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活性型転移因子がイネのエピゲノムにおよぼす効果の解明と育種への応用

研究課題

研究課題/領域番号 25292006
研究種目

基盤研究(B)

配分区分一部基金
応募区分一般
研究分野 遺伝育種科学
研究機関近畿大学 (2016)
京都大学 (2013-2015)

研究代表者

築山 拓司  近畿大学, 農学部, 准教授 (00423004)

研究分担者 奥本 裕  京都大学, (連合)農学研究科(研究院), 教授 (90152438)
寺石 政義  京都大学, (連合)農学研究科(研究院), 講師 (80378819)
齊藤 大樹  京都大学, (連合)農学研究科(研究院), 助教 (10536238)
研究期間 (年度) 2013-04-01 – 2017-03-31
研究課題ステータス 完了 (2016年度)
配分額 *注記
18,850千円 (直接経費: 14,500千円、間接経費: 4,350千円)
2016年度: 3,250千円 (直接経費: 2,500千円、間接経費: 750千円)
2015年度: 3,120千円 (直接経費: 2,400千円、間接経費: 720千円)
2014年度: 5,980千円 (直接経費: 4,600千円、間接経費: 1,380千円)
2013年度: 6,500千円 (直接経費: 5,000千円、間接経費: 1,500千円)
キーワード転移因子 / イネ / エピジェネティクス / エピジェネティック
研究成果の概要

本研究において、①イネ活性型転移因子mPingは、自身とその近傍配列をメチル化することで選択的スプライシングを誘導すること、②mPingはメチル化されるものの、自律性因子PingのORF1がコードするMyb様タンパク質との結合が妨げられないこと、および③mPing転移を誘導するPingの時期・組織特異的発現は、Ping-ORF1に存在するSNPもしくはPingの位置・量的効果によって制御されていることが明らかとなった。これらの成果は、mPingは、宿主によるエピジェネティックな制御を回避することで、自身のコピー数を増やすとともに、宿主ゲノムに多様性を付与していることを示唆している。

報告書

(5件)
  • 2016 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2015 実績報告書
  • 2014 実績報告書
  • 2013 実績報告書
  • 研究成果

    (12件)

すべて 2016 2015 2014 2013

すべて 雑誌論文 (5件) (うち査読あり 4件、 謝辞記載あり 1件、 オープンアクセス 2件) 学会発表 (7件)

  • [雑誌論文] The active miniature inverted-repeat transposable element mPing posttranscriptionally produces new transcriptional variants in the rice genome2015

    • 著者名/発表者名
      Rise Kum, Takuji Tsukiyama, Haruka Inagaki, Hiroki Saito, Masayoshi Teraishi, Yutaka Okumoto, Takatoshi Tanisaka
    • 雑誌名

      Molecular Breeding

      巻: 35 号: 8 ページ: 159-159

    • DOI

      10.1007/s11032-015-0353-y

    • NAID

      120005674594

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] イネユビキチン様タンパク質遺伝子Rurm1がメチルビオロゲンによって誘導される酸化ストレス応答におよぼす効果2015

    • 著者名/発表者名
      河西恵、築山拓司、寺石政義、奥本裕、谷坂隆俊
    • 雑誌名

      作物研究

      巻: 60 ページ: 55-57

    • NAID

      110010039623

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] トランスポゾンによる変異創生とその育種への応用2015

    • 著者名/発表者名
      金澤章、深井英吾、宮尾安藝雄、佐瀬英俊、築山拓司
    • 雑誌名

      育種学研究

      巻: 17 ページ: 77-87

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • オープンアクセス
  • [雑誌論文] Early embryogenesis-specific expression of the rice transposon Ping enhances amplification of the MITE mPing2014

    • 著者名/発表者名
      Teramoto S., Tsukiyama T., Okumoto Y., Tanisaka T.
    • 雑誌名

      PLOS Genetics

      巻: 未定

    • NAID

      120005458284

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Transient Dual-Luciferase Assay Combined with a Glucocorticoid-Inducible System for Rice Protoplasts2013

    • 著者名/発表者名
      Hamamoto Y., Tsukiyama T., Yoshitake Y., Teraishi M., Okumoto Y., Tanisaka T.
    • 雑誌名

      Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry

      巻: 77 号: 12 ページ: 2480-2482

    • DOI

      10.1271/bbb.130480

    • NAID

      130003381948

    • ISSN
      0916-8451, 1347-6947
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] イネゲノムにおける転移因子を介した選択的スプライシング2016

    • 著者名/発表者名
      築山拓司、琴梨世、稲垣晴香、齊藤大樹、寺石政義、奥本裕、谷坂隆俊
    • 学会等名
      イネ遺伝学・分子生物学ワークショップ2016
    • 発表場所
      名古屋大学
    • 年月日
      2016-07-04
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] DNAメチル化がイネ自律性転移因子Pingの結合能におよぼす効果2016

    • 著者名/発表者名
      築山拓司、小野原一暢、田中幹也、齊藤大樹、奥本裕、寺石政義、井上國世、谷坂隆俊
    • 学会等名
      一般社団法人日本育種学会第129回講演会
    • 発表場所
      横浜市立大学
    • 年月日
      2016-03-21
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] 活性型トランスポゾンを利用した新しい育種法の開発2014

    • 著者名/発表者名
      築山拓司
    • 学会等名
      日本育種学会第126回講演会
    • 発表場所
      南九州大学
    • 年月日
      2014-09-26 – 2014-09-27
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] イネトランスポゾンmPingの転移活性を制御する因子の探索2014

    • 著者名/発表者名
      寺本翔太、築山拓司、谷坂隆俊、奥本裕
    • 学会等名
      日本育種学会第126回講演会
    • 発表場所
      南九州大学
    • 年月日
      2014-09-26 – 2014-09-27
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Loss-of-function of an ubiquitin-related modifier RURM1 promotes the mobilization of the active MITE mPing2013

    • 著者名/発表者名
      Tsukiyama T., Teramoto S., Yasuda K., Horibata A., Mori N., Okumoto Y., Teraishi M., Saito H., Onishi A., Tamura K., Tanisaka T.
    • 学会等名
      7th International Rice Genetic Symposium
    • 発表場所
      Manila
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] イネ品種銀坊主におけるmPing転移は時期・組織特異的なPingの発現上昇を伴う2013

    • 著者名/発表者名
      寺本翔太、築山拓司、寺石政義、谷坂隆俊、奥本裕
    • 学会等名
      日本育種学会第124回講演会
    • 発表場所
      鹿児島大学
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] イネRURM1によるtRNAの硫黄修飾を介したタ ンパク質翻訳効率の制御2013

    • 著者名/発表者名
      濵本有希、築山拓司、清水顕史、寺石政義、谷坂隆俊、奥本裕
    • 学会等名
      日本育種学会第124回講演会
    • 発表場所
      鹿児島大学
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書

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公開日: 2013-05-21   更新日: 2020-01-20  

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