外来種の侵略性に関る遺伝的基盤の解明

• 研究課題/領域番号: 25291096
• 研究種目: 基盤研究(B)
• 配分区分: 一部基金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 生態・環境
• 研究機関: 東北大学
• 研究代表者: 牧野 能士 東北大学, 生命科学研究科, 准教授 (20443442)
• 連携研究者: 河田 雅圭 東北大学, 大学院生命科学研究科, 教授 (90204734)
• 研究期間 (年度): 2013-04-01 – 2016-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2015年度)
• 配分額: 17,810千円 (直接経費: 13,700千円、間接経費: 4,110千円); 2015年度: 5,720千円 (直接経費: 4,400千円、間接経費: 1,320千円); 2014年度: 5,720千円 (直接経費: 4,400千円、間接経費: 1,320千円); 2013年度: 6,370千円 (直接経費: 4,900千円、間接経費: 1,470千円)
• キーワード: 遺伝子重複 / 外来種 / 適応力 / 進化生態 / ゲノム / 環境適応

研究成果の概要

生物が持つ適応力は種によって異なる。本研究は、重複遺伝子保持率から生物が持つ環境適応力を予測する手法の確立を目指し、動物ゲノムの重複遺伝子保持率と生態的特徴の関係を調査した。本研究で侵略的外来種アメリカザリガニの全ゲノム配列決定し、本種を加えたゲノム配列既知の動物を対象にした比較ゲノム解析により、侵略的外来種の重複遺伝子保持率が高いことを明らかにした。重複遺伝子保持率と環境適応力との関連を強く支持するものであり、ゲノム配列情報からの環境適応力評価への応用が期待される。

研究成果

• [雑誌論文] Contribution of non-ohnologous duplicated genes to high habitat variability in mammals (2014)
  • 著者名/発表者名: Tamate C.S., Kawata M., Makino T.
  • 雑誌名: Molecular Biology and Evolution 巻: 31 号: 7 ページ: 1779-1786
  • DOI: 10.1093/molbev/msu128
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] 重複遺伝子が生み出す生命システムのロバストネス (2014)
  • 著者名/発表者名: 牧野能士
  • 雑誌名: 細胞工学 巻: 33 ページ: 73-78
• [雑誌論文] Ohnologs are overrepresented in pathogenic copy number mutations (2014)
  • 著者名/発表者名: McLysaght, A., Makino, T., Grayton, H., Tropeano, M., Mitchell, K., Vassos, E. and Collier, DA.
  • 雑誌名: PNAS 巻: 111 号: 1 ページ: 361-366
  • DOI: 10.1073/pnas.1309324111
  • 査読あり
• [雑誌論文] Contribution of non-ohnologous duplicated genes to high habitat variability in mammals (2014)
  • 著者名/発表者名: Tamate, C.S., Kawata, M. and Makino, T.
  • 雑誌名: Molecular Biology and Evolution 巻: 印刷中
  • 査読あり
• [雑誌論文] Genome-wide deserts for copy number variation in vertebrates. (2013)
  • 著者名/発表者名: Makino, T., McLysaght, A. and Kawata, M.
  • 雑誌名: Nature Communications 巻: 4 号: 1 ページ: 2283-2283
  • DOI: 10.1038/ncomms3283
  • 査読あり
• [学会発表] Genome-wide deserts for copy number variation in vertebrates (2014)
  • 著者名/発表者名: Makino, T.
  • 学会等名: Plant and Animal Genomics XXII
  • 発表場所: サンディエゴ, アメリカ
  • 招待講演
• [学会発表] Genome-wide deserts for copy number variation in vertebrates (2014)
  • 著者名/発表者名: Makino, T.
  • 学会等名: SMBE Satellite Meeting: The Causes of Genome Evolution
  • 発表場所: 静岡県三島市
  • 招待講演
• [備考] ホームページ
  • URL: http://meme.biology.tohoku.ac.jp/klabo-wiki/index.php?%CB%D2%CC%EE%C7%BD%BB%CE
• [備考] 牧野能士のページ
  • URL: http://meme.biology.tohoku.ac.jp/klabo-wiki/index.php?%CB%D2%CC%EE%C7%BD%BB%CE