[ＮｉＦｅ]ヒドロゲナーゼの酸素耐性機構の解明

• 研究課題/領域番号: 25291038
• 研究種目: 基盤研究(B)
• 配分区分: 一部基金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 生物物理学
• 研究機関: 兵庫県立大学
• 研究代表者: 樋口 芳樹 兵庫県立大学, 生命理学研究科, 教授 (90183574)
• 研究期間 (年度): 2013-04-01 – 2016-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2015年度)
• 配分額: 17,680千円 (直接経費: 13,600千円、間接経費: 4,080千円); 2015年度: 7,410千円 (直接経費: 5,700千円、間接経費: 1,710千円); 2014年度: 7,410千円 (直接経費: 5,700千円、間接経費: 1,710千円); 2013年度: 2,860千円 (直接経費: 2,200千円、間接経費: 660千円)
• キーワード: X線結晶解析 / 酸素耐性酵素 / Ni酵素 / ヒドロゲナーゼ / 燃料電池 / 中性子結晶解析 / 反応機構 / プロトンチャネル / 中性子解析

研究成果の概要

本研究では，[NiFe]-ヒドロゲナーゼにみられる酸素耐性の構造基盤を解明すべく，新規の酸素耐性酵素のX線結晶解析と酸素耐性をもたない標準酵素の中性子結晶解析を進めた．
１．好熱菌の新規酸素耐性酵素について空気酸化型，水素還元型およびK3Fe(CN)6による強制酸化型のＸ線解析を進めている．これまでの結果では，近位クラスターは，酸素耐性をもたない酵素と同じ[4Fe4S]型構造をもっていた．しかし，強制酸化型では，従来の酸素耐性酵素と同様にそのクラスターの構造は変化したが，変化の仕方は異なっていることを見出した．
２．標準酵素において，2.0 A分解能の中性子回折データの取得に成功した．

研究成果

• [国際共同研究] マックスプランク研究所(ドイツ)
• [雑誌論文] Domain swapping oligomerization of thermostable c-type cytochrome in E. coli cells (2016)
  • 著者名/発表者名: Yugo Hayashi, Masaru Yamanaka, Satoshi Nagao, Hirofumi Komori, Yoshiki Higuchi, Shun Hirota
  • 雑誌名: Scientific reports 巻: 6 号: 1 ページ: 19334-19334
  • DOI: 10.1038/srep19334
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Synthesis and Reactivity of a Water-soluble NiRu Monohydride Complex with a Tethered Pyridine Moiety (2016)
  • 著者名/発表者名: T. Matsumoto, K. Yoshimoto, C. Zheng, Y. Shomura, Y. Higuchi, H. Nakai and S. Ogo
  • 雑誌名: Chem. Lett. 巻: 45 ページ: 197-199
  • NAID: 130005124717
  • 査読あり
• [雑誌論文] Improved purification, crystallization and crystallographic study of Hyd-2 type [NiFe] hydrogenase from Citrobacter sp. S-77 (2016)
  • 著者名/発表者名: Muhd Noor, N.D.; Nishikawa, Koji; Nishihara, Hirofumi; Yoon, Ki-Seok; Ogo, Seiji; Higuchi, Yoshiki
  • 雑誌名: Acta Crystallogr. Sect. F Struct. Biol. Commun. 巻: F72 号: 1 ページ: 53-58
  • DOI: 10.1107/s2053230x15024152
  • 査読あり
• [雑誌論文] Bioelectrochemical analysis of thermodynamics of the catalytic cycle and kinetics of the oxidative inactivation of oxygen-tolerant [NiFe]-hydrogenase (2016)
  • 著者名/発表者名: Keisei So, Rui Hamamoto, Ryosuke Takeuchi, Yuki Kitazumi, Osamu Shirai, Ryohei Endo, Hirofumi Nishihara, Yoshiki Higuchi, Kenji Kano
  • 雑誌名: Journal of Electroanalytical Chemistry 巻: 766 ページ: 152-161
  • DOI: 10.1016/j.jelechem.2016.02.009
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] ヒドロゲナーゼによる水素分解・合成機構および酵素燃料電池への応用 (2016)
  • 著者名/発表者名: 廣田俊，加納健司，樋口芳樹
  • 雑誌名: BIO INDUSTRY 巻: 33(1) ページ: 43-48
  • 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Domain-swapped dimer of Pseudomonas aeruginosa cytochrome c551: Structural insights into domain swapping of cytochrome c family proteins (2015)
  • 著者名/発表者名: Satoshi Nagao, Mariko Ueda, Hisao Osuka, Hirofumi Komori, Hironari Kamikubo, Mikio Kataoka, Yoshiki Higuchi, Shun Hirota
  • 雑誌名: PLoS One 巻: 10 号: 4 ページ: e0123653-e0123653
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0123653
  • NAID: 120005716860
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Structural basis for cargo binding and autoinhibition of Bicaudal-D1 by a parallel coiled-coil with homotypic registry. (2015)
  • 著者名/発表者名: Terawaki S, Yoshikane A, Higuchi Y, Wakamatsu K.
  • 雑誌名: Biochem Biophys Res Commun. 巻: 460 号: 2 ページ: 451-456
  • DOI: 10.1016/j.bbrc.2015.03.054
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] FT-IR Characterization of the Light-Induced Ni-L2 and Ni-L3 States of [NiFe] Hydrogenase from Desulfovibrio vulgaris Miyazaki F (2015)
  • 著者名/発表者名: H. Tai, K. Nishikawa, S. Inoue, Y. Higuchi and S. Hirota
  • 雑誌名: J. Phys. Chem. B 巻: 119 号: 43 ページ: 13668-13674
  • DOI: 10.1021/acs.jpcb.5b03075
  • 査読あり
• [雑誌論文] Crystallization and Preliminary X-ray Diffraction Analysis of FAD-dependent Glucose Dehydrogenase (2015)
  • 著者名/発表者名: H. Komori, K. Inaka, N. Furubayashi, M. Honda and Y. Higuchi
  • 雑誌名: Acta Crystallogr. F 巻: 71 号: 8 ページ: 1017-1019
  • DOI: 10.1107/s2053230x15010742
  • 査読あり
• [雑誌論文] “Newton’s cradle” proton relay with amide-imidic acid tautomerization in inverting cellulase visualized by neutron crystallography (2015)
  • 著者名/発表者名: Nakamura, A., Ishida, T., Kusaka, K., Yamada, T., Fushinobu, S., Tanaka, I., Kaneko, S., Ohta, K., Tanaka, H., Inaka, K., Higuchi, Y., Niimura, N., Samejima, M., and Igarashi, K.
  • 雑誌名: Science Adv. 巻: 1 号: 7
  • DOI: 10.1126/sciadv.1500263
  • NAID: 120006832408
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Nanoscale charge transport in cytochrome c3/DNA network: Comparative studies between redox-active molecules (2015)
  • 著者名/発表者名: H. Yamaguchi, D.-C. Che, Y. Hirano, M. Suzuki, Y. Higuchi and T. Matsumoto
  • 雑誌名: Japanese Journal of Applied Physics 巻: 54 号: 9 ページ: 095201-095204
  • DOI: 10.7567/jjap.54.095201
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Structural Insights into the O2 Reduction Mechanism of Multicopper Oxidase (2015)
  • 著者名/発表者名: H. Komori and Y. Higuchi
  • 雑誌名: J. Biochem. (Tokyo) 巻: 158(4) 号: 4 ページ: 293-298
  • DOI: 10.1093/jb/mvv079
  • 査読あり
• [雑誌論文] Oligomerization Enhancement and Two Domain Swapping Mode Detection for Thermostable Cytochrome c-552 via the Elongation of the Major Hinge Loop (2015)
  • 著者名/発表者名: C. Ren, S. Nagao, M. Yamanaka, H. Komori, Y. Shomura, Y. Higuchi and S. Hirota
  • 雑誌名: Mol. Biosyst. 巻: 11(12) 号: 12 ページ: 218-221
  • DOI: 10.1039/c5mb00545k
  • NAID: 120006334941
  • 査読あり
• [雑誌論文] Domain-swapped Cytochrome cb562 Dimer and Its Nanocage Encapsulating a Zn-SO4 Cluster in the Internal Cavity (2015)
  • 著者名/発表者名: Takaaki Miyamoto, Mai Kuribayashi, Satoshi Nagao, Yasuhito Shomura, Yoshiki Higuchi, Shun Hirota
  • 雑誌名: Chemical Science 巻: 6 号: 12 ページ: 7336-7342
  • DOI: 10.1039/c5sc02428e
  • NAID: 120006334940
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Rational design of heterodimeric protein using domain swapping for myoglobin (2015)
  • 著者名/発表者名: Ying-Wu Lin, Satoshi Nagao, Mohan Zhang, Yasuhito Shomura, Yoshiki Higuchi, Shun Hirota
  • 雑誌名: Angewandte Chemie International Edition 巻: 54 号: 2 ページ: 511-515
  • DOI: 10.1002/anie.201409267
  • NAID: 120005716859
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Crystallization and preliminary X-ray analysis of the NAD+-reducing [NiFe] hydrogenase from Hydrogenophilus thermoluteolus TH-1. (2015)
  • 著者名/発表者名: Taketa M, Nakagawa H, Habukawa M, Osuka H, Kihira K, Komori H, Shibata N, Ishii M, Igarashi Y, Nishihara H, Yoon KS, Ogo S, Shomura Y, Higuchi Y.
  • 雑誌名: Acta Crystallogr F Struct Biol Commun. 巻: 71 号: 1 ページ: 96-99
  • DOI: 10.1107/s2053230x14026521
  • 査読あり
• [雑誌論文] Light-Driven Hydrogen Production by Hydrogenases and a Ru- Complex inside a Nanoporous Glass Plate under Aerobic External Conditions (2014)
  • 著者名/発表者名: Tomoyasu Noji, Masaharu Kondo, Tetsuro Jin, Tetsuo Yazawa, Hisao Osuka, Yoshiki Higuchi, Mamoru Nango, Shigeru Itoh, Takehisa Dewa
  • 雑誌名: Journal of Physical Chemistry Letters 巻: 5 号: 14 ページ: 2403-2407
  • DOI: 10.1021/jz5008164
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Crystallographic characterization of the C-terminal coiled-coil region of mouse Bicaudal-D1 (BICD1) (2014)
  • 著者名/発表者名: S. Terawaki, H. Ootsuka, Y. Higuchi, and K. Wakamatsu
  • 雑誌名: Acta Cryst.F 巻: 70 号: 8 ページ: 1103-1106
  • DOI: 10.1107/s2053230x1401276x
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Formation of Domain-Swapped Oligomer of Cytochrome c from Its Molten Globule State Oligomer (2014)
  • 著者名/発表者名: Megha Deshpande, Partha Parui, Hironari Kamikubo, Masaru Yamanaka, Satoshi Nagao, Hirofumi Komori, Mikio Kataoka, Yoshiki Higuchi, Shun Hirota
  • 雑誌名: Biochemistry 巻: 53(28) 号: 28 ページ: 4696-4703
  • DOI: 10.1021/bi500497s
  • 査読あり
• [雑誌論文] Gas-diffusion and Direct Electron Transfer-type Bioanode for Hydrogen Oxidation with Oxygen-tolerant [NiFe]-hydrogenase as an Electrocatalyst (2014)
  • 著者名/発表者名: K. So, Y. Kitazumi, O. Shirai, K. Kurita, H. Nishihara, Y. Higuchi, K. Kano
  • 雑誌名: Chemistry Lett. 巻: 43 ページ: 1575-1577
  • NAID: 130004427222
  • 査読あり
• [雑誌論文] Catalytic Cycle of Ctochrome-c3 Hydrogenase, a [NiFe]-Enzyme, Deduced from the Structures of the Enzyme and the Enzyme Mimic (2014)
  • 著者名/発表者名: Yagi, Tatsuhiko; Ogo, Seiji; Higuchi, Yoshiki
  • 雑誌名: Int. J. Hydrogen Energy 巻: 印刷中 号: 32 ページ: 18543-18550
  • DOI: 10.1016/j.ijhydene.2013.12.174
  • 査読あり
• [雑誌論文] Kinetic Analysis of Inactivation and Enzyme Reaction of Oxygen-tolerant [NiFe]-hydrogenase at Direct Electron Transfer-type Bioanode (2014)
  • 著者名/発表者名: K. So, Y. Kitazumi, O. Shirai, K. Kurita, H. Nishihara, Y. Higuchi, and K. Kano
  • 雑誌名: Bull. Chem. Soc. Jpn. 巻: 87 号: 11 ページ: 1177-1185
  • DOI: 10.1246/bcsj.20140223
  • NAID: 130004684803
  • 査読あり
• [雑誌論文] Control of Transition between Ni-C and Ni-SIa States in Catalytic Cycle of [NiFe] Hydrogenase by Redox State of its Proximal Fe-S Cluster (2014)
  • 著者名/発表者名: H. Tai, K. Nishikawa, M. Suzuki, Y. Higuchi, and S. Hirota
  • 雑誌名: Angew. Chem. Int. Ed. 巻: 53 号: 50 ページ: 13817-13820
  • DOI: 10.1002/anie.201408552
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Change in Structure and Ligand Binding Properties of Hyperstable Cytochrome c555 from Aquifex aeolicus by Domain Swapping (2014)
  • 著者名/発表者名: M. Yamanaka, S. Nagao, H. Komori, Y. Higuchi and S. Hirota
  • 雑誌名: Protein Science 巻: 24 号: 3 ページ: 366-375
  • DOI: 10.1002/pro.2627
  • NAID: 120005716876
  • 査読あり
• [雑誌論文] New insights into the catalytic active-site structure of multicopper oxidases. (2014)
  • 著者名/発表者名: Komori H, Sugiyama R, Kataoka K, Miyazaki K, Higuchi Y, Sakurai T
  • 雑誌名: Acta Crystallogr D Biol Crystallogr 巻: 70 号: 3 ページ: 772-779
  • DOI: 10.1107/s1399004713033051
  • NAID: 120005451980
  • 査読あり
• [雑誌論文] Inhibitory activity of Filipendula ulmaria on recombinant histidine decarboxykase. (2013)
  • 著者名/発表者名: Nitta Yoko
  • 雑誌名: Food Chemistry 巻: 138 号: 2-3 ページ: 1551-1556
  • DOI: 10.1016/j.foodchem.2012.10.074
  • 査読あり
• [雑誌論文] Photosensitivity of the Ni-A State of [NiFe] Hydrogenase from Desulfovibrio vulgaris Miyazaki F with Visible Light (2013)
  • 著者名/発表者名: H. Osuka, Y. Shomura, H. Komori, N. Shibata, S. Nagao, Y. Higuchi, S. Hirota
  • 雑誌名: Biochemical and Biophysical Research Communications 巻: 430 号: 1 ページ: 284-288
  • DOI: 10.1016/j.bbrc.2012.10.136
  • NAID: 120005716864
  • 査読あり
• [雑誌論文] Studies on hydrogenase (2013)
  • 著者名/発表者名: T. Yagi, Y. Higuchi
  • 雑誌名: Ｐｒｏｃｅｅｄｉｎｇｓ ｏｆ ｔｈｅ Ｊａｐａｎ Ａｃａｄｅｍｙ． Ｓｅｒ． Ｂ： Ｐｈｙｓｉｃａｌ ａｎｄ Ｂｉｏｌｏｇｉｃａｌ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ 巻: 89 号: 1 ページ: 16-33
  • DOI: 10.2183/pjab.89.16
  • NAID: 130003365103
  • ISSN: 0386-2208, 1349-2896
  • 査読あり
• [雑誌論文] Cyrstal structure of the CueO mutants at Glu506, the key amino acid located in the proton transfer pathway for dioxygen reduction (2013)
  • 著者名/発表者名: H. Komori, T. Kajikawa, K. Kataoka, Y. Higuchi & T. Sakurai
  • 雑誌名: Biochem. Biophys. Res. Commun. 巻: 438 号: 4 ページ: 686-690
  • DOI: 10.1016/j.bbrc.2013.07.121
  • 査読あり
• [雑誌論文] Crystallization and X-ray diffraction analysis of nylon hydrolase (NylC) from Arthrobacter sp (2013)
  • 著者名/発表者名: Nagai, K., Yasuhira, K., Tanaka, Y., Kato, D., Takeo, M., Higuchi, Y., Negoro, S., & Shibata N.
  • 雑誌名: KI72 Acta Cryst. 巻: F69 号: 10 ページ: 1151-1154
  • DOI: 10.1107/s1744309113024263
  • 査読あり
• [雑誌論文] Structural Aspects of [NiFe]-hydrogenases (2013)
  • 著者名/発表者名: Y. Shomura and Y. Higuchi
  • 雑誌名: Rev. Inorg. Chem. 巻: 33 号: 4 ページ: 173-192
  • DOI: 10.1515/revic-2013-0005
  • 査読あり
• [雑誌論文] Formation of Oligomeric Cytochrome c during Folding by lntermolecular Hydrophobic Interaction between N-and C-Terminal α-Helices (2013)
  • 著者名/発表者名: Partha Pratim Parui, Megha Subhash Deshpande, Satoshi Nagao, Hironari Kamikubo. Hirofumi Komori. Yoshiki Higuchi, Miklo Kataoka . Shun Hirota
  • 雑誌名: Biochemistry 巻: 52巻 号: 48 ページ: 8732-8744
  • DOI: 10.1021/bi400986g
  • 査読あり
• [雑誌論文] 膜結合型ヒドロゲナーゼの酸素耐性機構の解明 (2013)
  • 著者名/発表者名: 庄村康人，樋口芳樹
  • 雑誌名: 生物物理 巻: 53-2 ページ: 82-85
  • NAID: 10031151786
• [雑誌論文] 立体構造を基盤としたナイロン加水分解酵素の開発と耐熱化機構 (2013)
  • 著者名/発表者名: 根来誠司，永井圭介，大島祥平，飯田一希，加藤太一郎，武尾正弘，持地広造， 柴田直樹，樋口芳樹
  • 雑誌名: 酵素工学ニュース 巻: 69 ページ: 12-18
• [学会発表] 中性子結晶解析法を用いて酵素における水素分解の反応機構解明にせまる (2016)
  • 著者名/発表者名: 樋口芳樹
  • 学会等名: 茨城大学大学院理工学研究科 ミニシンポジウム
  • 発表場所: 茨城大学水戸キャンパス ライブラリーホール（茨城県水戸市）
  • 年月日: 2016-02-22
  • 招待講演
• [学会発表] ヒドロゲナーゼの総合化学 (2015)
  • 著者名/発表者名: 樋口芳樹
  • 学会等名: Cat-on-Cat symposium in Himeji 2015
  • 発表場所: 姫路・西はりま地場産業センター（兵庫県姫路市）
  • 年月日: 2015-12-10
  • 招待講演
• [学会発表] ヒドロゲナーゼがもつ鉄硫黄クラスターの構造的多様性 (2015)
  • 著者名/発表者名: 庄村康人，Noor Dina Binti Muhd Noor，西 幸志，樋口芳樹
  • 学会等名: 第87回日本生化学会大会
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド（兵庫県神戸市）
  • 年月日: 2015-12-01
• [学会発表] Crystal structure analysis of the Fe-S protein maturation factor Cia1 (2015)
  • 著者名/発表者名: 松本卓樹，樋口芳樹，庄村康人
  • 学会等名: 第87回日本生化学会大会
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド（兵庫県神戸市）
  • 年月日: 2015-12-01
• [学会発表] ヒドロゲナーゼの修飾用電極の評価と反応活性の解析 (2015)
  • 著者名/発表者名: 窪田慎太郎，Buithanh Tan， 山崎徹，矢澤哲夫，樋口芳樹
  • 学会等名: 第61回ポーラログラフィーおよび電気化学分析化学討論会
  • 発表場所: イーグレ姫路（兵庫県姫路市）
  • 年月日: 2015-11-24
• [学会発表] 水素酸化還元酵素・[NiFe]-ヒドロゲナーゼの総合的構造化学を目指して (2015)
  • 著者名/発表者名: 樋口芳樹
  • 学会等名: 東京大学放射光連携研究機構 10周年記念講演会
  • 発表場所: 東京大学本郷キャンパス小柴ホール（東京都文京区）
  • 年月日: 2015-11-13
  • 招待講演
• [学会発表] EPR spectroscopic studies of highly O2-stable [NiFe]-hydrogenase from Citrobacter sp. S-77 (2015)
  • 著者名/発表者名: Hiroaki Matsuura, Hulin Tai, Koji Nishikawa, Ki-Seok Yoon, Seiji Ogo, Shun Hirota, Yoshiki Higuchi
  • 学会等名: University of Hyogo (UH)－EMTECH, Universiti Putra Malaysia (UPM) 2nd Joint Symposium
  • 発表場所: 兵庫県立先端科学技術支援センター(兵庫県上郡町)
  • 年月日: 2015-10-22
  • 国際学会
• [学会発表] Structural chemistry of hydrogenase by diffraction method (2015)
  • 著者名/発表者名: 樋口芳樹
  • 学会等名: 錯体化学討論会
  • 発表場所: 奈良女子大学（奈良県奈良市）
  • 年月日: 2015-09-21
  • 招待講演
• [学会発表] 電子伝導性多孔質ガラス電極の作製 (2015)
  • 著者名/発表者名: ブイタンタン，橋野廉，嶺重温，窪田慎太郎，樋口芳樹，山崎徹，矢澤哲夫
  • 学会等名: 公益社団法人日本セラミック協会第28回秋季シンポジウム
  • 発表場所: 富山大学五福キャンパス（富山県富山市）
  • 年月日: 2015-09-16
• [学会発表] Preparation of the crystals of NAD+-reducing [NiFe] hydrogenase in the reduced form (2015)
  • 著者名/発表者名: Hisashi Nakashima, Midori Taketa, Hanae Nakagawa, Mao Habukawa, Naoki Shibata, Yasuhito Shomura, Yoshiki Higuchi
  • 学会等名: Student exchange program between College of Natural Sciences in Dong-A University and School of Science in University of Hyogo
  • 発表場所: 兵庫県立先端科学技術支援センター(兵庫県上郡町)
  • 年月日: 2015-08-22
  • 国際学会
• [学会発表] Control of the Transition between Ni-C and Ni-SIa States in the Catalytic Cycle of [NiFe] Hydrogenase by the Redox State of the Proximal Fe-S Cluster (2015)
  • 著者名/発表者名: Hulin Tai, Koji Nishikawa, Seiya Inoue, Masayuki Suzuki, Yoshiki Higuchi and Shun Hirota
  • 学会等名: 17th International Conference on Biological Inorganic Chemistry
  • 発表場所: 北京，中国
  • 年月日: 2015-07-20
  • 国際学会
• [学会発表] ヒドロゲナーゼの水素活性化反応機構とプロトン移動 (2015)
  • 著者名/発表者名: 樋口芳樹
  • 学会等名: 平成２７年度前期物性研究所短期研究会 機能物性融合科学シリーズ（３）「反応と輸送」
  • 発表場所: 東京大学物性研究所（千葉県柏市）
  • 年月日: 2015-06-25
  • 招待講演
• [学会発表] 水素を新しいエネルギー源とする新領域の構築 (2015)
  • 著者名/発表者名: 樋口芳樹
  • 学会等名: 第16回 豊田理化学研究所フェロー研究報告会
  • 発表場所: 豊田理化学研究所オープンコミュニティ（愛知県豊田市）
  • 年月日: 2015-06-22
  • 招待講演
• [学会発表] [NiFe]ヒドロゲナーゼの光照射で生じるNi-L状態の分光学的研究 (2015)
  • 著者名/発表者名: 太虎林，西川幸志，井上誠也，樋口芳樹，廣田俊
  • 学会等名: 第４２回生体分子科学討論会
  • 発表場所: 高崎シティーギャラリー （ 群馬県高崎市）
  • 年月日: 2015-06-12
• [学会発表] ヒドロゲナーゼの酸化的不活性化－速度論的解析に基づく回避戦略－ (2015)
  • 著者名/発表者名: 宋 慶盛，西原宏史，樋口芳樹，北隅優希，白井 理，加納健司
  • 学会等名: 日本農芸化学会2015年度大会
  • 発表場所: 岡山大学（岡山県・岡山市）
  • 年月日: 2015-03-28
• [学会発表] 鉄硫黄クラスターの酸化還元状態による[NiFe]ヒドロゲナーゼの活性サイクル制御 (2015)
  • 著者名/発表者名: 太 虎林，西川幸志，井上誠也，樋口芳樹，廣田 俊
  • 学会等名: 日本化学会第95春季年会
  • 発表場所: 日本大学 理工学部船橋キャンパス（千葉県・船橋市）
  • 年月日: 2015-03-27
• [学会発表] ヒドロゲナーゼの反応水素が見えるか？ (2015)
  • 著者名/発表者名: 樋口芳樹
  • 学会等名: 日本物理学会 第70回年次大会
  • 発表場所: 早稲田大学 早稲田キャンパス（東京都・新宿区）
  • 年月日: 2015-03-21
  • 招待講演
• [学会発表] Structure, function and evolution of [NiFe]-Hydrogenases (2014)
  • 著者名/発表者名: Yoshiki Higuchi
  • 学会等名: The International Conference on Artificial Photosynthesis 2014
  • 発表場所: 淡路夢舞台国際会議場（兵庫県・淡路市）
  • 年月日: 2014-11-27
  • 招待講演
• [学会発表] ヒドロゲナーゼの性質の電気化学的解析と修飾用電極の探索 (2014)
  • 著者名/発表者名: 窪田慎太郎，東間清和，山崎徹，矢澤哲夫，安川智之，水谷文雄，樋口芳樹
  • 学会等名: ポーラログラフィーおよび電気分析化学討論会
  • 発表場所: 京都工芸繊維大学 60周年記念館（京都府・京都市）
  • 年月日: 2014-11-16
• [学会発表] Structural chemistry of oxygen tolerant [NiFe]-hydrogenase from Citrobacter S-77 (2014)
  • 著者名/発表者名: Noor Dina Muhd Noor，Koji Nishikawa， Ki-Seok Yoon， Seiji Ogo，
  • 学会等名: 日本結晶学会2014年度年会
  • 発表場所: 東京大学・弥生講堂（東京都・文京区）
  • 年月日: 2014-11-01 – 2014-11-03
• [学会発表] 中性子結晶構造解析に向けた巨大単結晶の調製～相図を用いたアプローチ～ (2014)
  • 著者名/発表者名: 井上誠也，西川幸志，玉田太郎，黒木良太，樋口芳樹
  • 学会等名: 日本結晶学会2014年度年会
  • 発表場所: 東京大学・弥生講堂（東京都・文京区）
  • 年月日: 2014-11-01 – 2014-11-03
• [学会発表] Towards structural determination of oxygen-stable [NiFe]-hydrogenase from Citrobacter S-77 (2014)
  • 著者名/発表者名: Noor Dina Muhd Noor， Koji Nishikawa， Ki-Seok Yoon， Seiji Ogo， Yoshiki Higuchi
  • 学会等名: 2nd International Picobiology Institute Symposium
  • 発表場所: 兵庫県立先端科学技術支援センター（兵庫県・上郡町）
  • 年月日: 2014-10-09
• [学会発表] SAM 修飾電極を用いたシトクロム c3 単分子の電気伝導測定 (2014)
  • 著者名/発表者名: 角田 早，蔡 徳七，鈴木 雅之，樋口 芳樹，松本 卓也
  • 学会等名: 第8回分子科学討論会
  • 発表場所: 広島大学（広島県・広島市）
  • 年月日: 2014-09-24
• [学会発表] [NiFe]ヒドロゲナーゼの活性化サイクルにおける新規中間体の特定 (2014)
  • 著者名/発表者名: 太 虎林， 西川幸志， 樋口芳樹， 廣田 俊
  • 学会等名: 第8回分子科学討論会
  • 発表場所: 広島大学（広島県・広島市）
  • 年月日: 2014-09-23
• [学会発表] X-Ray Structural Studies of [NiFe]-Hydrogenases (2014)
  • 著者名/発表者名: Yoshiki Higuchi
  • 学会等名: International Conference of Catalytic Systems for Chemical Energy Conversion
  • 発表場所: Muelheim (Germany)
  • 年月日: 2014-07-24
  • 招待講演
• [学会発表] 硫酸還元菌由来 [NiFe]ヒドロゲナーゼの光反応性の分光学的研究 (2014)
  • 著者名/発表者名: 太 虎林，西川幸志，鈴木雅之，樋口 芳樹，廣田 俊
  • 学会等名: 第14回日本蛋白質科学会年会
  • 発表場所: ワークピア横浜/横浜産貿易ホールマリネリア（神奈川県・横浜市）
  • 年月日: 2014-06-26
• [学会発表] ヒドロゲナーゼの構造・機能・進化 (2014)
  • 著者名/発表者名: 樋口芳樹
  • 学会等名: 第4１回 生体分子科学討論会
  • 発表場所: 九州大学西新プラザ（福岡県・福岡市）
  • 年月日: 2014-06-06
  • 招待講演
• [学会発表] Structural chemistry of oxygen tolerant [NiFe]-hydrogenase from Citrobacter S-77 (2014)
  • 著者名/発表者名: Noor Dina Muhd Noor， Koji Nishikawa， Ki-Seok Yoon， Seiji Ogo， Yoshiki Higuchi
  • 学会等名: EMTECH-University of Hyogo Joint Colloquium 2014
  • 発表場所: University of Putra (Malaysia)
  • 年月日: 2014-05-26
• [学会発表] Crystallization of single crystals of Multi-Copper Oxidases for neutron diffraction experiment (2014)
  • 著者名/発表者名: M. Akter, H. Komori, N. Shibata, T. Sakurai, K. Kataoka, Y. Higuchi
  • 学会等名: 第1回ピコバイロジー研究所国際シンポジウム
  • 発表場所: 理研XFEL大会議室（兵庫）
• [学会発表] Crystallization of [NiFe]-hydrogenase maturation protein complex HypA-HypB (2014)
  • 著者名/発表者名: Y. Okawa, Y. Higuchi, and Y. Shomura
  • 学会等名: 第1回ピコバイロジー研究所国際シンポジウム
  • 発表場所: 理研XFEL大会議室（兵庫）
• [学会発表] Purification and Crystallization of NAD+-reducing [NiFe]-hydrogenase (2014)
  • 著者名/発表者名: H. Nakagawa, M. Taketa, M. Habukawa, K. Kihira, N. Shibata, H. Nishihara, K.-S. Yoon, S. Ogo, Ma. Ishii, Y. Igarashi, Y. Shomura and Y. Higuchi
  • 学会等名: 第1回ピコバイロジー研究所国際シンポジウム
  • 発表場所: 理研XFEL大会議室（兵庫）
• [学会発表] Crystallization of extracellular domains of protocadherin, a neural cell adhesion protein (2014)
  • 著者名/発表者名: S. Yoshida, T. Hirabayashi, T. Yagi, Y. Shomura and Y. Higuchi
  • 学会等名: 第1回ピコバイロジー研究所国際シンポジウム
  • 発表場所: 理研XFEL大会議室（兵庫）
• [学会発表] [NiFe]ヒドロゲナーゼのX線結晶構造解析 (2014)
  • 著者名/発表者名: 庄村康人
  • 学会等名: 第27回日本放射光学会年会放射光科学合同シンポジウム
  • 発表場所: 広島国際会議場（広島）
  • 招待講演
• [学会発表] 結晶構造解析による水素分解酵素の反応機構解明に向けた試み (2014)
  • 著者名/発表者名: 庄村康人，西川幸志， 井上誠也，玉田太郎，樋口 芳樹
  • 学会等名: 蛋白質研究所セミナー
  • 発表場所: 大阪大学蛋白質研究所（大阪）
  • 招待講演
• [学会発表] 逆行性輸送因子による積荷認識の構造的基盤 (2014)
  • 著者名/発表者名: 寺脇慎一，大塚寛貴，樋口芳樹，若松馨
  • 学会等名: 第29回PFシンポジウム
  • 発表場所: つくば国際会議場エポカル（茨城）
• [学会発表] H. thermoluteolus TH-1由来NAD+還元ヒドロゲナーゼの分光学研究 (2014)
  • 著者名/発表者名: 太虎林，竹田翠，庄村康人，西川幸志，鈴木雅之，樋口芳樹，廣田俊
  • 学会等名: 日本化学会第94春季年会
  • 発表場所: 名古屋大学東山キャンパス（愛知）
• [学会発表] 超好熱菌由来シトクロムcのドメインスワッピング (2014)
  • 著者名/発表者名: 山中優，長尾聡，小森博文，樋口芳樹，廣田俊
  • 学会等名: 日本化学会第94春季年会
  • 発表場所: 名古屋大学東山キャンパス（愛知）
• [学会発表] 大腸菌膜との相互作用によるシトクロムcの多量化 (2014)
  • 著者名/発表者名: 林有吾，長尾聡，山中優，小森博文，樋口芳樹，廣田俊
  • 学会等名: 日本化学会第94春季年会
  • 発表場所: 名古屋大学東山キャンパス（愛知）
• [学会発表] Reaction Mechanism of S-Carbamoylation of HypE by HypF in the Maturation of [NiFe]-hydrogenase (2013)
  • 著者名/発表者名: Y. Higuchi and Y. Shomura
  • 学会等名: 10th International Hydrogenase Conference
  • 発表場所: Szeged (Hungry)
  • 招待講演
• [学会発表] Domain Swapping of the Heme and N-Terminal α-Helix in Hydrogenobacter thermophilus Cytochrome-c552 Dimer (2013)
  • 著者名/発表者名: Y. Hayashi, S. Nagao, H. Osuka, H. Komori, Y. Higuchi, and S. Hirota
  • 学会等名: The 27th Annual Symposium of The Protein Society
  • 発表場所: Boston（USA）
• [学会発表] Structure of the native Axin-DIX domain crystallized without mercury compound. (2013)
  • 著者名/発表者名: N. Shibata, T. Katsutani, S. Terawaki, H. Yamamoto, A. Kikuchi and Y.Higuchi
  • 学会等名: 7th International Conference on Structural Genomics 2013
  • 発表場所: 京王プラザホテル札幌（北海道）
• [学会発表] αフルオロメチルヒスチジンによるヒスタミン合成酵素の阻害機構の解明 (2013)
  • 著者名/発表者名: 小森博文，新田陽子，植野洋志，樋口芳樹
  • 学会等名: 第86回日本生化学大会
  • 発表場所: パシフィコ横浜（神奈川）
• [学会発表] AFM によるシトクロムc3分子の電気伝導測定 (2013)
  • 著者名/発表者名: 角田早，山口晴正，蔡徳七，平野義明，鈴木雅之，樋口芳樹，松本卓也
  • 学会等名: 第 74 回応用物理学会
  • 発表場所: 同志社大学（京都）
• [学会発表] シトクロムc3ネットワークの電気特性 (2013)
  • 著者名/発表者名: 山口晴正，角田早，蔡徳七，平野義明，鈴木雅之，樋口芳樹，松本卓也
  • 学会等名: 第 74 回応用物理学会
  • 発表場所: 同志社大学（京都）
• [学会発表] シトクロムc3ネットワークの電気特性 (2013)
  • 著者名/発表者名: 山口晴正，角田早，蔡徳七，平野義明，鈴木雅之，樋口芳樹，松本卓也
  • 学会等名: 第7回分子科学討論会
  • 発表場所: 京都テルサ（京都）
• [学会発表] AFMによるシトクロムc3分子の電気伝導測定 (2013)
  • 著者名/発表者名: 角田早，山口晴正，蔡徳七，平野義明，鈴木雅之，樋口芳樹，松本卓也
  • 学会等名: 第7回分子科学討論会
  • 発表場所: 京都テルサ（京都）
• [学会発表] 水素-化学エネルギー変換・ヒドロゲナーゼの構造化学 (2013)
  • 著者名/発表者名: 中川英恵，竹田翠，庄村康人，樋口芳樹
  • 学会等名: 兵庫県立大学シンポジウム
  • 発表場所: 神戸市産業振興センター（兵庫）
• [学会発表] 水素分解酵素の成熟化機構の解明 (2013)
  • 著者名/発表者名: 大川雄嗣，樋口芳樹，庄村康人
  • 学会等名: 兵庫県立大学シンポジウム
  • 発表場所: 神戸市産業振興センター（兵庫）
• [学会発表] 糖質加水分解酵素ファミリー45に属する担子菌由来エンドグルカナーゼの構造・機 能解析 (2013)
  • 著者名/発表者名: 中村彰彦，石田卓也，伊中浩治，樋口芳樹，伏信進矢，五十嵐圭日子，鮫島正浩
  • 学会等名: 日本応用糖質科学会平成25年度大会（第62回）
  • 発表場所: 鹿児島大学（鹿児島）
• [学会発表] 超好熱菌由来シトクロムcの多量化と二量体構造 (2013)
  • 著者名/発表者名: 山中優，長尾聡，羽田正雄，小森博文，樋口芳樹，廣田俊
  • 学会等名: 第7回バイオ関連シンポジウム（日本化学会）
  • 発表場所: 名古屋大学豊田講堂（愛知）
• [学会発表] ヒスタミン合成酵素の構造解析 (2013)
  • 著者名/発表者名: 小森博文，新田陽子，植野洋志，樋口芳樹
  • 学会等名: 平成25年度日本結晶学会
  • 発表場所: 熊本大学（熊本）
• [学会発表] Preparation of single crystals of multi-copper oxidases suitable for neutron diffraction (2013)
  • 著者名/発表者名: M. Akter，H. Komori，N. Shibata，Y. Shomura，T. Sakurai，K. Kataoka，Y. Higuchi
  • 学会等名: 平成25年度日本結晶学会
  • 発表場所: 熊本大学（熊本）
• [学会発表] [NiFe]-ヒドロゲナーゼ成熟化タンパク質HypAの結晶化 (2013)
  • 著者名/発表者名: 大川雄嗣，樋口芳樹，庄村康人
  • 学会等名: 平成25年度日本結晶学会
  • 発表場所: 熊本大学（熊本）
• [学会発表] 細胞接着分子プロトカドヘリン細胞外領域の結晶化 (2013)
  • 著者名/発表者名: 吉田早希，平林敬浩，八木健，庄村康人，樋口 芳樹
  • 学会等名: 平成25年度日本結晶学会
  • 発表場所: 熊本大学（熊本）
• [学会発表] NAD+還元型ヒドロゲナーゼの結晶学的研究 (2013)
  • 著者名/発表者名: 中川英恵，竹田翠，土生川真央，木平清人，柴田直樹
  • 学会等名: 平成25年度日本結晶学会年会
  • 発表場所: 熊本大学（熊本）
• [学会発表] 水銀化合物非存在下での野生型 Axin DIX-ドメイン (2013)
  • 著者名/発表者名: 勝谷拓也，柴田直樹，寺脇慎一，山本英樹，菊池章，樋口芳樹
  • 学会等名: 平成25年度日本結晶学会
  • 発表場所: 熊本大学（熊本）
• [学会発表] Formation of Domain-Swapped Oligomeric Cytochrome c from Its Molten Globule State (2013)
  • 著者名/発表者名: M. S. Deshpande, P. P. Parui, M. Yamanaka, S. Nagao, H. Kamikubo, M. Kataoka, H. Komori, Y. Higuchi and S. Hirota
  • 学会等名: 第51回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 国立京都国際会館（京都）
• [学会発表] X-ray Structural Study of O2-tolerant [NiFe] hydrogenase (2013)
  • 著者名/発表者名: Y. Higuchi, K.-S. Yoon, H. Nishihara and Y. Shomura
  • 学会等名: International Conference on Bio/Mimetic Solar Energy Conversion (iSEC)2013
  • 発表場所: 大阪市立大学（大阪）
  • 招待講演
• [学会発表] Polymerization and Oligomerization of Cytochrome c and Myoglobin by Domain Swapping (2013)
  • 著者名/発表者名: S. Hirota, S. Nagao, Y. Hayashi, Z. Wang, A. D. Nugraheni and Y. Higuchi
  • 学会等名: 12th International Symposium on Applied Bioinorganic Chemistry
  • 発表場所: Guangzhou （China）
  • 招待講演
• [図書] 実験医学増刊 構造生命科学 (2014)
  • 著者名/発表者名: 樋口芳樹
  • 総ページ数: 230
  • 出版者: 羊土社
• [図書] 進化を続ける構造生物学，松島正明，伊中浩治編 (2014)
  • 著者名/発表者名: 樋口芳樹
  • 総ページ数: 216
  • 出版者: 化学同人
• [図書] CSJカレントレビュー15，次世代のバイオ水素エネルギー開発 (2014)
  • 著者名/発表者名: 庄村康人，樋口芳樹
  • 総ページ数: 174
  • 出版者: 化学同人
• [図書] 光合成のエネルギー利用と環境応用 (2014)
  • 著者名/発表者名: 樋口芳樹
  • 総ページ数: 308
  • 出版者: CMC出版