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大容量塩基配列に基づくハダニ類の系統解析と近縁種の簡易識別法の開発

研究課題

研究課題/領域番号 25292033
研究種目

基盤研究(B)

配分区分一部基金
応募区分一般
研究分野 植物保護科学
研究機関茨城大学

研究代表者

後藤 哲雄  茨城大学, 農学部, 教授 (60178449)

研究分担者 鈴木 美穂  基礎生物学研究所, 形態形成研究部門, 特別研究員 (80548470)
野田 博明  国立研究開発法人農業生物資源研究所, 昆虫科学研究領域, 研究専門員 (40343991)
研究期間 (年度) 2013-04-01 – 2017-03-31
研究課題ステータス 完了 (2016年度)
配分額 *注記
18,720千円 (直接経費: 14,400千円、間接経費: 4,320千円)
2016年度: 3,380千円 (直接経費: 2,600千円、間接経費: 780千円)
2015年度: 3,640千円 (直接経費: 2,800千円、間接経費: 840千円)
2014年度: 4,550千円 (直接経費: 3,500千円、間接経費: 1,050千円)
2013年度: 7,150千円 (直接経費: 5,500千円、間接経費: 1,650千円)
キーワードダニ・線虫管理 / 系統関係 / 系統解析 / トランスクリプトーム解析
研究成果の概要

ハダニ類の分子系統解析は、ミトコンドリアDNAや核rRNAで行われてきたが、ブートストラップ値が低く、属間関係は不明瞭であった。本研究では、ハダニ類15属87種88系統について次世代シークエンサーによるトランスクリプトーム解析を行い、88系統に共通するオーソログ遺伝子652個を得た。これらによる分子系統解析は、従来の系統樹と矛盾せず、かつほぼすべての分岐(67/70 nodes)が高いブートストラップ値で支持された。また15属中4属が単系統にならなかったので、ハダニ類の系統上の近縁性を反映した分類体系を構築するには、分類形質の再検討が必要であることが示唆された。

報告書

(5件)
  • 2016 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2015 実績報告書
  • 2014 実績報告書
  • 2013 実績報告書
  • 研究成果

    (18件)

すべて 2017 2016 2015 2014 2013

すべて 雑誌論文 (3件) (うち国際共著 1件、 査読あり 3件、 オープンアクセス 2件、 謝辞記載あり 3件) 学会発表 (15件) (うち国際学会 1件、 招待講演 1件)

  • [雑誌論文] Molecular identification of seven species of the genus Stigmaeopsis (Acari: Tetranychidae) and preliminary attempts to establish their phylogenetic relationship2017

    • 著者名/発表者名
      Sakamoto, H., T. Matsuda, R. Suzuki, Y. Saito, J.-Z. Lin, Y.-X. Zhang, Y. Sato and T. Gotoh
    • 雑誌名

      Systematic and Applied Acarology

      巻: 22 号: 1 ページ: 91-101

    • DOI

      10.11158/saa.22.1.10

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] The Ciona intestinalis cleavage clock is independent of DNA methylation. Genomics2016

    • 著者名/発表者名
      Suzuki MM, Mori T, Satoh N
    • 雑誌名

      Genomics

      巻: 108 号: 3-4 ページ: 168-176

    • DOI

      10.1016/j.ygeno.2016.10.001

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Phylogenetic analysis of the sub-family Tetranychinae (Acari: Tetranychidae) with a focus on the tribe Tetranychini indicates that several genera are polyphyletic based on the mitochondrial COI gene and the 18S and 5' end of 28S rRNA genes2014

    • 著者名/発表者名
      Matsuda, T., M. Morishita, N. Hinomoto and T. Gotoh
    • 雑誌名

      PLoS ONE

      巻: 9 (10): e108672 号: 10 ページ: 1-12

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0108672

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [学会発表] direct PCR技術の利用によるハダニ類の簡易同定の迅速2017

    • 著者名/発表者名
      坂本洋典・後藤哲雄
    • 学会等名
      第61回日本応用動物昆虫学会大会
    • 発表場所
      東京農工大学
    • 年月日
      2017-03-28
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] ハダニ類の簡易同定をたやすくする直接的PCR手法の開発2016

    • 著者名/発表者名
      坂本洋典・後藤哲雄
    • 学会等名
      第25回日本ダニ学会大会
    • 発表場所
      北海道立道民活動センター かでる2・7
    • 年月日
      2016-10-16
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] ナミハダニのゲノム情報を活かした簡易同定用プライマーの再検討2016

    • 著者名/発表者名
      後藤哲雄・坂本洋典
    • 学会等名
      第25回日本ダニ学会大会
    • 発表場所
      北海道立道民活動センター かでる2・7
    • 年月日
      2016-10-16
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] The biological function of invertebrate DNA methylation in pre-mRNA processing2015

    • 著者名/発表者名
      Suzuki, M.
    • 学会等名
      第38回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      神戸市
    • 年月日
      2015-12-01
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Phylogenetic analysis of the spider mite sub-family Tetranychinae (Acari: Tetranychidae)2015

    • 著者名/発表者名
      Gotoh, T. and T. Matsuda
    • 学会等名
      The 3rd Asia-Pacific Conference on Life Science and Engineering
    • 発表場所
      Chiang Mai, Thailand
    • 年月日
      2015-11-19
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] クリノツメハダニのWolbachiaおよびCardinium感染がミトコンドリアDNAの多様性に及ぼす影響2015

    • 著者名/発表者名
      鈴木玲子・松田朋子・北嶋康樹・後藤哲雄
    • 学会等名
      第59回日本応用動物昆虫学会大会
    • 発表場所
      山形大学
    • 年月日
      2015-03-27 – 2015-03-28
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Eotetranychus属とSchizotetranychus属のDNA塩基配列による種の識別2015

    • 著者名/発表者名
      鈴木ちとせ・松田朋子・森下真衣子・後藤哲雄
    • 学会等名
      第59回日本応用動物昆虫学会大会
    • 発表場所
      山形大学
    • 年月日
      2015-03-27 – 2015-03-28
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] DNA塩基配列に基づくハダニ類の種の識別と系統関係の推定2015

    • 著者名/発表者名
      松田朋子
    • 学会等名
      第59回日本応用動物昆虫学会大会
    • 発表場所
      山形大学
    • 年月日
      2015-03-27
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Panonychus 属およびSasanychus 属ハダニのDNAによる種の識別と系統関係2014

    • 著者名/発表者名
      松田朋子・X.-Y. Hong・T. Abramishvili・T. Arabuli・後藤 哲雄
    • 学会等名
      第23回日本ダニ学会大会
    • 発表場所
      アイーナ(いわて県民情報交流センター)
    • 年月日
      2014-10-19
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] トランスクリプトームに基づくハダニ科の分子系統関係の推定2014

    • 著者名/発表者名
      松田朋子・鈴木美穂・野田博明・石井一夫・古崎利紀・後藤哲雄
    • 学会等名
      第58回日本応用動物昆虫学会大会
    • 発表場所
      高知大学(高知県)
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] Stigmaeopsis属ハダニ7種のDNA塩基配列による種の識別2014

    • 著者名/発表者名
      鈴木玲子・松田朋子・J.-Z. Lin・J. Ji・Y.-X. ・Zhan・齋藤 裕・後藤哲雄
    • 学会等名
      第58回日本応用動物昆虫学会大会
    • 発表場所
      高知大学(高知県)
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] トランスクリプトームの網羅的解析によるハダニ類の分子系統推定2013

    • 著者名/発表者名
      松田朋子・鈴木美穂・野田博明・石井一夫・古崎利紀・後藤哲雄
    • 学会等名
      第22回日本ダニ学会大会
    • 発表場所
      静岡県総合研修所もくせい会館(静岡県)
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] Molecular phylogeny of spider mites (Acari: Tetranychidae) inferred from 18S and 28S ribosomal RNA sequences2013

    • 著者名/発表者名
      Matsuda, T., M. Morishita, Y. Kitashima, N. Hinomoto and T. Gotoh
    • 学会等名
      2nd Global Conference on Entomology
    • 発表場所
      Four Point Kuchin (Malaysia)
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] ビッグデータ解析を利用したモンテカルロ法による分子進化の分枝図作成最適化法2013

    • 著者名/発表者名
      石井一夫・松田朋子・古崎利紀・後藤哲雄
    • 学会等名
      科学研究費補助金によるシンポジウム 「高次元データ解析の理論と方法論、及び、関連分野への応用」
    • 発表場所
      筑波大学(茨城県)
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] モンテカルロ法を用いた進化分岐図作成法2013

    • 著者名/発表者名
      石井一夫・松田朋子・古崎利紀・後藤哲雄
    • 学会等名
      第96回MPS・第36回BIO合同研究発表会
    • 発表場所
      東京工業大学(東京都)
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書

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公開日: 2013-05-21   更新日: 2019-07-29  

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