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遺伝子修復治療を目指した化学的RNA Editing法の確立

研究課題

研究課題/領域番号 25290072
研究種目

基盤研究(B)

配分区分一部基金
応募区分一般
研究分野 ゲノム医科学
研究機関北陸先端科学技術大学院大学

研究代表者

塚原 俊文  北陸先端科学技術大学院大学, 先端科学技術研究科, 教授 (60207339)

研究分担者 鈴木 仁  北陸先端科学技術大学院大学, マテリアルサイエンス研究科, 助教 (00447690)
藤本 健造  北陸先端科学技術大学院大学, マテリアルサイエンス研究科, 教授 (90293894)
連携研究者 武田 伸一  国立研究開発法人国立精神・神経医療研究センター, 神経研究所, 所長 (90171644)
研究期間 (年度) 2013-04-01 – 2017-03-31
研究課題ステータス 完了 (2016年度)
配分額 *注記
18,460千円 (直接経費: 14,200千円、間接経費: 4,260千円)
2015年度: 5,200千円 (直接経費: 4,000千円、間接経費: 1,200千円)
2014年度: 5,200千円 (直接経費: 4,000千円、間接経費: 1,200千円)
2013年度: 8,060千円 (直接経費: 6,200千円、間接経費: 1,860千円)
キーワード疾患治療 / 点変異 / RNA editing / 脱アミノ化 / 蛍光タンパク質 / 遺伝コード修復 / RFLP / 恒常的発現細胞 / 恒常的発言細胞株 / 恒常的発現細胞株 / RNA Editing / 恒常発現細胞株
研究成果の概要

BFP-mRNAに対して脱アミノ化誘起用ODNを用いて光化学的な部位特異的脱アミノ化処理を行った。光化学的RNA editingは、RT-PCR-RFLPとin vitro翻訳したタンパク質の蛍光を確認した。また、光化学的RNA editingした当該mRNAの全長をシークエンスし、他の箇所に変異が生じていないことも確認した。効率的な脱アミノ化を誘起するODNデザインについても検討し、相補的配列長が14塩基で、ヘアピン長が9塩基のODNが12.4%と最も高い光化学的RNA editing効率を示した。この結果は光化学的RNA editing法が疾患治療法として適用可能であることを示唆している。

報告書

(5件)
  • 2016 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2015 実績報告書
  • 2014 実績報告書
  • 2013 実績報告書
  • 研究成果

    (17件)

すべて 2017 2016 2015 2014 2013

すべて 雑誌論文 (12件) (うち国際共著 2件、 査読あり 12件、 オープンアクセス 11件、 謝辞記載あり 11件) 学会発表 (3件) (うち国際学会 1件) 図書 (1件) 産業財産権 (1件)

  • [雑誌論文] Neuron-specific splicing2017

    • 著者名/発表者名
      Nor Hakimah Ab Hakim, Burhanuddin Yeop Majlis, Hitoshi Suzuki, Toshifumi Tsukahara,
    • 雑誌名

      BioScience Trends

      巻: 11 号: 1 ページ: 16-22

    • DOI

      10.5582/bst.2016.01169

    • NAID

      130005466226

    • ISSN
      1881-7815, 1881-7823
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] C-to-U Editing and Site-Directed RNA Editing for Correction of Genetic Mutations.2017

    • 著者名/発表者名
      Vu Thi Luyen and Toshifumi Tsukahara
    • 雑誌名

      Bioscience Trends, inpress.

      巻: 11

    • NAID

      130005853626

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Chemical RNA Editing for Genetic Restoration: The Relationship between the Structure and Deamination Efficiency of Carboxyvinyldeoxyuridine Oligodeoxynucleotides2016

    • 著者名/発表者名
      Vu Thi Luyen, Nguyen Thi Kim Thanh, Md Thoufic Anam Azad, Hitoshi Suzuki, and Toshifumi Tsukahara
    • 雑誌名

      Chemical Biology & Drug Design

      巻: 87 号: 4 ページ: 583-593

    • DOI

      10.1111/cbdd.12693

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書 2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Endogenous Multiple Exon Skipping and Back-Splicing at the DMD Mutation Hotspot2016

    • 著者名/発表者名
      Hitoshi Suzuki, Yoshitsugu Aoki, Toshiki Kameyama, Takashi Saito, Satoru Masuda, Jun Tanihata, Tetsuya Nagata, Akila Mayeda, Shin’ichi Takeda, Toshifumi Tsukahara
    • 雑誌名

      Int. J. Mol. Sci.

      巻: 17 号: 10 ページ: 1722-1722

    • DOI

      10.3390/ijms17101722

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Expression Analysis of Fox-2 Alternative Isoforms during Neuronal Differentiation2016

    • 著者名/発表者名
      Nor Hakimah Ab Hakim, Burhanuddin Yeop Majlis, Hitoshi Suzuki and Toshifumi Tsukahara
    • 雑誌名

      Int’l Journal of Advances in Chemical Engg., & Biological Sciences

      巻: 3 号: 1 ページ: 102-104

    • DOI

      10.15242/ijacebs.iae0516407

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Changing Blue Fluorescent Protein to Green Fluorescent Protein Using Chemical RNA Editing as a Novel Strategy in Genetic Restoration2015

    • 著者名/発表者名
      Luyen T. Vu, Thanh T. K. Nguyen, Shafiul Alam, Takashi Sakamoto, Kenzo Fujimoto, Hitoshi Suzuki and Toshifumi Tsukahara
    • 雑誌名

      Chemical Biology & Drug Design

      巻: 86 号: 5 ページ: 1242-1252

    • DOI

      10.1111/cbdd.12592

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Critical Effect of Base Pairing of Target Pyrimidine on the Inter-strand Photo-cross-linking of DNA via 3-Cyanovinylcarbazole Nucleoside2015

    • 著者名/発表者名
      Takashi Sakamoto, Minako Ooe, Kenzo Fujimoto
    • 雑誌名

      Bioconjugate Chemistry

      巻: 26 号: 8 ページ: 1475-1478

    • DOI

      10.1021/acs.bioconjchem.5b00352

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Photo-cross-linking using trifluorothymidine and 3-cyanovinylcarbazole induced large shifted 19F MR signal2015

    • 著者名/発表者名
      Shigetaka Nakamura, Kenzo Fujimoto
    • 雑誌名

      Chemical Communications

      巻: 51 号: 59 ページ: 11765-11768

    • DOI

      10.1039/c5cc02972d

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Computational extraction of a neural molecular network through alternative splicing2014

    • 著者名/発表者名
      Alam S, Phan HT, Okazaki M, Takagi M, Kawahara K, Tsukahara T, Suzuki H
    • 雑誌名

      BMC Res. Notes

      巻: 7 号: 1 ページ: 934-934

    • DOI

      10.1186/1756-0500-7-934

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Alternative splicing regulation of APP exon 7 by RBFox proteins2014

    • 著者名/発表者名
      Alam S, Suzuki H, Tsukahara T
    • 雑誌名

      Neurochem. Int.

      巻: 78 ページ: 7-17

    • DOI

      10.1016/j.neuint.2014.08.001

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] A View of Pre-mRNA Splicing from RNase R Resistant RNAs2014

    • 著者名/発表者名
      Suzuki H, Tsukahara T
    • 雑誌名

      Int. J. Mol. Sci.

      巻: 15 号: 6 ページ: 9331-9342

    • DOI

      10.3390/ijms15069331

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Nested introns in an intron : Evidence of multi-step splicing in a large intron of the human dystrophin pre-mRNA.2013

    • 著者名/発表者名
      Suzuki, H., Kameyama, T., Ohe, K. Tsukahara, T., Mayeda, A.
    • 雑誌名

      FEBS Letters

      巻: 587 号: 6 ページ: 555-561

    • DOI

      10.1016/j.febslet.2013.01.057

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] Study of adenosine deaminase acting on RNA (ADAR) isoforms towards genetic code restoration2016

    • 著者名/発表者名
      Md Thoufic Anam Azad, Hitoshi Suzuki, Toshifumi Tsukahara
    • 学会等名
      アメリカ細胞生物学会年会
    • 発表場所
      サンフランシスコ(アメリカ合衆国)
    • 年月日
      2016-12-03
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Site-directed RNA editing approach by MS2 and adenosine deaminase acting on RNA (ADAR)2016

    • 著者名/発表者名
      Md Thoufic Anam Azad, Hitoshi Suzuki, Toshifumi Tsukahara
    • 学会等名
      日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(神奈川県横浜市)
    • 年月日
      2016-11-30
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] Possibility of Genetic Code Restoration by Chemical RNA Editing2013

    • 著者名/発表者名
      Toshifumi Tsukahara
    • 学会等名
      BIT's Biopharmaceutical Summit-2013
    • 発表場所
      Frankfurt, Germany
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [図書] New Developments on Alternative Splicing Research2013

    • 著者名/発表者名
      Hitoshi Suzuki and Toshifumi Tsukahara
    • 総ページ数
      181
    • 出版者
      Nova Science Publishers
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [産業財産権] 塩基置換手段をスクリーニングする方法2015

    • 発明者名
      塚原俊文、藤本健造
    • 権利者名
      北陸先端科学技術大学院大学
    • 産業財産権種類
      特許
    • 産業財産権番号
      2015-085414
    • 出願年月日
      2015-04-17
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書

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公開日: 2013-05-21   更新日: 2019-07-29  

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