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スフィンゴモナス細菌群の新規物質代謝能力獲得を司る機構の解明とその応用

研究課題

研究課題/領域番号 25292043
研究種目

基盤研究(B)

配分区分一部基金
応募区分一般
研究分野 応用微生物学
研究機関東北大学

研究代表者

永田 裕二  東北大学, 生命科学研究科, 准教授 (30237531)

研究分担者 津田 雅孝  東北大学, 大学院生命科学研究科, 教授 (90172022)
大坪 嘉行  東北大学, 大学院生命科学研究科, 助教 (40342761)
研究協力者 Jiri Damborsky  マサリク大学, 理学部, 教授
Zbynek Prokop  マサリク大学, 理学部, 准教授
田之倉 優  東京大学, 大学院農学生命科学研究科, 教授 (60136786)
岡井 公彦  東京海洋大学, 大学院海洋科学技術研究科, 助教 (00596562)
研究期間 (年度) 2013-04-01 – 2016-03-31
研究課題ステータス 完了 (2015年度)
配分額 *注記
17,420千円 (直接経費: 13,400千円、間接経費: 4,020千円)
2015年度: 4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円)
2014年度: 4,940千円 (直接経費: 3,800千円、間接経費: 1,140千円)
2013年度: 8,320千円 (直接経費: 6,400千円、間接経費: 1,920千円)
キーワードスフィンゴモナス / 環境汚染物質 / 可動性遺伝因子 / ゲノム / 進化
研究成果の概要

スフィンゴモナス細菌群が有する特殊能力である難分解性環境汚染物質gamma-hexachlorocyclohexane分解資化能の獲得機構に着目した研究を実施し、(i) 鍵となる分解酵素が変異の蓄積で活性を段階的に変化させること、(ii) スフィンゴモナス特有のプラスミドや特定の挿入配列が新規遺伝子の獲得に重要な役割を担っていること、(iii) スフィンゴモナス細菌群が難分解性物質代謝に適した遺伝的背景を有していること、などを明示し、将来的な応用にも繋がる細菌の新規能力獲得に関する重要な知見を得た。

報告書

(4件)
  • 2015 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2014 実績報告書
  • 2013 実績報告書
  • 研究成果

    (103件)

すべて 2016 2015 2014 2013

すべて 雑誌論文 (26件) (うち査読あり 26件、 オープンアクセス 14件、 謝辞記載あり 4件) 学会発表 (74件) (うち国際学会 1件、 招待講演 2件) 図書 (3件)

  • [雑誌論文] Complete genome sequence of Methylobacterium sp. strain AMS5, an isolate from a soybean stem2016

    • 著者名/発表者名
      Tomoyuki Minami, Yoshiyuki Ohtsubo, Mizue Anda, Yuji Nagata, Masataka Tsuda, Hisayuki Mitsui, Masayuki Sugawara, Kiwamu Minamisawa
    • 雑誌名

      Genome Announc.

      巻: 4(2) 号: 2

    • DOI

      10.1128/genomea.00144-16

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Complete genome sequence of a gamma-hexachlorocyclohexane-degrading bacterium Sphingobium sp. strain MI12052016

    • 著者名/発表者名
      Tabata M, Ohhata S, Nikawadori Y, Sato T, Kishida K, Ohtsubo Y, Tsuda M, Nagata Y
    • 雑誌名

      Genome Announcements

      巻: 4 号: 2

    • DOI

      10.1128/genomea.00246-16

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Complete Genome sequence of a gamma-hexachlorocyclohexane degrader, Sphingobium sp. Strain TKS, which was isolated from a gamma-hexachlorocyclohexane-degrading microbial community2016

    • 著者名/発表者名
      Tabata M, Ohhata S, Kawasumi T, Nikawadori Y, Kishida K, Sato T, Ohtsubo Y, Tsuda M, Nagata Y
    • 雑誌名

      Genome Announcements

      巻: 4 号: 2

    • DOI

      10.1128/genomea.00247-16

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Complete genome sequence of a phenanthrene degrader, Mycobacterium sp. strain EPa45 (NBRC 110737), isolated from a phenanthrene-degrading consortium.2015

    • 著者名/発表者名
      Kato H, Ogawa N, Ohtsubo Y, Oshima K, Toyoda A, Mori H, Nagata Y, Kurokawa K, Hattori M, Fujiyama A, Tsuda M
    • 雑誌名

      Genome Announcements

      巻: 3 号: 4

    • DOI

      10.1128/genomea.00782-15

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Complete genome sequence of a polyvinyl alcohol-degrading strain Sphingopyxis sp. 113P3 (NBRC 111507)2015

    • 著者名/発表者名
      Ohtsubo Y, Nagata, Y. Numata M, Tsuchikane K, Hosoyama A, Yamazoe A, Tsuda M, Fujita N, Kawai F
    • 雑誌名

      Genome Announcements

      巻: 3 号: 5

    • DOI

      10.1128/genomea.01169-15

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Time-series metagenomic analysis reveals robustness of soil microbiome against chemical disturbance.2015

    • 著者名/発表者名
      Kato H, Mori H, Maruyama F, Toyoda A, Oshima K, Endo R, Fuchu G, Miyakoshi M, Dozono A, Ohtsubo Y, Nagata Y, Hattori M, Fujiyama A, Kurokawa K, Tsuda M
    • 雑誌名

      DNA Research

      巻: 22 号: 6 ページ: 413-424

    • DOI

      10.1093/dnares/dsv023

    • NAID

      120005850199

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Complete genome sequence of a phenanthrene degrader Burkholderia sp. HB-1 (NBRC:110738)2015

    • 著者名/発表者名
      Ohtsubo Y, Moriya A, Kato H, Ogawa N, Nagata Y, Tsuda M
    • 雑誌名

      Genome Announcements

      巻: 3 号: 6

    • DOI

      10.1128/genomea.01283-15

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Complete genome sequence of a polypropylene glycol and polyethylene glycol-degrading strain Sphingopyxis macrogoltabida EY-12015

    • 著者名/発表者名
      Ohtsubo Y, Nagata, Y, Numata M, Tsuchikane K, Hosoyama A, Yamazoe A, Tsuda M, Fujita N, Kawai F
    • 雑誌名

      Genome Announcements

      巻: 3 号: 6

    • DOI

      10.1128/genomea.01399-15

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Complete genome sequence of a polypropylene glycol-degrading strain Microbacterium sp. No.72015

    • 著者名/発表者名
      Ohtsubo Y, Nagata, Y, Numata M, Tsuchikane K, Hosoyama A, Yamazoe A, Tsuda M, Fujita N, Kawai F
    • 雑誌名

      Genome Announcements

      巻: 3 号: 6

    • DOI

      10.1128/genomea.01400-15

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Complete genome sequence of Sphingompyxis macrogoltabidus type strain NBRC 15033, originally isolated as a polyethylene glycol-degrader2015

    • 著者名/発表者名
      Ohtsubo Y, Nagata, Y, Numata M, Tsuchikane K, Hosoyama A, Yamazoe A, Tsuda M, Fujita N, Kawai F
    • 雑誌名

      Genome Announcements

      巻: 3 号: 6

    • DOI

      10.1128/genomea.01401-15

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Bacterial clade with the ribosomal RNA operon on a small plasmid rather than the chromosome2015

    • 著者名/発表者名
      Mizue Anda, Yoshiyuki Ohtsubo, Takashi Okubo, Masayuki Sugawara, Yuji Nagata, Masataka Tsuda, Kiwamu Minamisawa, and Hisayuki Mitsui
    • 雑誌名

      Proc Natl Acad Sci U S A.

      巻: 112(46) 号: 46 ページ: 14343-14347

    • DOI

      10.1073/pnas.1514326112

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Properties and biotechnological applications of natural and engineered haloalkane dehagoneases2015

    • 著者名/発表者名
      Nagata Y, Ohtsubo, Y, Tsuda M
    • 雑誌名

      Applied Microbiology and Biotechnology

      巻: 99 号: 23 ページ: 9865-9881

    • DOI

      10.1007/s00253-015-6954-x

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Isolation of oxygenase genes for indigo-forming activity from an artificially polluted soil metagenome by functional screening using Pseudomonas putida strains as hosts2015

    • 著者名/発表者名
      Hifofumi Nagayama, Tomonori Sugawara, Ryo Endo, Akira Ono, Hiromi Kato, Yoshiyuki Ohtsubo, Yuji Nagata, and Masataka Tsuda
    • 雑誌名

      Applied Microbiology and Biotechnology

      巻: in press 号: 10 ページ: 4453-4470

    • DOI

      10.1007/s00253-014-6322-2

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Identification of Burkholderia multivorans ATCC 17616 genetic determinants for fitness in soil by using signature-tagged mutagenesis. Microbiology2014

    • 著者名/発表者名
      Nagata, Y., J. Senbongi, Y. Ishibashi, R. Sudo, M. Miyakoshi, Y. Ohtsubo, and M. Tsuda
    • 雑誌名

      Microbiology

      巻: in press 号: 5 ページ: 883-891

    • DOI

      10.1099/mic.0.077057-0

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structural and Functional Analysis of Novel Haloalkane Dehalogenase with Two Halide-Binding Sites2014

    • 著者名/発表者名
      Chaloupkova R, Prudnikova T, Rezacova P, Prokop Z, Koudelakova T, Daniel L, Brezovsky J, Ikeda-Ohtsubo W, Sato Y, Kuty M, Nagata Y, Smatanova IK, Damborsky J
    • 雑誌名

      Acta Crystallographica Section D

      巻: D70 号: 7 ページ: 1884-1897

    • DOI

      10.1107/s1399004714009018

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Stepwise enhancement of catalytic performance of haloalkane dehalogenase LinB towards β-hexachlorocyclohexane2014

    • 著者名/発表者名
      Ryota Moriuchi, Hiroki Tanaka, Yuki Nikawadori, Mayuko Ishitsuka, Michihiro Ito, Yoshiyuki Ohtsubo, Masataka Tsuda, Jiri Damborsky, Zbynek Prokop, and Yuji Nagata
    • 雑誌名

      AMB Express

      巻: 4 号: 1 ページ: 72-72

    • DOI

      10.1186/s13568-014-0072-5

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Complete genome sequence of Pseudomonas aeruginosa MTB-1 isolated from a microbial community enriched by the technical formulation of hexachlorocyclohexane.2014

    • 著者名/発表者名
      Ohtsubo, Y., T. Sato, K. Kishida, M. Tabata, Y. Ogura, T. Hayashi, M. Tsuda, and Y. Nagata
    • 雑誌名

      Genome Announcements

      巻: 2 号: 1

    • DOI

      10.1128/genomea.01130-13

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Complete genome sequence of the thermophilic PCB degrader Geobacillus sp. JF8 (NBRC 109937)2014

    • 著者名/発表者名
      Shintani, M., Y. Ohtsubo, K. Fukuda, A. Hosoyama, S. Ohji, A. Yamazoe, N. Fujita, Y. Nagata, M. Tsuda, T. Hatta, and K. Kimbara
    • 雑誌名

      Genome Announcements

      巻: 2 号: 1

    • DOI

      10.1128/genomea.01213-13

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Complete Genome Sequence of Pseudomonas sp. Strain TKP, Isolated from a gamma-Hexachlorocyclohexane-Degrading Mixed Culture2014

    • 著者名/発表者名
      Ohtsubo Y, Kishida K, Sato T, Tabata M, Kawasumi T, Ogura Y, Hayashi T, Tsuda M, Nagata Y
    • 雑誌名

      Genome announcements

      巻: 2 号: 1

    • DOI

      10.1128/genomea.01241-13

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] The effect of a unique halide-stabilizing residue on the catalytic properties of haloalkane dehalogenase DatA from Agrobacterium tumefacience C582013

    • 著者名/発表者名
      Hassan, K. A. Gora, J. Brezvsky, R. Chaloupkova, H. Moskalikova, A. Fortova, Y. Nagata, J. Damborsky, Z. Prokop
    • 雑誌名

      FEBS J.

      巻: 280 号: 13 ページ: 3149-3159

    • DOI

      10.1111/febs.12238

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystal structure and site-directed mutagenesis analyses of haloalkane dehalogenase LinB from Sphingobium sp. MI1205.2013

    • 著者名/発表者名
      Masahiko Okai, Jun Ohtsuka, Fabiana L. Imai, Tomoko Mase, Ryota Moriuchi, Masataka Tsuda, Koji Nagata, Yuji Nagata, Masaru Tanokura
    • 雑誌名

      J. Bacteriol.

      巻: 195 号: 11 ページ: 2642-2651

    • DOI

      10.1128/jb.02020-12

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Complete Genome Sequence of the γ-Hexachlorocyclohexane-Degrading Bacterium Sphingomonas sp. Strain MM-1.2013

    • 著者名/発表者名
      Tabata M, Ohtsubo Y, Ohhata S, Tsuda M, Nagata Y.
    • 雑誌名

      Genome Announc

      巻: 1 号: 3

    • DOI

      10.1128/genomea.00247-13

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Inhibitory effect of Pseudomonas putida nitrogen-related phosphotransferase system on conjugative transfer of IncP-9 plasmid from Escherichia coli2013

    • 著者名/発表者名
      Inoue K, Miyazaki R, Ohtsubo Y, Nagata Y, Tsuda M
    • 雑誌名

      FEMS microbiology letters

      巻: 345 号: 2 ページ: 102-109

    • DOI

      10.1111/1574-6968.12188

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Complete Genome Sequence of Ralstonia pickettii DTP0602, a 2,4,6-Trichlorophenol Degrader2013

    • 著者名/発表者名
      Ohtsubo Y, Fujita N, Nagata Y, Tsuda M, Iwasaki T, Hatta T
    • 雑誌名

      Genome announcements

      巻: 1

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 機能相補による芳香族化合物複合汚染土壌からの新規分解酵素遺伝子の検索2013

    • 著者名/発表者名
      永山浩史、菅原智詞、遠藤諒、加藤広海、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
    • 雑誌名

      Journal of Environmental Biotechnology

      巻: 13 ページ: 51-56

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Design and experimental application of a novel non-degenerate universal primer set that amplifies prokaryotic 16S rRNA genes with a low possibility to amplify eukaryotic rRNA genes2013

    • 著者名/発表者名
      Mori H, Maruyama F, Kato H, Toyoda A, Dozono A, Ohtsubo Y, Nagata Y, Fujiyama A, Tsuda M Kurokawa K
    • 雑誌名

      DNA Res

      巻: 21 号: 2 ページ: 217-227

    • DOI

      10.1093/dnares/dst052

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] 加藤 広海、森 宙史、永山 浩史、大坪 嘉行、永田 裕二、黒川 顕、津田 雅孝2016

    • 著者名/発表者名
      土壌微生物のノトバイオロジー
    • 学会等名
      日本農芸化学会2016年度大会シンポジウム「微生物エコシステムを制御せよ!最先端テクノロジーがもたらす複合微生物系研究のパラダイムシフト」
    • 発表場所
      札幌コンベンションセンター(北海道、札幌市)
    • 年月日
      2016-03-27
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] フェナントレン分解コンソーシアムに存在する非分解菌の分解菌に対する効果2016

    • 著者名/発表者名
      小川なつみ、加藤広海、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
    • 学会等名
      日本農芸化学会2016年度大会
    • 発表場所
      札幌コンベンションセンター(北海道、札幌市)
    • 年月日
      2016-03-27
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] フェナントレン分解コンソーシアムMixEPa4における構成細菌間の相互作用2016

    • 著者名/発表者名
      守屋梓、小川なつみ、加藤広海、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
    • 学会等名
      日本農芸化学会2016年度大会
    • 発表場所
      札幌コンベンションセンター(北海道、札幌市)
    • 年月日
      2016-03-27
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] 土壌細菌Burkholderia multivoransにおけるFur制御下の機能未知遺伝子hemPの解析2016

    • 著者名/発表者名
      佐藤拓哉, 湯原 悟志, 大坪 嘉行, 永田 裕二, 津田 雅孝
    • 学会等名
      日本農芸化学会2016年度大会
    • 発表場所
      札幌コンベンションセンター(北海道、札幌市)
    • 年月日
      2016-03-27
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] Burkholderia multivoransにおける鉄硫黄クラスター合成系遺伝子群の転写制御機構の解析2016

    • 著者名/発表者名
      野々山 翔太, 佐藤 拓哉, 岸田 康平, 大坪 嘉行, 永田 裕二, 津田 雅孝
    • 学会等名
      日本農芸化学会2016年度大会
    • 発表場所
      札幌コンベンションセンター(北海道、札幌市)
    • 年月日
      2016-03-27
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] 環境常在細菌におけるアルコールデヒドロゲナーゼ遺伝子adhX関与の普遍的低栄養環境適応戦略2016

    • 著者名/発表者名
      稲葉 慎之介, 大坪 嘉行, 永田 裕二, 津田 雅孝
    • 学会等名
      日本農芸化学会2016年度大会
    • 発表場所
      札幌コンベンションセンター(北海道、札幌市)
    • 年月日
      2016-03-27
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] PCB/biphenyl分解細菌株が有する新規haloalkane dehalogenase遺伝子の解析2016

    • 著者名/発表者名
      佐藤 あや華, 大坪 嘉行, 永田 裕二, 津田 雅孝
    • 学会等名
      日本農芸化学会2016年度大会
    • 発表場所
      札幌コンベンションセンター(北海道、札幌市)
    • 年月日
      2016-03-27
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] ハロアルカンデハロゲナーゼの細胞内酵素機能進化系の構築2016

    • 著者名/発表者名
      小山 旺, 森内 良太, 大坪 嘉行, 永田 裕二, 津田 雅孝
    • 学会等名
      日本農芸化学会2016年度大会
    • 発表場所
      札幌コンベンションセンター(北海道、札幌市)
    • 年月日
      2016-03-27
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] DNA配列表示ツールSeqView2016

    • 著者名/発表者名
      大坪 嘉行, 永田 裕二, 津田 雅孝
    • 学会等名
      日本農芸化学会2016年度大会
    • 発表場所
      札幌コンベンションセンター(北海道、札幌市)
    • 年月日
      2016-03-27
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] ナフタレン分解プラスミドNAH7の接合伝達関連遺伝子traDEFの解析2016

    • 著者名/発表者名
      岸田 康平, 井上 慧, 大坪 嘉行, 永田 裕二, 津田 雅孝
    • 学会等名
      日本農芸化学会2016年度大会
    • 発表場所
      札幌コンベンションセンター(北海道、札幌市)
    • 年月日
      2016-03-27
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] 土壌細菌叢変動とレジームシフト2016

    • 著者名/発表者名
      大坪嘉行、加藤広海、永田裕二、津田雅孝
    • 学会等名
      第89回日本細菌学会ワークショップ「共創:微生物エコシステム構成原理」
    • 発表場所
      大阪交流センター(大阪府、大阪市)
    • 年月日
      2016-03-23
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] SeqView: DNA 配列/アミノ酸配列の表示ツール2016

    • 著者名/発表者名
      大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
    • 学会等名
      第10回日本ゲノム微生物学会年会
    • 発表場所
      東京工業大学大岡山キャンパス(東京都、目黒区)
    • 年月日
      2016-03-04
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] 汚染土壌細菌叢の新規環境への定着及び再汚染のメタゲノム解析2016

    • 著者名/発表者名
      加藤広海、森宙史、渡来直生、永山浩史、大坪嘉行、永田裕二、豊田敦、黒川顕、津田雅孝
    • 学会等名
      第10回日本ゲノム微生物学会年会
    • 発表場所
      東京工業大学大岡山キャンパス(東京都、目黒区)
    • 年月日
      2016-03-04
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] フェナントレン分解細菌Burkholderia sp.HB-1株のゲノムと芳香属分解遺伝子の解析2016

    • 著者名/発表者名
      守屋梓、小川なつみ、加藤広海、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
    • 学会等名
      第10回日本ゲノム微生物学会年会
    • 発表場所
      東京工業大学大岡山キャンパス(東京都、目黒区)
    • 年月日
      2016-03-04
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] 遺伝学的解析を用いた芳香族化合物分解コンソーシアムにおける分解菌と非分解菌の共在機構の解明2016

    • 著者名/発表者名
      小川なつみ 加藤広海 大坪嘉行 永田裕二 津田雅孝
    • 学会等名
      第10回日本ゲノム微生物学会年会
    • 発表場所
      東京工業大学大岡山キャンパス(東京都、目黒区)
    • 年月日
      2016-03-04
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] 微生物群集動態の原理解明に向けた再現モデルの構築2016

    • 著者名/発表者名
      渡来直生、森宙史、加藤広海、大坪嘉行、小椋義俊、永田裕二、豊田敦、藤山秋佐夫、林哲也、津田雅孝、黒川顕
    • 学会等名
      第10回日本ゲノム微生物学会年会
    • 発表場所
      東京工業大学大岡山キャンパス(東京都、目黒区)
    • 年月日
      2016-03-04
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] 鉄濃度依存的に発現変動する機能未知遺伝子hemPの解析2016

    • 著者名/発表者名
      佐藤拓哉 湯原悟志 野々山翔太 大坪嘉行 永田裕二 津田雅孝
    • 学会等名
      第10回日本ゲノム微生物学会年会
    • 発表場所
      東京工業大学大岡山キャンパス(東京都、目黒区)
    • 年月日
      2016-03-04
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] Burkholderia multivorans における鉄硫黄クラスター合成遺伝子群の転写制御に対するFur及びIscRの作用機作2016

    • 著者名/発表者名
      野々山翔太 佐藤拓哉 岸田康平 大坪嘉行 永田裕二 津田雅孝
    • 学会等名
      第10回日本ゲノム微生物学会年会
    • 発表場所
      東京工業大学大岡山キャンパス(東京都、目黒区)
    • 年月日
      2016-03-04
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] ナフタレン分解プラスミドNAH7の接合伝達関連機能未知遺伝子群traDEFの解析2016

    • 著者名/発表者名
      岸田康平 井上慧 大坪嘉行 永田裕二 津田 雅孝
    • 学会等名
      第10回日本ゲノム微生物学会年会
    • 発表場所
      東京工業大学大岡山キャンパス(東京都、目黒区)
    • 年月日
      2016-03-04
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] 環境常在細菌が有する推定アルコールデヒドロゲナーゼ遺伝子関与の新規極貧栄養環境適応機構2016

    • 著者名/発表者名
      稲葉慎之介 平野丈 宇井博紀 大坪嘉行 永田裕二 津田雅孝
    • 学会等名
      第10回日本ゲノム微生物学会年会
    • 発表場所
      東京工業大学大岡山キャンパス(東京都、目黒区)
    • 年月日
      2016-03-04
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] 次世代シーケンサーを用いたqTnSeq法の構築2016

    • 著者名/発表者名
      阿部史歩 大坪嘉行 永田裕二 津田雅孝
    • 学会等名
      第10回日本ゲノム微生物学会年会
    • 発表場所
      東京工業大学大岡山キャンパス(東京都、目黒区)
    • 年月日
      2016-03-04
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] Haloalkane dehalogenases in bacteria2015

    • 著者名/発表者名
      Yuji Nagata, Ryota Moriuchi, Yoshiyuki Ohtsubo, and Masataka Tsuda
    • 学会等名
      The International Chemical Congress of Pacific Basin Societies (Pacifichem 2015)
    • 発表場所
      Honolulu, Hawaii, USA
    • 年月日
      2015-12-15
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 環境を汚染する難分解性農薬分解遺伝子群の水平伝播2015

    • 著者名/発表者名
      永田裕二、大坪嘉行、津田雅孝
    • 学会等名
      第30回日本微生物生態学会年次大会シンポジウム「環境での遺伝子リスクの醸成:薬剤耐性と病原性の遺伝子伝播」
    • 発表場所
      土浦亀城プラザ(茨城県、土浦市)
    • 年月日
      2015-10-17
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] メタゲノム情報を基盤とした汚染土壌の細菌コンソーシアムの研究2015

    • 著者名/発表者名
      加藤広海、小川なつみ、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
    • 学会等名
      第30回日本微生物生態学会年次大会
    • 発表場所
      土浦亀城プラザ(茨城県、土浦市)
    • 年月日
      2015-10-17
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] リボソームRNA遺伝子の染色体外への移行2015

    • 著者名/発表者名
      按田瑞恵, 大坪嘉行, 大久保卓, 菅原雅之, 永田裕二, 津田雅孝, 南澤究, 三井久幸
    • 学会等名
      日本遺伝学会第87回大会ワークショップ12「ゲノムとOMICSの比較から現れた遺伝と進化をめぐる驚き」
    • 発表場所
      東北大学川内北キャンパス(宮城県、仙台市)
    • 年月日
      2015-09-24
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] 有機塩素系農薬分解細菌株の有機炭素源非添加無機固体培地での生育に関与する推定アルコールデヒドロゲナーゼ遺伝子adhXの機能解析2015

    • 著者名/発表者名
      稲葉慎之介、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
    • 学会等名
      環境バイオテクノロジー学会2015年度大会
    • 発表場所
      東京大学弥生キャンパス(東京都、文京区)
    • 年月日
      2015-06-29
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] 有機塩素系殺虫剤gamma-hexachlorocyclohexane分解細菌の分子育種2015

    • 著者名/発表者名
      荷川取佑記, 宮崎亮, 古屋佑磨, 大畑智史, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • 学会等名
      日本農芸化学会2015年大会
    • 発表場所
      岡山
    • 年月日
      2015-03-26 – 2015-03-29
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] スフィンゴモナッド細菌株の有機炭素源非添加無機固体培地での生育に関与する推定アルコールデヒドロゲナーゼ遺伝子adhXの解析2015

    • 著者名/発表者名
      稲葉慎之介、平野丈、宇井博紀、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
    • 学会等名
      日本農芸化学会2015年大会
    • 発表場所
      岡山
    • 年月日
      2015-03-26 – 2015-03-29
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] ナフタレン分解プラスミドNAH7の接合伝達宿主域に関する研究2015

    • 著者名/発表者名
      岸田康平, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • 学会等名
      日本農芸化学会2015年大会
    • 発表場所
      岡山
    • 年月日
      2015-03-26 – 2015-03-29
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] GenomeMatcherのアノテーション支援機能2015

    • 著者名/発表者名
      大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • 学会等名
      日本農芸化学会2015年大会
    • 発表場所
      岡山
    • 年月日
      2015-03-26 – 2015-03-29
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] 複数の芳香族化合物による人工的汚染化土壌メタゲノムから取得したインディゴ生成活性を担うコスミドクローンの解析2015

    • 著者名/発表者名
      永山浩史、加藤広海、菅原智詞、遠藤諒、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
    • 学会等名
      第9回日本ゲノム微生物学会年会
    • 発表場所
      神戸
    • 年月日
      2015-03-06 – 2015-03-08
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] 芳香族化合物分解コンソーシアムに存在する分解菌と非分解菌の関係2015

    • 著者名/発表者名
      小川なつみ、加藤広海、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
    • 学会等名
      第9回日本ゲノム微生物学会年会
    • 発表場所
      神戸
    • 年月日
      2015-03-06 – 2015-03-08
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] クラスター化した代謝酵素遺伝子群の導入による有機塩素系殺虫剤gamma-HCH分解細菌の分子育種2015

    • 著者名/発表者名
      荷川取佑記、宮崎亮、古屋佑磨、大畑智史、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
    • 学会等名
      第9回日本ゲノム微生物学会年会
    • 発表場所
      神戸
    • 年月日
      2015-03-06 – 2015-03-08
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] 土壌細菌Burkholderia multivorans ATCC17616株におけるFurの機能及び発現制御機構の解析2015

    • 著者名/発表者名
      佐藤拓哉 木村明音 湯原悟志 大坪嘉行 永田裕二 津田雅孝
    • 学会等名
      第9回日本ゲノム微生物学会年会
    • 発表場所
      神戸
    • 年月日
      2015-03-06 – 2015-03-08
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] 次世代シーケンサー由来のリード処理ツール: ShortReadManager2015

    • 著者名/発表者名
      大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
    • 学会等名
      第9回日本ゲノム微生物学会年会
    • 発表場所
      神戸
    • 年月日
      2015-03-06 – 2015-03-08
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] 移植された土壌微生物の定着過程とその安定性について2015

    • 著者名/発表者名
      加藤広海、森宙史、丸山史人、永山浩史、大坪嘉行、永田裕二、黒川顕、津田雅孝
    • 学会等名
      第9回日本ゲノム微生物学会年会
    • 発表場所
      神戸
    • 年月日
      2015-03-06 – 2015-03-08
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] rRNA遺伝子オペロンが9-10 kbレプリコンのみに存在するゲノム構造をもつ細菌の系統分布2015

    • 著者名/発表者名
      按田瑞恵、大坪嘉行、三井久幸、大久保卓、菅原雅之、永田裕二、津田雅孝、南澤 究
    • 学会等名
      第9回日本ゲノム微生物学会年会
    • 発表場所
      神戸
    • 年月日
      2015-03-06 – 2015-03-08
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] 植物マイクロビオームメタゲノム配列のマッピングによるMethylobacterium 属細菌集団の植物種依存性の解析2015

    • 著者名/発表者名
      南 智之、按田瑞恵、大久保 卓、三井久幸、大坪嘉行、永田裕二、金子貴一、田畑哲之、津田雅孝、南澤 究
    • 学会等名
      第9回日本ゲノム微生物学会年会
    • 発表場所
      神戸
    • 年月日
      2015-03-06 – 2015-03-08
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Host range of conjugation system encoded by naphthalene-catabolic plasmid NAH7 from Pseudomonas putida2014

    • 著者名/発表者名
      Kouhei Kishida, Yoshiyuki Ohtsubo, Yuji Nagata, and Masataka Tsuda
    • 学会等名
      International Symposium of the International Society for Plasmid Biology Scientific Meeting 2014
    • 発表場所
      Queensland, Australia
    • 年月日
      2014-10-27 – 2014-11-01
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] rRNA遺伝子オペロンが9.4 kbレプリコンにのみ存在する細菌ゲノムの発見2014

    • 著者名/発表者名
      按田瑞恵、大坪嘉行、大久保卓、菅原雅之、三井久幸、永田裕二、津田雅孝、南澤 究
    • 学会等名
      環境微生物系学会合同大会2014
    • 発表場所
      浜松
    • 年月日
      2014-10-21 – 2014-10-24
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] フェナントレン分解細菌と共存する非分解優占種細菌の機能解明2014

    • 著者名/発表者名
      小川なつみ、加藤広海、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
    • 学会等名
      環境微生物系学会合同大会2014
    • 発表場所
      浜松
    • 年月日
      2014-10-21 – 2014-10-24
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] 完全ゲノム配列比較に基づいた人為起源有機塩素系殺虫剤γ-HCH分解細菌の出現と進化の考察2014

    • 著者名/発表者名
      永田裕二、田端理朗、大畑智史、荷川取佑記、大坪嘉行、津田雅孝
    • 学会等名
      環境微生物系学会合同大会2014
    • 発表場所
      浜松
    • 年月日
      2014-10-21 – 2014-10-24
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] 土壌における微生物コミュニティの形成過程について2014

    • 著者名/発表者名
      加藤広海、森宙史、丸山史人、永山浩史、大坪嘉行、永田裕二、黒川顕、津田雅孝
    • 学会等名
      環境微生物系学会合同大会2014
    • 発表場所
      浜松
    • 年月日
      2014-10-21 – 2014-10-24
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] 土壌細菌での鉄応答制御因子Furを介した転写調節機構の解明2014

    • 著者名/発表者名
      佐藤拓哉、湯原悟志、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
    • 学会等名
      環境微生物系学会合同大会2014
    • 発表場所
      浜松
    • 年月日
      2014-10-21 – 2014-10-24
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] クラスター化した代謝酵素遺伝子群の導入による有機塩素系殺虫剤gamma-hexachlorocyclohexane資化能を有する新規細菌株の分子育種2014

    • 著者名/発表者名
      荷川取佑記、宮崎亮、古屋佑磨、大畑智史、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
    • 学会等名
      環境微生物系学会合同大会2014
    • 発表場所
      浜松
    • 年月日
      2014-10-21 – 2014-10-24
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] 芳香族化合物複合汚染土壌から培養非依存的手法で取得したインディゴ生成活性に関与するコスミドクローンの解析2014

    • 著者名/発表者名
      永山浩史、菅原智詞、遠藤諒、加藤広海、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
    • 学会等名
      環境微生物系学会合同大会2014
    • 発表場所
      浜松
    • 年月日
      2014-10-21 – 2014-10-24
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] 新規植物共生細菌Aurantimonas sp. AU20のゲノム解析2014

    • 著者名/発表者名
      按田瑞恵、大坪嘉行、大久保卓、三井久幸、永田裕二、津田雅孝、南澤 究
    • 学会等名
      植物微生物研究会第23回研究交流会
    • 発表場所
      岡崎
    • 年月日
      2014-09-07 – 2014-09-09
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] 根粒超着生ダイズから分離された Methylobacterium sp.AMS5 のゲノム解析とミヤコグサにおける着生パターン2014

    • 著者名/発表者名
      南智之,按田瑞恵,大久保卓,三井久幸,大坪嘉行,永田裕二,津田雅孝, 南澤究
    • 学会等名
      植物微生物研究会第23回研究交流会
    • 発表場所
      岡崎
    • 年月日
      2014-09-07 – 2014-09-09
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Comparison of complete genome sequences of four gamma-hexachlorocyclohexane-degrading sphingomonad strains2014

    • 著者名/発表者名
      Yuji Nagata, Michiro Tabata, Satoshi Ohhata, Yuki Nikawadori, Yoshiyuki Ohtsubo, Masataka Tsuda
    • 学会等名
      15th Internantional Symposium on Microbial Ecology
    • 発表場所
      Seoul, South Korea
    • 年月日
      2014-08-24 – 2014-08-29
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Effect of anutoregulation of nodulation on pland colonization of Methylobacterium sp. AMS5 isolated from hypernodulated soybean2014

    • 著者名/発表者名
      Tomoyuki Minami, Mizue Anda, Takashi Ohkubo, Hisayuki Mitsui, Yoshiyuki Ohtsubo, Yuji Nagata, Masataka Tsuda, and Kiwamu Minamisawa
    • 学会等名
      15th Internantional Symposium on Microbial Ecology
    • 発表場所
      Seoul, South Korea
    • 年月日
      2014-08-24 – 2014-08-29
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Genetic ecology of Methylobacterium species in legume plants2014

    • 著者名/発表者名
      Tomoyuki Minami, Mizue Anda, Takashi Ohkubo, Hisayuki Mitsui, Yoshiyuki Ohtsubo, Yuji Nagata, Masataka Tsuda, and Kiwamu Minamisawa
    • 学会等名
      The 6th Korea-Japan-Taiwan International Symposium on Microbial Ecology
    • 発表場所
      Seoul, South Korea
    • 年月日
      2014-08-23 – 2014-08-24
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Finishしたゲノム配列のチェックツール: FinishChecker2014

    • 著者名/発表者名
      大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • 学会等名
      第8回日本ゲノム微生物学会年会
    • 発表場所
      東京
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] Mycobacterium属細菌のフェナントレン分解能に対する非分解菌の効果2014

    • 著者名/発表者名
      小川なつみ, 加藤広海, 遠藤諒, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • 学会等名
      第8回日本ゲノム微生物学会年会
    • 発表場所
      東京
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] ナフタレン分解プラスミドNAH7のoriTの同定と宿主域の解析2014

    • 著者名/発表者名
      岸田康平, 井上慧, 宮崎亮, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • 学会等名
      第8回日本ゲノム微生物学会年会
    • 発表場所
      東京
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] 土壌微生物の移植メタゲノム2014

    • 著者名/発表者名
      加藤広海, 森宙史, 丸山史人, 豊田敦, 永山浩史, 大坪嘉行, 永田裕二, 藤山秋佐夫, 黒川顕, 津田雅孝
    • 学会等名
      第8回日本ゲノム微生物学会年会
    • 発表場所
      東京
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] Burkholderia multivoransのFurを介した転写制御機構の解明2014

    • 著者名/発表者名
      佐藤拓哉, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • 学会等名
      第8回日本ゲノム微生物学会年会
    • 発表場所
      東京
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] gamma-HCH分解能を有するsphingomonad細菌株における可動性遺伝因子を介したゲノム動態の解析2014

    • 著者名/発表者名
      大畑智史, 田端理朗, 荷川取佑記, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • 学会等名
      第8回日本ゲノム微生物学会年会
    • 発表場所
      東京
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] フェナントレン分解コンソーシアムにおける非分解優占種細菌の役割2014

    • 著者名/発表者名
      小川なつみ, 加藤広海, 遠藤諒, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • 学会等名
      日本農芸化学会2014年大会
    • 発表場所
      東京
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] IncP-9群NAH7のoriTの同定と接合伝達宿主域に関する研究2014

    • 著者名/発表者名
      岸田康平, 井上慧, 宮崎亮, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • 学会等名
      日本農芸化学会2014年大会
    • 発表場所
      東京
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] Acidvorax sp KKS102のカタボライト調節機構に関わる二成分制御系遺伝子bphPQの解析2014

    • 著者名/発表者名
      佐藤旦, 小沼かおり, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • 学会等名
      日本農芸化学会2014年大会
    • 発表場所
      東京
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] 土壌細菌Burkholderia multivoransにおけるFur依存的な鉄恒常性維持に関与するhemP遺伝子の解析2014

    • 著者名/発表者名
      佐藤拓哉, 木村明音, 湯原悟志, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • 学会等名
      日本農芸化学会2014年大会
    • 発表場所
      東京
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] FinishChecker: 完全決定したつもりのゲノム配列のチェック機能2014

    • 著者名/発表者名
      大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • 学会等名
      日本農芸化学会2014年大会
    • 発表場所
      東京
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] 有機塩素系殺虫剤gamma-hexachlorocyclohexane分解能を有するスフィンゴモナッド細菌群の挿入配列に関する研究2014

    • 著者名/発表者名
      荷川取佑記, 大畑智史, 田端理朗, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • 学会等名
      日本農芸化学会2014年大会
    • 発表場所
      東京
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] 芳香族化合物汚染化土壌メタゲノムから培養非依存的手法により取得したフェノール分解関与遺伝子群の機能解析2014

    • 著者名/発表者名
      永山浩史, 菅原智詞, 遠藤諒, 加藤広海, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • 学会等名
      日本農芸化学会2014年大会
    • 発表場所
      東京
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] 有機塩素系殺虫剤分解能を有するスフィンゴモナッド細菌株の有機炭素源非添加無機寒天培地での生育を司る機構に関する研究2014

    • 著者名/発表者名
      永田裕二, 平野丈, 宇井博紀, 大坪嘉行, 津田雅孝
    • 学会等名
      日本農芸化学会2014年大会
    • 発表場所
      東京
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] 累積置換変異導入によるハロアルカンデハロゲナーゼLinBのbeta-HCH分解活性の機能進化に関する研究2013

    • 著者名/発表者名
      永田裕二, 森内良太, 田中裕興, 大坪嘉行, 津田雅孝
    • 学会等名
      環境バイオテクノロジー学会2013年度大会
    • 発表場所
      北九州
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] 機能発現に基づくメタゲノムライブラリーからの新規芳香族化合物分解酵素遺伝子の取得と解析2013

    • 著者名/発表者名
      永山浩史, 菅原智詞, 遠藤諒, 加藤広海, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • 学会等名
      環境バイオテクノロジー学会2013年度大会
    • 発表場所
      北九州
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] IncP-9群プラスミドNAH7のoriTの同定及び接合伝達関連遺伝子traFの解析2013

    • 著者名/発表者名
      岸田康平, 井上慧, 宮崎亮, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • 学会等名
      環境バイオテクノロジー学会2013年度大会
    • 発表場所
      北九州
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] 土壌細菌Burkholderia multivorans ATCC 17616株の鉄恒常性維持機構の解明2013

    • 著者名/発表者名
      佐藤拓哉, 木村明音, 湯原悟志, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • 学会等名
      環境バイオテクノロジー学会2013年度大会
    • 発表場所
      北九州
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] IncP-9群プラスミドNAH7のoriTの同定とtraF欠失による宿主域変化2013

    • 著者名/発表者名
      岸田康平, 井上慧, 宮崎亮, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • 学会等名
      第7回 日本ゲノム微生物学会 若手の会 研究会
    • 発表場所
      静岡県駿東郡
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] Burkholderia multivorans ATCC17616株の鉄恒常性維持機構の解明2013

    • 著者名/発表者名
      佐藤拓哉, 木村明音, 湯原悟志, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • 学会等名
      第7回 日本ゲノム微生物学会 若手の会 研究会
    • 発表場所
      静岡県駿東郡
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] 土壌微生物の他土壌への移植メタゲノミクス2013

    • 著者名/発表者名
      加藤広海, 森宙史, 丸山史人, 豊田敦, 大坪嘉行, 永田裕二, 藤山秋佐夫, 黒川顕, 津田雅孝
    • 学会等名
      第29回日本微生物生態学会年次大会
    • 発表場所
      鹿児島
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] Isolation of phenol-catabolic genes by cultivation-independent functional screening from metagenome of soil artificially polluted by aromatic hydrocarbons2013

    • 著者名/発表者名
      Hirofumi Nagayama, Tomonori Sugawara, Ryo Endo, Hiromi Kato, Yoshiyuki Ohtsubo, Yuji Nagata, Hiroshi Mori, Ken, Kurokawa, and Masataka Tsuda
    • 学会等名
      2nd Thunen Symposium on Soil Metagenomics: mining and learning from metagenomes plus workshop on bioinformatic tools for soil microbiologists
    • 発表場所
      Braunschweig, Germany
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] Design and experimental validation of a novel non-degenerate universal primer set that amplifies prokaryotic 16S rRNA genes with a low possibility to amplify eukaryotic rRNA genes2013

    • 著者名/発表者名
      Hiroshi Mori, Fumito Maruyama, Hiromi Kato, Atsushi Toyoda, Ayumi Dozono, Yoshiyuki Ohtsubo, Yuji Nagata, Asao Fujiyama, Masataka Tsuda, and Ken Kurokawa
    • 学会等名
      2nd Thunen Symposium on Soil Metagenomics: mining and learning from metagenomes plus workshop on bioinformatic tools for soil microbiologists
    • 発表場所
      Braunschweig, Germany
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [図書] Manual of Environmental Microbiology, 4th Edition2015

    • 著者名/発表者名
      Nagata Y, Tabata M, Ohtsubo, Y, Tsuda M
    • 出版者
      ASM Press, Washington, DC
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [図書] Appearance and evolution of γ-hexachlorocyclohexane-degrading bacteria. In Biodegradative Bacteria2014

    • 著者名/発表者名
      Nagata Y, Tabata M, Ohhata S, Tsuda M
    • 総ページ数
      358
    • 出版者
      Springer Verlag, Tokyo
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [図書] Strategies to reveal genomic function in natural soil systems. In Biodegradative Bacteria2014

    • 著者名/発表者名
      Ohtsubo Y, Nishiyama E, Ishibashi Y, Nagata Y Tsuda M
    • 総ページ数
      358
    • 出版者
      Springer Verlag, Tokyo
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書

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公開日: 2013-05-21   更新日: 2019-07-29  

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