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放線菌の接合伝達機構解明と人為的高速ゲノム進化への応用

研究課題

研究課題/領域番号 25292047
研究種目

基盤研究(B)

配分区分一部基金
応募区分一般
研究分野 応用微生物学
研究機関信州大学

研究代表者

片岡 正和  信州大学, 学術研究院工学系, 准教授 (90332676)

研究分担者 三島 正規  首都大学東京, 理工学研究科, 准教授 (70346310)
連携研究者 池田 治生  北里大学, 感染制御科学府, 教授 (90159632)
研究期間 (年度) 2013-04-01 – 2016-03-31
研究課題ステータス 完了 (2015年度)
配分額 *注記
17,680千円 (直接経費: 13,600千円、間接経費: 4,080千円)
2015年度: 3,250千円 (直接経費: 2,500千円、間接経費: 750千円)
2014年度: 3,380千円 (直接経費: 2,600千円、間接経費: 780千円)
2013年度: 11,050千円 (直接経費: 8,500千円、間接経費: 2,550千円)
キーワード放線菌 / 接合伝達 / ATPase / ゲノム移行 / TraB / DNAチャネル / 進化 / 接合関連遺伝子群 / 移植 / 線状プラスミド / 環状プラスミド / ttrA / ゲノム
研究成果の概要

TraBタンパク質のドメイン構造は欠失解析により、膜局在ドメイン、ATPaseドメイン、DNA結合ドメインに3分割できた。膜局在ドメインはTraBのN末端に、ATPase活性を有するモータードメインは中央部に、DNA結合ドメインはC末端領域に位置していた。線状プラスミドの伝達関連遺伝子群の機能を遺伝学的に明らかにした。また線状プラスミド、環状プラスミドの各々の伝達関連遺伝子群を形態の異なるプラスミドに移植した。pSN22の遺伝子発現制御領域を含む接合必須遺伝子を放線菌S. lividansのゲノム上に組み込み、ゲノムの組換えを検出する系を用いて高効率ゲノム移動を確認した。

報告書

(4件)
  • 2015 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2014 実績報告書
  • 2013 実績報告書
  • 研究成果

    (27件)

すべて 2016 2015 2014 2013 その他

すべて 学会発表 (25件) (うち国際学会 2件、 招待講演 2件) 備考 (2件)

  • [学会発表] 放線菌プラスミドpSN22の接合伝達における必須タンパク質TraBの機能解析2016

    • 著者名/発表者名
      矢野嵩紘、宮武徹、片岡正和
    • 学会等名
      日本農芸化学会年会
    • 発表場所
      札幌 国際会議場
    • 年月日
      2016-03-28
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] 線状プラスミドにおける接合伝達機構の解析2016

    • 著者名/発表者名
      丸山直也、池田治生、片岡正和
    • 学会等名
      日本農芸化学会年会
    • 発表場所
      札幌 国際会議場
    • 年月日
      2016-03-28
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] 放線菌接合伝達遺伝子によるゲノム移行2016

    • 著者名/発表者名
      村端広介、金眞熙、宮武徹、片岡正和
    • 学会等名
      日本農芸化学会年会
    • 発表場所
      札幌 国際会議場
    • 年月日
      2016-03-28
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] Conjugation in modern microbiology2016

    • 著者名/発表者名
      Masakazu Kataoka
    • 学会等名
      異分野融合ワークショップ: 微生物生命システム研究と合成生物学の融合
    • 発表場所
      奈良先端大学院大学
    • 年月日
      2016-03-16
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 放線菌プラスミド pSN22 の接合伝達における必須タンパク質 TraB の膜局在及び ATPase 活性に関する解析2016

    • 著者名/発表者名
      矢野嵩紘、宮武徹、片岡正和
    • 学会等名
      日本ゲノム微生物学会年会
    • 発表場所
      大岡山 東工大
    • 年月日
      2016-03-03
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] 放線菌接合伝達遺伝子による染色体移行手法の開発2015

    • 著者名/発表者名
      村端広介、金眞熙、宮武徹、片岡正和
    • 学会等名
      グラム陽性菌ゲノム機能会議
    • 発表場所
      雄琴温泉 雄山荘
    • 年月日
      2015-08-27
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] Optimization of Gene Transfer by the RK2 between Cross-species2015

    • 著者名/発表者名
      Takahiro Yokoi, Mitsuhiro Itaya, Hitrotada Mori, Msakazu Kataoka
    • 学会等名
      American Society for Microbiology
    • 発表場所
      New Orleans, USA
    • 年月日
      2015-05-30
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Functional analysis of DNA channel protein, TraB, for Streptomyces conjugation2015

    • 著者名/発表者名
      Masakazu Kataoka, Tetsu Miyatake, Mai Kobe
    • 学会等名
      American Society for Microbiology
    • 発表場所
      New Orleans, USA
    • 年月日
      2015-05-30
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 放線菌プラスミドpSN22由来接合伝達遺伝子による染色体移行の解析2015

    • 著者名/発表者名
      村端広介, Jim Hee Kim, 宮武徹, 横井崇紘, 片岡正和
    • 学会等名
      日本農芸化学会 2015年年会
    • 発表場所
      岡山県岡山市 岡山大学
    • 年月日
      2015-03-26 – 2015-03-29
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] 放線菌接合伝達性線状プラスミド SAP1 の解析2015

    • 著者名/発表者名
      遠藤翔太、池田治生、片岡正和
    • 学会等名
      日本ゲノム微生物学会
    • 発表場所
      兵庫県 神戸市 神戸大学
    • 年月日
      2015-03-06 – 2015-03-08
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] いまどきの遺伝子操作:巨大なDNAの扱いと接合伝達の復権2014

    • 著者名/発表者名
      片岡正和
    • 学会等名
      極限環境生物学会
    • 発表場所
      沖縄県今帰仁村,ホテルベルパライソ
    • 年月日
      2014-11-03 – 2014-11-05
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Localization and interaction of TraA and TraB, the essential factor for the conjugative transfer of Streptomyces plasmid pSN22.2014

    • 著者名/発表者名
      Masakazu Kataoka, Tetsu Miyatake
    • 学会等名
      17th ISBA
    • 発表場所
      Audin, Turkey
    • 年月日
      2014-10-08 – 2014-10-12
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Old is New? : New horizon of conjugation in the generation of synthetic biology.2014

    • 著者名/発表者名
      Masakazu Kataoka
    • 学会等名
      Cold Spring Harbor Laboratory meeting, Plasmids: History & Biology,
    • 発表場所
      Cold Spring Harbor USA
    • 年月日
      2014-09-21 – 2014-09-24
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Old is New?:合成生物学時代における接合伝達2014

    • 著者名/発表者名
      片岡正和
    • 学会等名
      2014グラム陽性菌ゲノム機能会議
    • 発表場所
      鶴岡市 慶應大学
    • 年月日
      2014-09-03 – 2014-09-05
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Functional analyses of Streptomyces conjugation system: the molecular function and harmonized expression of the DNA channel, TraB.2014

    • 著者名/発表者名
      Masakazu Kataoka, Tetsu Miyatake, Mai Kobe
    • 学会等名
      IUMS congress 2014
    • 発表場所
      Montreal, Canada
    • 年月日
      2014-07-27 – 2014-08-03
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] ATPase activity and expression of TraB, the DNA channel protein on Streptomyces conjugative plasmid pSN22.2014

    • 著者名/発表者名
      神戸麻衣、片岡正和
    • 学会等名
      第8回長野ミーティング:生物資源の有効利用を目指して
    • 発表場所
      長野・ラフォーレ白馬
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] Construction of a gene cluster transfer system with linear plasmid SAP1.2014

    • 著者名/発表者名
      藤森友真、片岡正和
    • 学会等名
      第8回長野ミーティング:生物資源の有効利用を目指して
    • 発表場所
      長野・ラフォーレ白馬
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] Gene transfer method using cross-species conjugal transfer.2014

    • 著者名/発表者名
      横井崇紘、片岡正和
    • 学会等名
      第8回長野ミーティング:生物資源の有効利用を目指して
    • 発表場所
      長野・ラフォーレ白馬
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] 線状プラスミドSAP1を用いた遺伝子クラスター輸送システムの構築2013

    • 著者名/発表者名
      藤森友真、池田治生、片岡正和
    • 学会等名
      日本放線菌学会2013年度大会
    • 発表場所
      広島・メルパルク広島
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] 接合伝達機構を用いた大腸菌-枯草菌-放線菌間における遺伝子操作法の確立2013

    • 著者名/発表者名
      横井崇紘、片岡正和
    • 学会等名
      グラム陽性菌ゲノム機能会議
    • 発表場所
      つくば・筑波山ホテル
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] 放線菌線状プラスミドSAP1を用いた遺伝子クラスター輸送システム2013

    • 著者名/発表者名
      藤森友真、池田治生、片岡正和
    • 学会等名
      グラム陽性菌ゲノム機能会議
    • 発表場所
      つくば・筑波山ホテル
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] 生合成系操作における接合伝達システムの応用可能性2013

    • 著者名/発表者名
      片岡正和
    • 学会等名
      日本遺伝学会85回大会
    • 発表場所
      横浜・慶應大日吉
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 接合伝達機構を用いたE.coli -B. subtilis間遺伝子操作法の確立2013

    • 著者名/発表者名
      横井崇紘、板谷光泰、森浩禎、片岡正和
    • 学会等名
      日本分子生物学会第36回大会
    • 発表場所
      神戸・ポートアイランド
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] 放線菌伝達性プラスミドpSN22上の伝達関連タンパク質TraBの解析2013

    • 著者名/発表者名
      神戸麻依、宮武徹、片岡正和
    • 学会等名
      日本分子生物学会第36回大会
    • 発表場所
      神戸・ポートアイランド
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] 線状プラスミドSAP1 を用いたStreptomycesへの遺伝子クラスター導入系の開発とその評価2013

    • 著者名/発表者名
      藤森友真、池田治生、片岡正和
    • 学会等名
      日本分子生物学会第36回大会
    • 発表場所
      神戸・ポートアイランド
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [備考] 片岡研HP

    • URL

      http://www.kankyo.shinshu-u.ac.jp/~kataokalab/

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [備考] SOAR

    • URL

      http://www.shinshu-u.ac.jp/soar/

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書

URL: 

公開日: 2013-05-21   更新日: 2019-07-29  

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