ヒストンシャペロンによるクロマチンのダイナミック制御

• 研究課題/領域番号: 25291001
• 研究種目: 基盤研究(B)
• 配分区分: 一部基金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 分子生物学
• 研究機関: 筑波大学
• 研究代表者: 永田 恭介 筑波大学, 学長 (40180492)
• 研究分担者: 奥脇 暢 筑波大学, グローバル教育院, 准教授 (50322699)
• 研究期間 (年度): 2013-04-01 – 2016-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2015年度)
• 配分額: 18,070千円 (直接経費: 13,900千円、間接経費: 4,170千円); 2015年度: 5,200千円 (直接経費: 4,000千円、間接経費: 1,200千円); 2014年度: 6,110千円 (直接経費: 4,700千円、間接経費: 1,410千円); 2013年度: 6,760千円 (直接経費: 5,200千円、間接経費: 1,560千円)
• キーワード: 遺伝子 / ウイルス / ゲノム / 発生・分化 / クロマチン

研究成果の概要

ヒストンシャペロンTAF-Iの生理機能を明らかにすることを目的とした。TAF-I KOマウスは胎生12.5日目までに重度の貧血と未熟な血管形成を示して致死となった。TAF-I KO ES細胞は野生型に比べて細胞増殖が著しく低下し、初期胚を模した胚様体の形成が遅延する様子を示した。培養細胞を用いた解析から、TAF-IはヒストンH1を介してインターフェロン誘導性遺伝子の転写制御に関わることが明らかとなった。生化学的解析から、TAF-Iの分子内相互作用によるヒストンH1シャペロン活性制御機構を明らかにした。TAF-Iをプローブとした感染細胞におけるアデノウイルスゲノム動態解析法を確立した。

研究成果

• [雑誌論文] Imaging analysis of nuclear antiviral factors through direct detection of incoming adenovirus genome complexes (2016)
  • 著者名/発表者名: T. Komatsu, H. Will, K. Nagata, H. Wodrich
  • 雑誌名: Biochem. Biophys. Res. Commun. 巻: 473 号: 1 ページ: 200-205
  • DOI: 10.1016/j.bbrc.2016.03.078
  • 査読あり / 国際共著 / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] An Adenovirus DNA Replication Factor, but Not Incoming Genome Complexes, Targets PML Nuclear Bodies (2015)
  • 著者名/発表者名: Komatsu T, Nagata K, Wodrich H.
  • 雑誌名: Journal of Virology 巻: 90 号: 3 ページ: 1657-1667
  • DOI: 10.1128/jvi.02545-15
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] A Method for Visualization of Incoming Adenovirus Chromatin Complexes in Fixed and Living Cells (2015)
  • 著者名/発表者名: Komatsu T, Dacheux D, Kreppel F, Nagata K, Wodrich H.
  • 雑誌名: PLoS One 巻: 10 号: 9 ページ: e0137102-e0137102
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0137102
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Glucocorticoids facilitate the transcription from the human cytomegalovirus major immediate early promoter in glucocorticoid receptor- and nuclear factor-I-like protein-dependent manner. (2015)
  • 著者名/発表者名: Inoue-Toyoda M, Kato K, Nagata K, Yoshikawa H.
  • 雑誌名: Biochem Biophys Res Commun. 巻: 476 号: 1 ページ: 9-14
  • DOI: 10.1016/j.bbrc.2015.01.091
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Silencing of IFN-stimulated gene transcription is regulated by histone H1 and its chaperone TAF-I (2014)
  • 著者名/発表者名: Kadota S and Nagata K
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res 巻: 42 号: 12 ページ: 7642-7653
  • DOI: 10.1093/nar/gku485
  • NAID: 120007136640
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Reconstitution of human rRNA gene transcription in mouse cells by complete SL1 complex. (2014)
  • 著者名/発表者名: Murano K, Okuwaki M, Momose F, Kumakura M, Ueshima S, Newbold RF, Nagata K.
  • 雑誌名: J Cell Sci 巻: 127 ページ: 3309-3319
  • DOI: 10.1242/jcs.146787
  • 査読あり
• [雑誌論文] Long Noncoding RNA NEAT1-Dependent SFPQ Relocation from Promoter Region to Paraspeckle Mediates IL8 Expression upon Immune Stimuli (2014)
  • 著者名/発表者名: Imamura K, Imamachi N, Akizuki G, Kumakura M, Kawaguchi A, Nagata K, Kato A, Kawaguchi Y, Sato H, Yoneda M, Kai C, Yada T, Suzuki Y, Yamada T, Ozawa T, Kaneki K, Inoue T, Kobayashi M, Kodama T, Wada Y, Sekimizu K and Akimitsu N.
  • 雑誌名: Molecular cell 巻: 53 号: 3 ページ: 393-406
  • DOI: 10.1016/j.molcel.2014.01.009
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Involvement of the N-terminal portion of influenza virus RNA polymerase subunit PB1 in nucleotide recognition. (2014)
  • 著者名/発表者名: Binh NT, Wakai C, Kawaguchi A, Nagata K.
  • 雑誌名: Biochemical and Biophysical Research Communications 巻: 443 号: 3 ページ: 975-979
  • DOI: 10.1016/j.bbrc.2013.12.071
  • NAID: 120007130532
  • 査読あり
• [雑誌論文] Upstream binding factor-dependent and pre-rRNA transcription-independent association of pre-rRNA processing factors with rRNA gene. (2014)
  • 著者名/発表者名: Ueshima, S., Nagata, K., and Okuwaki, M.
  • 雑誌名: Biochem Biophys Res Commun 巻: 443 号: 1 ページ: 22-27
  • DOI: 10.1016/j.bbrc.2013.11.039
  • 査読あり
• [雑誌論文] Intrinsically disordered regions of nucleophosmin/B23 regulate its RNA binding activity through their inter- and intra-molecular association. (2014)
  • 著者名/発表者名: Hisaoka, M., Nagata, K., and Okuwaki, M.
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res. 巻: 42 号: 2 ページ: 1180-1195
  • DOI: 10.1093/nar/gkt897
  • NAID: 120007130533
  • 査読あり
• [雑誌論文] DNA replication-dependent binding of CTCF plays a critical role in adenovirus genome functions. (2013)
  • 著者名/発表者名: Komatsu T, Sekiya T, Nagata K.
  • 雑誌名: Scientific Report 巻: 3 号: 1 ページ: 2187-2187
  • DOI: 10.1038/srep02187
  • NAID: 120007136881
  • 査読あり
• [雑誌論文] The N-terminal region of influenza virus polymerase PB1 adjacent to the PA binding site is involved in replication but not transcription of the viral genome (2013)
  • 著者名/発表者名: Binh NT, Wakai C, Kawaguchi A, Nagata K
  • 雑誌名: Front. Microbiol 巻: 4 ページ: 398-398
  • DOI: 10.3389/fmicb.2013.00398
  • NAID: 120007130538
  • 査読あり
• [雑誌論文] Anti-influenza virus activity of Ginkgo biloba leaf extracts. (2013)
  • 著者名/発表者名: Haruyama T, Nagata K.
  • 雑誌名: Journal of Natural Medicine 巻: 67(3) 号: 3 ページ: 636-642
  • DOI: 10.1007/s11418-012-0725-0
  • 査読あり
• [雑誌論文] Identification of a novel and unique transcription factor in the intraerythrocytic stage of Plasmodium falciparum. (2013)
  • 著者名/発表者名: Komaki-Yasuda, K., Okuwaki, M., Nagata, K., Kawazu, S., and Kano, S.
  • 雑誌名: PLoS One. 巻: 8 号: 9 ページ: e74701-e74701
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0074701
  • 査読あり
• [雑誌論文] Antagonistic activities of the immunomodulator and PP2A-activating drug FTY720 (Fingolimod, Gilenya) in Jak2-driven hematologic malignancies. (2013)
  • 著者名/発表者名: Oaks JJ, Santhanam R, Walker CJ, Roof S, Harb JG, Ferenchak G, Eisfeld AK, Van Brocklyn JR, Briesewitz R, Saddoughi SA, Nagata K, Bittman R, Caligiuri MA, Abdel-Wahab O, Levine R, Arlinghaus RB, Quintas-Cardama A, Goldman JM, Apperley J, Reid A, Milojkovic D, Ziolo MT, Marcucci G, Ogretmen B, Neviani P, Perrotti D.
  • 雑誌名: Blood 巻: 122(11) 号: 11 ページ: 1923-1934
  • DOI: 10.1182/blood-2013-03-492181
  • 査読あり
• [雑誌論文] Crystallization and preliminary crystallographic analysis of an Escherichia coli-selected mutant of the nuclease domain of the metallonuclease colicin E7. (2013)
  • 著者名/発表者名: 10) Czene A, Tóth E, Gyurcsik B, Otten H, Poulsen JC, Lo Leggio L, Larsen S, Christensen HE, Nagata K.
  • 雑誌名: Acta Crystallography Section F Structural Biology and Crystalization Communications 巻: 69 号: 5 ページ: 551-554
  • DOI: 10.1107/s1744309113008233
  • 査読あり
• [雑誌論文] The role of the N-terminal loop in the function of the colicin E7 nuclease domain (2013)
  • 著者名/発表者名: Czene A, Németh E, Zóka IG, Jakab-Simon NI, Körtvélyesi T, Nagata K, Christensen HE, Gyurcsik B
  • 雑誌名: J. Biol. Inorg. Chem 巻: 18 号: 3 ページ: 309-321
  • DOI: 10.1007/s00775-013-0975-7
  • 査読あり
• [学会発表] ヒストンH1シャペロンTAF-Iの分子内相互作用による活性制御機構 (2015)
  • 著者名/発表者名: 鍛谷香織、加藤広介、永田恭介
  • 学会等名: 第38回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 神戸国際会議場（神戸）
  • 年月日: 2015-12-01
• [学会発表] M期におけるCTCFのDNA結合領域 (2014)
  • 著者名/発表者名: 関屋健史、村野健作、永田恭介
  • 学会等名: 第37回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2014-11-25 – 2014-11-27
• [学会発表] ヒト細胞内におけるマウスrRNA遺伝子転写の再構成 (2014)
  • 著者名/発表者名: 村野健作、永田恭介
  • 学会等名: 第37回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2014-11-25 – 2014-11-27
• [学会発表] Aberrant nuclear-cytoplasmic transport by nup214-fusion gene products found in leukemia (2014)
  • 著者名/発表者名: Saito Shoko, Cigdem Sadik, Kyosuke Nagata
  • 学会等名: Cold Spring Harbor Laboratory meeting, 2014 Nuclear Organization and Function
  • 発表場所: ニューヨーク
  • 年月日: 2014-08-19 – 2014-08-23
• [学会発表] ヒストンシャペロンnucleophosmin/NPM1/B23のRNA結合制御機構 (2014)
  • 著者名/発表者名: 久岡美晴、永田恭介、奥脇 暢
  • 学会等名: 平成26年度日本生化学会関東支部例会 ～タンパク質の機能～
  • 発表場所: 水戸
  • 年月日: 2014-06-14
• [学会発表] リンカーヒストンH1シャペロンTAF-IによるIFN誘導性遺伝子の転写抑制制御機構 (2014)
  • 著者名/発表者名: 門田伸一、永田恭介
  • 学会等名: 冬の若手ワークショップ2014
  • 発表場所: 舌切りの宿 雀磯部ガーデン（群馬県安中市）
• [学会発表] Involvement of histone H1 ubiquitination in post-replicative chromatin maintenance (2014)
  • 著者名/発表者名: Kato K, Nagata K
  • 学会等名: The 13th Asian Conference on Transcription
  • 発表場所: メルボルン大学（メルボルン市・オーストラリア）
• [学会発表] Overcoming the species-specific barrier in the rRNA gene transcription by reconstitution of complete SL1 complex (2014)
  • 著者名/発表者名: Murano K, Nagata K
  • 学会等名: The 13th Asian Conference on Transcription
  • 発表場所: メルボルン大学（メルボルン市・オーストラリア）
• [学会発表] インフルエンザウイルスゲノムの機能発現機構と創薬展開 (2013)
  • 著者名/発表者名: 永田恭介
  • 学会等名: 第66回日本細菌学会九州支部総会・第50回日本ウイルス学会九州支部総会
  • 発表場所: 長崎市
• [学会発表] Host factor-dependent RNA replication of the influenza virus genome (2013)
  • 著者名/発表者名: 永田恭介
  • 学会等名: The 12th Awaji International Forum on Infection and Immunity
  • 発表場所: 淡路夢舞台国際会議場（兵庫県淡路市）
• [学会発表] Tamiflu resistant cell-to-cell transmission of cell associated influenza virus (2013)
  • 著者名/発表者名: 森幸太郎、春山貴弘、永田恭介
  • 学会等名: The 12th Awaji International Forum on Infection and Immunity
  • 発表場所: 淡路夢舞台国際会議場（兵庫県淡路市）
• [学会発表] Fine tuning of the allosteric activation in the nuclease domain of colicin E7 (2013)
  • 著者名/発表者名: Bela Gyurcsik, Eszter Németh, Peter W. Thulstrup, Milan Kožīšek, Hans E.M. Christensen, Kyosuke Nagata
  • 学会等名: Leading Graduate Schools International Conference (Tsukuba Global Science Week)
  • 発表場所: つくば国際会議場（茨城県つくば市）
• [学会発表] TAF-I regulates the transcription of interferon-stimulated genes through its histone chaperone activity (2013)
  • 著者名/発表者名: Kadota S, Nagata K
  • 学会等名: Leading Graduate Schools International Conference (Tsukuba Global Science Week)
  • 発表場所: つくば国際会議場（茨城県つくば市）
• [学会発表] Functions of RNA polymerase I transcription factor UBF in nucleolar formation (2013)
  • 著者名/発表者名: Ueshima S, Nagata K, Okuwaki M
  • 学会等名: Leading Graduate Schools International Conference (Tsukuba Global Science Week)
  • 発表場所: 国際会議場（茨城県つくば市）
• [学会発表] DNA-binding Activity of CTCF, an Insulator Protein Regulated by Phosphorylation in Mitosis (2013)
  • 著者名/発表者名: Sekiya T, Murano K, Nagata K
  • 学会等名: Leading Graduate Schools International Conference (Tsukuba Global Science Week)
  • 発表場所: 国際会議場（茨城県つくば市）
• [学会発表] EZH2, component of polycomb complex, regulates nuclear export of the influenza virus M1 and the viral genome (2013)
  • 著者名/発表者名: Asaka MN, Kawaguchi A, Nagata K
  • 学会等名: Leading Graduate Schools International Conference (Tsukuba Global Science Week)
  • 発表場所: 国際会議場（茨城県つくば市）
• [学会発表] In cellulo analysis of parvovirus-mediated changes of nuclear envelope integrity by real time microscopy (2013)
  • 著者名/発表者名: Kenza Snoussi, Kawaguchi A, Kato K, Harald Wodrich, Nagata K, Michael Kann
  • 学会等名: Leading Graduate Schools International Conference (Tsukuba Global Science Week)
  • 発表場所: 国際会議場（茨城県つくば市）
• [学会発表] インフルエンザポリメラーゼ遺伝子間の適合性 (2013)
  • 著者名/発表者名: 原田芳美、川口敦史、永田恭介
  • 学会等名: 第61回日本ウイルス学会学術集会
  • 発表場所: 神戸国際会議場（兵庫県神戸市）
• [学会発表] インフルエンザウイルスゲノムの細胞内輸送機構におけるNS1の新規機能 (2013)
  • 著者名/発表者名: 長利卓、川口敦史、永田恭介
  • 学会等名: 第61回日本ウイルス学会学術集会
  • 発表場所: 神戸国際会議場（兵庫県神戸市）
• [学会発表] インフルエンザウイルス増殖にかかわる細胞骨格関連因子 (2013)
  • 著者名/発表者名: 熊倉充子、永田恭介
  • 学会等名: 第61回日本ウイルス学会学術集会
  • 発表場所: 神戸国際会議場（兵庫県神戸市）
• [学会発表] インフルエンザウイルスにおけるNA非依存的cell-to-cell感染機構 (2013)
  • 著者名/発表者名: 森幸太郎、春山貴弘、永田恭介
  • 学会等名: 第61回日本ウイルス学会学術集会
  • 発表場所: 神戸国際会議場（兵庫県神戸市）
• [学会発表] インフルエンザウイルス感染に応答した宿主因子YB-1による中心体の機能制御 (2013)
  • 著者名/発表者名: 川口敦史、永田恭介
  • 学会等名: 第61回日本ウイルス学会学術集会
  • 発表場所: 神戸国際会議場（兵庫県神戸市）
• [学会発表] ユビキチン化によるヒストンH1の機能制御 (2013)
  • 著者名/発表者名: 加藤広介、永田恭介
  • 学会等名: 第31回染色体ワークショップ・第12回核ダイナミクス研究会
  • 発表場所: ホテルおかだ（神奈川県箱根町）
• [学会発表] TAF-Iによるヒストンシャペロン活性を介したインターフェロン誘導性遺伝子転写制御 (2013)
  • 著者名/発表者名: 門田伸一、永田恭介
  • 学会等名: 第31回染色体ワークショップ・第12回核ダイナミクス研究会
  • 発表場所: ホテルおかだ（神奈川県箱根町）
• [学会発表] 核小体構造維持におけるNucleophosmin/B23の機能 (2013)
  • 著者名/発表者名: 奥脇暢
  • 学会等名: 第31回染色体ワークショップ・第12回核ダイナミクス研究会
  • 発表場所: ホテルおかだ（神奈川県箱根町）
• [学会発表] ポリコーム複合体因子であるEZH2はインフルエンザウイルスタンパク質M1およびインフルエンザウイルスゲノムの核外輸送を制御する (2013)
  • 著者名/発表者名: 浅賀正充、川口敦史、永田恭介
  • 学会等名: 第36回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド（兵庫県神戸市
• [学会発表] M期リン酸化によるCTCFのDNA結合活性制御の解析 (2013)
  • 著者名/発表者名: 関屋健史、村野健作、永田恭介
  • 学会等名: 第36回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド（兵庫県神戸市
• [学会発表] ヒストンシャペロンによるリンカーンヒストンH1バリアントの機能制御機構 (2013)
  • 著者名/発表者名: 阿部真弓、久岡美晴、永田恭介
  • 学会等名: 第36回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド（兵庫県神戸市
• [学会発表] rRNA遺伝子の種特異的転写機構の解析 (2013)
  • 著者名/発表者名: 村野健作、永田恭介
  • 学会等名: 第36回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド（兵庫県神戸市
• [学会発表] Analysis of RNAi-mediated heterochromatinization during meiosis in C. elegans (2013)
  • 著者名/発表者名: Tabara H, Mitani S, Nagata K
  • 学会等名: 第36回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド（兵庫県神戸市
• [学会発表] Effect of nucleoporin-related fusion proteins found in leukemia on NF-κB pathway
  • 著者名/発表者名: Cigdem Sadik、 齋藤祥子、 永田恭介
  • 学会等名: 平成25年度日本生化学会関東支部例会
  • 発表場所: 山梨大（山梨県甲府市）
• [学会発表] ウイルスポリメラーゼによって規定されるトリインフルエンザウイルスの哺乳類細胞への適応機構
  • 著者名/発表者名: 原田芳美、 川口敦史、 永田恭介
  • 学会等名: 平成25年度日本生化学会関東支部例会
  • 発表場所: 山梨大（山梨県甲府市）
• [学会発表] インフルエンザウイルスゲノムの複製機構に基盤をおいた創薬
  • 著者名/発表者名: 永田恭介
  • 学会等名: 第42回ヒューマンサイエンス総合研究セミナー
  • 発表場所: 東京