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薬剤耐性緑膿菌の2つの生体膜を貫く異物排出タンパク質複合体システムの構造基盤

研究課題

研究課題/領域番号 25291014
研究種目

基盤研究(B)

配分区分一部基金
応募区分一般
研究分野 構造生物化学
研究機関大阪大学

研究代表者

山下 栄樹  大阪大学, たんぱく質研究所, 助教 (00294132)

研究分担者 中川 敦史  大阪大学, 蛋白質研究所, 教授 (20188890)
研究協力者 米原 涼  大阪大学, 蛋白質研究所, 研究員
池田 悦子  大阪大学, 蛋白質研究所, 博士研究員
堤 研太  大阪大学, 蛋白質研究所, 博士前期課程
比嘉 悠貴  大阪大学, 蛋白質研究所, 博士前期課程
住田 一真  大阪大学, 蛋白質研究所, 博士前期課程
研究期間 (年度) 2013-04-01 – 2016-03-31
研究課題ステータス 完了 (2015年度)
配分額 *注記
18,330千円 (直接経費: 14,100千円、間接経費: 4,230千円)
2015年度: 3,640千円 (直接経費: 2,800千円、間接経費: 840千円)
2014年度: 3,770千円 (直接経費: 2,900千円、間接経費: 870千円)
2013年度: 10,920千円 (直接経費: 8,400千円、間接経費: 2,520千円)
キーワードX線結晶構造解析 / 膜タンパク質複合体の物質輸送 / 外膜チャンネルの構造
研究成果の概要

日和見細菌である緑膿菌が多剤耐性化する主な原因として、菌体内に進入した抗生物質を排出する異物排出タンパク質複合体が関わっている。異物排出タンパク質複合体は、内膜に存在するトランスポーター、膜間に存在するアダプタータンパク質、外膜に存在する外膜チャンネルタンパク質の3種類からなり、2つの生体膜を貫く巨大な膜タンパク質複合体である。本研究では、異物排出タンパク質複合体の試料調製を行い、複合体構成蛋白質の化学量比を決定し、電子顕微鏡3次元再構成法により構造解析に成功した。また、緑膿菌の薬剤排出に関わる主な外膜チャンネルタンパク質の構造解析に成功し、外膜チャンネルの開閉機構について明らかにした。

報告書

(4件)
  • 2015 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2014 実績報告書
  • 2013 実績報告書
  • 研究成果

    (20件)

すべて 2016 2015 2014 2013 その他

すべて 雑誌論文 (6件) (うち査読あり 6件、 謝辞記載あり 1件) 学会発表 (14件) (うち国際学会 4件、 招待講演 8件)

  • [雑誌論文] Crystal structures of OprN and OprJ, outer membrane factors of multidrug tripartite efflux pumps of Pseudomonas aeruginosa.2016

    • 著者名/発表者名
      Yonehara R, Yamashita E, Nakagawa A.
    • 雑誌名

      Proteins.

      巻: e-pub 号: 6 ページ: 759-769

    • DOI

      10.1002/prot.25022

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Traffic within the Cytochrome b6f Lipoprotein Complex: Gating of the Quinone Portal.2014

    • 著者名/発表者名
      Hasan S. S., Proctor E. A., Yamashita E., Dokholyan N. V., Cramer W. A.
    • 雑誌名

      Biophys J.

      巻: 107 号: 7 ページ: 1620-628

    • DOI

      10.1016/j.bpj.2014.08.003

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Lipid-induced conformational changes within the cytochrome b6f complex of oxygenic photosynthesis.2013

    • 著者名/発表者名
      Hasan S. S., Stofleth J. T., Yamashita E., Cramer W. A.
    • 雑誌名

      Biochemistry.

      巻: 52 号: 15 ページ: 2649-2654

    • DOI

      10.1021/bi301638h

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] A new protein complex promoting the assembly of Rad51 filaments.2013

    • 著者名/発表者名
      Sasanuma H., Tawaramoto M. S., Lao J. P., Hosaka H., Sanda E., Suzuki M., Yamashita E., Hunter N., Shinohara M., Nakagawa A., Shinohara A.
    • 雑誌名

      Nat. Commun.

      巻: 4 号: 1 ページ: 1676-1676

    • DOI

      10.1038/ncomms2678

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystallization and preliminary X-ray diffraction analysis of human importin β-Snail zinc finger domain complex.2013

    • 著者名/発表者名
      Choi S., Song J., Son S.Y., Park I.Y., Yamashita E., Lee S.J..
    • 雑誌名

      Acta Cryst. F

      巻: 69 号: 6 ページ: 1049-1051

    • DOI

      10.1042/bst20120211

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystal structure of the C-terminal domain of Mu phage central spike and functions of bound calcium ion.2013

    • 著者名/発表者名
      Harada K
    • 雑誌名

      Biochim Biophys Acta.,

      巻: 1834 号: 1 ページ: 284-291

    • DOI

      10.1016/j.bbapap.2012.08.015

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] Crystallography using Synchrotron Radiation2015

    • 著者名/発表者名
      Atsushi Nakagawa
    • 学会等名
      Joint Symposium between the Institute for Protein Research (Osaka University) and the Research School of Chemistry (Australian National University) "Protein Structure and Function”
    • 発表場所
      Canberra(Australia)
    • 年月日
      2015-11-14
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 緑膿菌由来異物排出トランスポーターMuxBのX 線結晶構造解析2015

    • 著者名/発表者名
      比嘉悠貴、米原 涼、 中川敦史、 山下栄樹
    • 学会等名
      日本結晶学会年会
    • 発表場所
      大阪府立大学中百舌鳥キャンパス(大阪府堺市)
    • 年月日
      2015-10-17
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] Synchrotron radiation beam line of the Institute for Protein Research2015

    • 著者名/発表者名
      Eiki Yamashita
    • 学会等名
      International Symposium on Establishment of Structural Biology Network in the Asian Region
    • 発表場所
      Hsinchu(Taiwan)
    • 年月日
      2015-09-30
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 核外輸送に置ける Exportin-5 の構造基盤/The structural basis on nuclear export of Exportin-5.2015

    • 著者名/発表者名
      山澤龍治、小林武、慈幸千真理、月原冨武、中川敦史、山下栄樹
    • 学会等名
      第15回 日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      あわぎんホール(徳島県徳島市)
    • 年月日
      2015-06-24
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] Structure Biology Using Synchrotron Radiation2015

    • 著者名/発表者名
      Atsushi Nakagawa
    • 学会等名
      Molecular and Cellular Life Sciences: Infectous Diseases, Biochemistry & Structural Biology (MCLS2015)
    • 発表場所
      Surabaya(Indonesia)
    • 年月日
      2015-05-07
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Structure Determination of Biological Maromolecules by X-ray2015

    • 著者名/発表者名
      Atsushi Nakagawa
    • 学会等名
      The First Trilateral Workshop for Frontier Protein Studies
    • 発表場所
      Peking(China)
    • 年月日
      2015-04-23
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] SPring-8生体超分子複合体構造解析ビームライン(大阪大学蛋白質研究所)BL44XUの現状2015

    • 著者名/発表者名
      山下栄樹, 東浦彰史, 吉村政人, 長谷川和也, 熊坂崇,古川行人,大端通,上野剛,山本雅貴,吉川信也,月原冨武,中川敦史
    • 学会等名
      第28回日本放射光学会年会放射光科学合同シンポジウム
    • 発表場所
      立命館大学びわこ・くさつキャンパス
    • 年月日
      2015-01-10 – 2015-01-12
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] 緑膿菌由来異物排出蛋白質のX線結晶構造解析2015

    • 著者名/発表者名
      住田一真,米原涼,中江太治,中川敦史,山下栄樹
    • 学会等名
      第28回日本放射光学会年会放射光科学合同シンポジウム
    • 発表場所
      立命館大学びわこ・くさつキャンパス
    • 年月日
      2015-01-10 – 2015-01-12
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] IPR Beamline for Macromolecular Assemblies at SPring-8 (BL44XU)2014

    • 著者名/発表者名
      Eiki Yamashita, Akifumi Higashiura, Masato Yoshimura, Kazuya Hasegawa, Yukito Furukawa, Toru Ohata, Takashi Kumasaka, Go Ueno, Masaki Yamamoto, Atsushi Nakagawa
    • 学会等名
      23rd Congress and General Assembly of the International Union of Crystallography
    • 発表場所
      Montreal
    • 年月日
      2014-08-05 – 2014-08-12
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] SPring-8生体超分子複合体構造解析ビームライン(大阪大学蛋白質研究所)BL44XUの現状2014

    • 著者名/発表者名
      山下栄樹
    • 学会等名
      第27回日本放射光学会年会放射光科学合同シンポジウム
    • 発表場所
      広島国際会議場(広島)
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] 構造生物学と放射光2013

    • 著者名/発表者名
      中川敦史
    • 学会等名
      第13回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      とりぎん文化会館(鳥取)
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Coherent Diffraction Imaging for Spherical Biological Particles2013

    • 著者名/発表者名
      Atsushi Nakagawa
    • 学会等名
      The 28th European Crystallography Meeting
    • 発表場所
      Warick University, Coventry, UK
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Coherent Diffraction Imaging for Structure Determination for Spherical Biological Particles2013

    • 著者名/発表者名
      Atsushi Nakagawa, Akifumi Higashiura, Kenji Iwasaki, Marina Murakami, Eiki Yamashita, Kazuki Takeda, Yu Hirano, Yuya Hanazono, Kiyofumi Takaba, Masahito Hibi, Yukiko Tomisaki, Kunio Miki
    • 学会等名
      The 12th Conference of the Asian Crystallographic Association
    • 発表場所
      Hong Kong University of Science and Technology, Hong Kong
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Structure determination of biological macromolecules using synchrotron radiation and X-ray free electron laser

    • 著者名/発表者名
      Atsushi Nakagawa
    • 学会等名
      International Symposium on New Drug Discovery and Development
    • 発表場所
      Chungbuk University, Cheongju, Korea
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 招待講演

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公開日: 2013-05-21   更新日: 2019-07-29  

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