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植物の超塩基性土壌への適応進化:シュンジュギクの比較ゲノム解析

研究課題

研究課題/領域番号 25291085
研究種目

基盤研究(B)

配分区分一部基金
応募区分一般
研究分野 生物多様性・分類
研究機関東京大学

研究代表者

伊藤 元己  東京大学, 大学院総合文化研究科, 教授 (00193524)

研究分担者 阪口 翔太  京都大学, 人間・環境学研究科(研究院), 助教 (50726809)
土松 隆志  千葉大学, 理学(系)研究科(研究院), 准教授 (60740107)
青木 誠志郎  東京大学, 総合文化研究科, 学術研究員 (10334301)
森長 真一  東京大学, 総合文化研究科, 助教 (80568262)
研究協力者 石川 直子  
研究期間 (年度) 2013-04-01 – 2017-03-31
研究課題ステータス 完了 (2016年度)
配分額 *注記
17,810千円 (直接経費: 13,700千円、間接経費: 4,110千円)
2015年度: 4,940千円 (直接経費: 3,800千円、間接経費: 1,140千円)
2014年度: 5,200千円 (直接経費: 4,000千円、間接経費: 1,200千円)
2013年度: 7,670千円 (直接経費: 5,900千円、間接経費: 1,770千円)
キーワード適応進化 / 比較ゲノム / ミヤマヨメナ / シュンジュギク / 蛇紋岩 / 種分化
研究成果の概要

本研究では、蛇紋岩植物であるシュンジュギクについて、その進化の遺伝的背景および土壌適応の分子機構を明らかにするための解析を行った。
ミヤマヨメナとシュンジュギクを含む38集団について、核SSRによる集団構造解析を行った。解析の結果、全体は地理的なまとまりを持つ3つのグループに分かれることが明らかになった。またシュンジュギクは、少なくとも愛知と三重・高知で2回独立に平行進化したことが示唆された。また、RNA-seqによるリファレンス作成と多型検出、遺伝子発現プロファイルの比較を行った結果、重金属耐性に関わると思われるGOを持つ遺伝子を探索した所FRD3が候補に上がった。

報告書

(5件)
  • 2016 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2015 実績報告書
  • 2014 実績報告書
  • 2013 実績報告書
  • 研究成果

    (9件)

すべて 2017 2016 2015 2014

すべて 雑誌論文 (3件) (うち査読あり 3件、 オープンアクセス 2件、 謝辞記載あり 1件) 学会発表 (6件)

  • [雑誌論文] Development and characterization of SSR marker for Aster savatieri (Asteraceae)2016

    • 著者名/発表者名
      Ishikawa, N., Sakaguchi, S.,Ito, M.
    • 雑誌名

      Applications in Plant Sciences

      巻: 4

    • NAID

      120006346267

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Development and Characterization of EST-SSR Markers for the Solidago virgaurea Complex (Asteraceae) in the Japanese Archipelago.2014

    • 著者名/発表者名
      Sakaguchi, S. and Ito, M.
    • 雑誌名

      Applications in Plant Sciences

      巻: 2 号: 7 ページ: 1400035-1400035

    • DOI

      10.3732/apps.1400035

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Variation in floral morphology within a population of Aster hispidus var. tubulosus (Asteraceae, Astereae).2014

    • 著者名/発表者名
      Nakagawa, S. and Ito, M.
    • 雑誌名

      Plant Species Biol.

      巻: - 号: 3 ページ: 287-293

    • DOI

      10.1111/1442-1984.12027

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] ミヤマヨメナにおける矮性型進化と土壌適応に関する遺伝子発現解析2017

    • 著者名/発表者名
      石川直子・阪口翔太・横山政昭・福島慶太郎・伊藤元己
    • 学会等名
      日本生態学会第64回大会
    • 発表場所
      早稲田大学(東京都新宿区)
    • 年月日
      2017-03-14
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] ゲノムワイド塩基配列多型検出のためのMIG-seq法試料として、さく葉標本から抽出したDNAは使用可能か?2017

    • 著者名/発表者名
      伊藤元己・加藤俊英・森重剛志・上原浩一・海老原淳・綱本良啓・満行知花・陶山佳久
    • 学会等名
      日本植物分類学会第16回大会
    • 発表場所
      京都大学(京都府京都市左京区)
    • 年月日
      2017-03-10
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] キク科蛇紋岩植物のトランスクリプトーム解析2016

    • 著者名/発表者名
      石川直子, 西尾紗恵, 横山政昭, 阪口翔太, 永野惇, 本庄三恵, 工藤洋, 伊藤元己
    • 学会等名
      日本生態学会
    • 発表場所
      仙台国際センター(仙台市青葉区)
    • 年月日
      2016-03-21
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] 蛇紋岩植物シュンジュギクの土壌適応2016

    • 著者名/発表者名
      石川直子, 阪口翔太, 横山政昭, 福島慶太郎,伊藤元己
    • 学会等名
      日本植物分類学会
    • 発表場所
      富山大学(富山市)
    • 年月日
      2016-03-06
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] 蛇紋岩植物シュンジュギクの遺伝構造解析 ー蛇紋岩土壌適応形質の進化について2015

    • 著者名/発表者名
      石川直子、森下洋子、阪口翔太、伊藤元己
    • 学会等名
      日本生態学会
    • 発表場所
      鹿児島大学( 鹿児島県鹿児島市)
    • 年月日
      2015-03-18 – 2015-03-22
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] 蛇紋岩植物の進化ーシュンジュギクとミヤマヨメナの遺伝構造解析2015

    • 著者名/発表者名
      石川直子、森下洋子、阪口翔太、伊藤元己
    • 学会等名
      日本植物分類学会
    • 発表場所
      福島大学( 福島県福島市)
    • 年月日
      2015-03-06 – 2015-03-08
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書

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公開日: 2013-05-21   更新日: 2019-07-29  

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