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植物オルガネラ遺伝子の発現を統御する核コードPPRタンパク質の機能解析

研究課題

研究課題/領域番号 25291059
研究種目

基盤研究(B)

配分区分一部基金
応募区分一般
研究分野 植物分子・生理科学
研究機関名古屋大学

研究代表者

杉田 護  名古屋大学, 遺伝子実験施設, 教授 (70154474)

連携研究者 中村 崇裕  九州大学, 農学研究院, 准教授 (10464398)
一瀬 瑞穂  名古屋大学, トランスフォーマティブ生命分子研究所, 特任助教 (60755718)
研究協力者 杉田 千恵子  名古屋大学, 遺伝子実験施設, 研究員 (30402457)
研究期間 (年度) 2013-04-01 – 2016-03-31
研究課題ステータス 完了 (2015年度)
配分額 *注記
17,940千円 (直接経費: 13,800千円、間接経費: 4,140千円)
2015年度: 4,550千円 (直接経費: 3,500千円、間接経費: 1,050千円)
2014年度: 5,590千円 (直接経費: 4,300千円、間接経費: 1,290千円)
2013年度: 7,800千円 (直接経費: 6,000千円、間接経費: 1,800千円)
キーワード葉緑体 / ミトコンドリア / 転写後制御 / PPRタンパク質 / RNA結合認識 / RNAスプライシング / RNA編集 / ヒメツリガネゴケ / 遺伝子発現 / グループⅡイントロン / RNA結合配列 / RNase P / DYWドメイン
研究成果の概要

ミトコンドリアと葉緑体は、植物の生長にとって重要な働きをするオルガネラである。植物オルガネラは独自の遺伝子発現系を持ち、その遺伝子発現は転写後のRNAレベルで強く制御されている。しかし、その制御に関わる因子の多くは未解明である。本研究では、モデル植物として優れた特性をもつヒメツリガネゴケを用いて、tRNAの5'末端形成、RNA編集、RNAスプライシングに働く新規のRNA結合タンパク質を明らかにした。

報告書

(4件)
  • 2015 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2014 実績報告書
  • 2013 実績報告書
  • 研究成果

    (43件)

すべて 2016 2015 2014 2013 その他

すべて 雑誌論文 (8件) (うち査読あり 8件、 謝辞記載あり 4件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (25件) (うち国際学会 1件、 招待講演 1件) 図書 (4件) 備考 (6件)

  • [雑誌論文] Diversity of plant circadian clocks: insights from studies of Chlamydomonas reinhardtii and Physcomitrella patens.2016

    • 著者名/発表者名
      2.Ryo, T., Matsuo, T., Yamashino, T., Ichinose, M., Sugita, M. and Aoki, S.
    • 雑誌名

      Plant Signaling & Behavior

      巻: 11 号: 1 ページ: e1116661-e1116661

    • DOI

      10.1080/15592324.2015.1116661

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Plastid genome sequences of Gymnochlora stellata, Lotharella vacuolata, and Partenskyella glossopodia reveal remarkable structural conservation among chlorarachniophyte species.2016

    • 著者名/発表者名
      Suzuki S, Hirakawa Y, Kofuji R, Sugita M, Ishida K.
    • 雑誌名

      Journal of Plant Research

      巻: 印刷中 号: 4 ページ: 581-590

    • DOI

      10.1007/s10265-016-0804-5

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] P-class pentatricopeptide repeat protein PTSF1 is required for splicing of the plastid pre-tRNA(Ile) in Physcomitrella patens.2016

    • 著者名/発表者名
      Goto, S., Kawaguchi, Y., Sugita, C., Ichinose, M. and Sugita, M.
    • 雑誌名

      The Plant Journal

      巻: 87 号: 6 ページ: 493-503

    • DOI

      10.1111/tpj.13184

    • NAID

      120005893269

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Molecular characterization of three PRORP proteins in the moss Physcomitrella patens: nuclear PRORP protein is not essential for moss viability.2014

    • 著者名/発表者名
      Sugita, C., Komura, Y., Tanaka, K., Kometani, K., Satoh, H. and Sugita, M.
    • 雑誌名

      PLoS ONE

      巻: 9 号: 10 ページ: e108962-e108962

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0108962

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Identification of a pentatricopeptide repeat RNA editing factor in Physcomitrella patens chloroplasts2014

    • 著者名/発表者名
      Mizuho Ichinose, Masato Uchida, Mamoru Sugita
    • 雑誌名

      FEBS Letters

      巻: 588 号: 21 ページ: 4060-4064

    • DOI

      10.1016/j.febslet.2014.09.031

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] DipM is required for peptidoglycan hydrolysis during chloroplast division.2014

    • 著者名/発表者名
      Miyagishima SY, Kabeya Y, Sugita C, Sugita M, Fujiwara T.
    • 雑誌名

      BMC Plant Biol.

      巻: 14 号: 1 ページ: 57-57

    • DOI

      10.1186/1471-2229-14-57

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Architecture of the PPR gene family in the moss Physcomitrella patens2013

    • 著者名/発表者名
      Mamoru Sugita, Mizuho Ichinose, Mizuki Ide, Chieko Sugita
    • 雑誌名

      RNA Biology

      巻: 10 号: 9 ページ: 1439-1445

    • DOI

      10.4161/rna.24772

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Two DYW subclass PPR proteins are involved in RNA editing of ccmFc and atp9 transcripts in the moss Physcomitrella patens : first complete set of PPR editing factors in plant mitochondria2013

    • 著者名/発表者名
      Mizuho Ichinose, Chieko Sugita, Yusuke Yagi, Takahiro Nakamura, Mamoru Sugita
    • 雑誌名

      Plant Cell Physiology

      巻: 54 号: 11 ページ: 1907-1916

    • DOI

      10.1093/pcp/pct132

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] クラミドモナスとゼニゴケのタンパク質性RNase Pの解析2016

    • 著者名/発表者名
      杉田千恵子、松尾拓哉、西浜竜一、河内孝之、杉田護
    • 学会等名
      第57回日本植物生理学会年会
    • 発表場所
      岩手大学上田キャンパス
    • 年月日
      2016-03-18
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] ヒメツリガネゴケ葉緑体のpre-tRNAのスプライシングに関与するPPRタンパク質2016

    • 著者名/発表者名
      後藤誠也、一瀬瑞穂、杉田千恵子、杉田護
    • 学会等名
      第57回日本植物生理学会年会
    • 発表場所
      岩手大学上田キャンパス
    • 年月日
      2016-03-18
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] ヒメツリガネゴケPPRタンパク質のRNA塩基認識の解析2016

    • 著者名/発表者名
      松田拓也、一瀬瑞穂、杉田護
    • 学会等名
      第57回日本植物生理学会年会
    • 発表場所
      岩手大学上田キャンパス
    • 年月日
      2016-03-18
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] Functional analysis of P-type PPR proteins in the moss Physcomitrella patens2016

    • 著者名/発表者名
      Goto, S., Kawaguchi, Y., Ichinose, M., Sugita, C., Sugita, M.
    • 学会等名
      IGER Annual meeting 2015
    • 発表場所
      Toyada Auditorium, Nagoya University
    • 年月日
      2016-01-08
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] ヒメツリガネゴケのRRMを持つ葉緑体RNA結合タンパク質の機能解析2015

    • 著者名/発表者名
      内山博道、一瀬瑞穂、杉田千恵子、杉田護
    • 学会等名
      日本植物学会第79回大会
    • 発表場所
      朱鷺メッセ:新潟コンベンションセンター
    • 年月日
      2015-09-06
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] ヒメツリガネゴケの葉緑体tRNAのスプライシングに関与する新規PPRタンパク質の同定2015

    • 著者名/発表者名
      後藤誠也、一瀬瑞穂、杉田千恵子、杉田護
    • 学会等名
      日本植物学会第79回大会
    • 発表場所
      朱鷺メッセ:新潟コンベンションセンター
    • 年月日
      2015-09-06
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] A PLS-type PPR protein is involved in RNA splicing of nad5 pre-mRNA in the moss Physcomitrella patens.2015

    • 著者名/発表者名
      Nakajima, K., Kawaguchi, Y., Ichinose, M., Sugita, C., Sugita, M.
    • 学会等名
      9th International Conference of Plant Mitochondrial Biology
    • 発表場所
      Wroclaw, Poland
    • 年月日
      2015-05-17
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 植物オルガネラRNA編集におけるDYWドメインの機能解析2015

    • 著者名/発表者名
      一瀬瑞穂、杉田 護
    • 学会等名
      第56回日本植物生理学会年会
    • 発表場所
      東京農業大学世田谷キャンパス
    • 年月日
      2015-03-17
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] パーティクルガンを用いたトランジェントアッセイによるヒメツリガネゴケの生物時計遺伝子の発現解析2015

    • 著者名/発表者名
      龍 昌志、一瀬瑞穂、樋口海杜、杉田 護、青木摂之
    • 学会等名
      第56回日本植物生理学会年会
    • 発表場所
      東京農業大学世田谷キャンパス
    • 年月日
      2015-03-16
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] ゼニゴケのタンパク質性RNase Pの解析2015

    • 著者名/発表者名
      杉田千恵子、西浜竜一、河内孝之、杉田護
    • 学会等名
      第56回日本植物生理学会年会
    • 発表場所
      東京農業大学世田谷キャンパス
    • 年月日
      2015-03-16
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] ヒメツリガネゴケのP-type PPRタンパク質の機能解析(2)2015

    • 著者名/発表者名
      後藤誠也、一瀬瑞穂、加藤歩美、杉田千恵子、杉田 護
    • 学会等名
      第56回日本植物生理学会年会
    • 発表場所
      東京農業大学世田谷キャンパス
    • 年月日
      2015-03-16
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] 植物オルガネラのPPRタンパク質とRNA編集2015

    • 著者名/発表者名
      一瀬瑞穂、杉田 護
    • 学会等名
      第17回オルガネラワークショプ「オルガネラ機能の最適化メカニズム」
    • 発表場所
      東京大学駒場キャンパス21KOMCEE WEST B1階レクチャーホール
    • 年月日
      2015-03-15
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] RNA編集におけるPPRタンパク質のDYWドメインの役割2015

    • 著者名/発表者名
      一瀬瑞穂、杉田 護
    • 学会等名
      第4回植物RNA研究者ネットワークシンポジウム
    • 発表場所
      京都大学理学部セミナーハウス
    • 年月日
      2015-01-19
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] オルガネラRNA編集におけるDYWドメインの役割2014

    • 著者名/発表者名
      一瀬瑞穂、杉田 護
    • 学会等名
      日本植物学会第78回大会
    • 発表場所
      明治大学生田キャンパス
    • 年月日
      2014-09-13
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] ヒメツリガネゴケのミトコンドリアのRNAスプライシングに働く新規のPLS-type PPRタンパク質の同定2014

    • 著者名/発表者名
      川口康弘、一瀬瑞穂、中島健策、杉田千恵子、杉田 護
    • 学会等名
      日本植物学会第78回大会
    • 発表場所
      明治大学生田キャンパス
    • 年月日
      2014-09-13
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] ヒメツリガネゴケの遺伝子ターゲティングによるPPR遺伝子ファミリーの機能解析2014

    • 著者名/発表者名
      一瀬瑞穂、杉田 護
    • 学会等名
      日本蘚苔類学会第43回大会(青森大会)
    • 発表場所
      青森県十和田市星野リゾート奥入瀬渓流ホテル
    • 年月日
      2014-08-27
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] ヒメツリガネゴケの3種類のタンパク質性RNase Pの解析2014

    • 著者名/発表者名
      杉田千恵子,田中惟睦,米谷一樹,香村吉洋,杉田 護
    • 学会等名
      第55回日本植物生理学会年会
    • 発表場所
      富山大学五福キャンパス
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] ヒメツリガネゴケの葉緑体RNA 編集因子の同定2014

    • 著者名/発表者名
      一瀬瑞穂,内田雅人,杉田 護
    • 学会等名
      第55回日本植物生理学会年会
    • 発表場所
      富山大学五福キャンパス
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] ヒメツリガネゴケの2 つのオルガネラ局在タンパク質性RNasePの解析2014

    • 著者名/発表者名
      田中惟睦,杉田千恵子,香村吉洋,杉田 護
    • 学会等名
      第55回日本植物生理学会年会
    • 発表場所
      富山大学五福キャンパス
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] ヒメツリガネゴケのP-type PPRタンパク質の機能解析2014

    • 著者名/発表者名
      川口康弘,一瀬瑞穂,杉田千恵子,杉田 護
    • 学会等名
      第55回日本植物生理学会年会
    • 発表場所
      富山大学五福キャンパス
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] 葉緑体局在PPRタンパク質がコケ原糸体細胞の分化に関与する2013

    • 著者名/発表者名
      後藤誠也、一瀬瑞穂、杉田千恵子、杉田 護
    • 学会等名
      第4回日本光合成学会年会およびシンポジウム
    • 発表場所
      名古屋大学野依記念学術交流館
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] Mamoru Sugita, Mizuho Ichinose, Chieko Sugita, Korechika Tanaka, Yasuhiro Kawaguchi, and Seiya Goto, Functional analysis of the pentatricopeptide repeat protein family in Physcomitrella patens.2013

    • 著者名/発表者名
      Mamoru Sugita, Mizuho Ichinose, Chieko Sugita, Korechika Tanaka, Yasuhiro Kawaguchi, and Seiya Goto
    • 学会等名
      16th International Conference MOSS 2013
    • 発表場所
      Masaryk Center, Prague, Czech Republic
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] 葉緑体局在PPRタンパク質がヒメツリガネゴケの原糸体細胞の分化に関与する2013

    • 著者名/発表者名
      後藤誠也、一瀬瑞穂、杉田千恵子、杉田 護
    • 学会等名
      日本植物学会第77回大会
    • 発表場所
      北海道大学
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] ヒメツリガネゴケのミトコンドリアccmFc mRNAの近接した2カ所のRNA編集部位に働くDYWサブクラスPPRタンパク質2013

    • 著者名/発表者名
      一瀬瑞穂、杉田千恵子、八木祐介、中村崇裕、杉田 護
    • 学会等名
      日本植物学会第77回大会
    • 発表場所
      北海道大学
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] Pentatricopeptide repeat (PPR) proteins in Physcomitrella patens2013

    • 著者名/発表者名
      Mizuho Ichinose, Chieko Sugita, Korechika Tanaka, Yasuhiro Kawaguchi, Seiya Goto, Akimi Takahashi and Mamoru Sugita
    • 学会等名
      CREST symposium, Regulation of photosynthesis and chloroplast function
    • 発表場所
      Kyoto University
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [図書] Web版光合成事典2015

    • 著者名/発表者名
      杉田 護、他115名
    • 出版者
      日本光合成学会
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [図書] 「光合成生物の進化と生命科学」(三村徹郎、川井浩史編)2014

    • 著者名/発表者名
      杉田 護、他11名
    • 総ページ数
      194
    • 出版者
      培風館
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [図書] Chloroplast Biotechnology: Methods and Protocols (Pal Maliga, ed.), Methods in Molecular Biology, Vol. 132, Springer Protocols2014

    • 著者名/発表者名
      Sugita, M.
    • 総ページ数
      542
    • 出版者
      Humana Press
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [図書] Plastid Development in Leaves during Growth and Senescence (eds. Basanti Biswal, Karin Krupinska and Udaya C. Biswal), Advances in Photosynthesis and Respiration 362013

    • 著者名/発表者名
      Kanamaru, K. and Sugita, M.
    • 総ページ数
      685
    • 出版者
      Springer
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [備考] 名古屋大学大学院理学研究科生命理学専攻ホームページ、論文紹介

    • URL

      http://www.bio.nagoya-u.ac.jp/paper/index.html

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書 2014 実績報告書
  • [備考] 名古屋大学遺伝子実験施設・杉田研究室ホームページ、論文リスト

    • URL

      http://www.gene.nagoya-u.ac.jp/~sugita-g/ronbun.html

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [備考] 杉田研究室ホームページ論文リスト

    • URL

      http://www.gene.nagoya-u.ac.jp/~sugita-g/ronbun.html

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [備考] Web版光合成事典

    • URL

      http://photosyn.jp/pwiki/index.php?FrontPage

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [備考] 杉田研究室ホームページ、論文リスト

    • URL

      http://www.gene.nagoya-u.ac.jp/~sugita-g/ronbun.html

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [備考] 名古屋大学大学院理学研究科生命理学専攻ホームページ、論文紹介

    • URL

      http://www.bio.nagoya-u.ac.jp/paper/index.html

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書

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公開日: 2013-05-21   更新日: 2019-07-29  

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