胞ではES細胞の10倍以上の点突然変異が検出され、また、iPS細胞の変異はtransversionが多いという特徴を明らかにした。更に、iPS細胞中のアリル頻度が25%以下の変異、つまりiPS細胞への転換の極初期に発生した可能性の極めて高い変異を相当数同定した。これらの結果は、リプログラミングにゲノム不安定性が伴う可能性を示唆していた。

報告書

(4件)
  • 2015 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2014 実績報告書
  • 2013 実績報告書
  • 研究成果

    (15件)

すべて 2015 2014 2013 その他

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 2件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (10件) 図書 (1件) 備考 (2件)

  • [雑誌論文] Induced pluripotent stem cell generation-associated point mutations2015

    • 著者名/発表者名
      Araki R, Sugiura M, Hoki Y, Sunayama M, Nakamura M, Kasama Y, Abe M
    • 雑誌名

      Inflammation and Regeneration

      巻: 35 ページ: 226-232

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Induced pluripotent stem cell generation-associated point mutations arise during the initial stages of the conversion of these cells2014

    • 著者名/発表者名
      Mayumi Sugiura, Yasuji Kasama, Ryoko Araki, Yuko Hoki, Misato Sunayama, Masahiro Uda, Miki Nakamura, Shunsuke Ando and Masumi Abe
    • 雑誌名

      Stem Cell Reports

      巻: 2(1) 号: 1 ページ: 52-63

    • DOI

      10.1016/j.stemcr.2013.11.006

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] A comparison of point mutations between iPS and ntES cell with whole genome sequencing2015

    • 著者名/発表者名
      Yuko Fujimori-Hoki, Ryoko Araki, Misato Sunayama, Eiji Mizutani, Sayaka Wakayama, Hiroaki Nagatomo, Yasuji Kasama, Miki Nakamura, Teruhiko Wakayama, Masumi Abe
    • 学会等名
      第38回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      神戸ポートアイランド
    • 年月日
      2015-12-01
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] iPS化における点突然変異生成タイミングの解析2015

    • 著者名/発表者名
      砂山美里、安倍真澄、藤森(法喜)ゆう子、笠間康次、中村美樹、荒木良子
    • 学会等名
      第38回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      神戸ポートアイランド
    • 年月日
      2015-12-01
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] iPS細胞クローン内細胞にみられるポイントミューテーションの不均一性2014

    • 著者名/発表者名
      砂山 美里,荒木良子,藤森 ゆう子, 笠間康次, 宇田昌広, 中村美樹, 安倍真澄.
    • 学会等名
      第37回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      横浜
    • 年月日
      2014-11-25 – 2014-11-27
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] iPS樹立初期過程には多くのpoint mutationが生じる2014

    • 著者名/発表者名
      藤森 ゆう子, 杉浦真由美, 笠間康次, 砂山美里, 宇田昌広, 中村美樹, 荒木良子, 安倍真澄.
    • 学会等名
      第37回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      横浜
    • 年月日
      2014-11-25 – 2014-11-27
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Lineage conversion step in iPS cell generation involves highly mutagenic process.2014

    • 著者名/発表者名
      Ryoko Araki, Yuko Fujimori, Misato Sunayama, Yasuji Kasama, Masahiro Uda, Miki Nakamura, Masumi Abe.
    • 学会等名
      第12回国際幹細胞学会(ISSCR)年会
    • 発表場所
      バンクーバー、カナダ
    • 年月日
      2014-06-18 – 2014-06-21
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] ES CELLS VS. IPS CELLS: LINEAGE CONVERSION-ASSOCIATED POINT MUTATIONS.2014

    • 著者名/発表者名
      Yuko Fujimori, Mayumi Sugiura, Yasuji Kasama, Misato Sunayama, Masahiro Uda, Miki Nakamura, Shunsuke Ando, Ryoko Araki, Masumi Abe.
    • 学会等名
      第12回国際幹細胞学会(ISSCR)年会
    • 発表場所
      バンクーバー、カナダ
    • 年月日
      2014-06-18 – 2014-06-21
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] iPS cells generation-associated point mutations2013

    • 著者名/発表者名
      Ryoko Araki, Mayumi Sugiura, Yasuji Kasama, Misato Sunayama, Masahiro Uda, Miki Nakamura, Shunsuke Ando, Yuko Hoki, Masumi Abe
    • 学会等名
      International Society for Stem Cell Research-ISSCR 11th Annual Meeting
    • 発表場所
      Boston, USA
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] POINT MUTATIONS IN ES CELLS2013

    • 著者名/発表者名
      Yuko Hoki, Mayumi Sugiura, Yasuji Kasama, Misato Sunayama, Masahiro Uda, Miki Nakamura, Shunsuke Ando, Ryoko Araki, Masumi Abe
    • 学会等名
      Society for Stem Cell Research-ISSCR 11th Annual Meeting
    • 発表場所
      Boston, USA
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] iPS cells generation-associated point mutations2013

    • 著者名/発表者名
      荒木良子、杉浦真由美、笠間康次、砂山美里、宇田昌広、安藤俊輔、中村美樹、法喜ゆう子、安倍真澄
    • 学会等名
      第36回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      神戸
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] Point mutations in ES cells2013

    • 著者名/発表者名
      砂山美里、杉浦真由美、法喜ゆう子、笠間康次、宇田昌広、中村美樹、安藤俊輔、荒木良子、安倍真澄
    • 学会等名
      第36回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      神戸
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [図書] 日本臨床 増刊号 再生医療 「iPS化に伴う点突然変異」2015

    • 著者名/発表者名
      荒木良子、杉浦真由美、笠間康次、安倍真澄
    • 総ページ数
      7
    • 出版者
      日本臨床社
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [備考] 幹細胞研究チーム

    • URL

      http://www.nirs.go.jp/rd/rrm/index.html

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [備考] iPS細胞の点突然変異がiPS細胞への転換中に起こることをマウスの実験により発見

    • URL

      http://www.nirs.go.jp/information/press/2014/01_03.shtml

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書

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公開日: 2013-05-21   更新日: 2019-07-29  

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