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D-アミノ酸による生体制御:分子機構の解明とその応用

研究課題

研究課題/領域番号 25292059
研究種目

基盤研究(B)

配分区分一部基金
応募区分一般
研究分野 応用生物化学
研究機関名古屋大学

研究代表者

吉村 徹  名古屋大学, 生命農学研究科, 教授 (70182821)

研究分担者 邊見 久  名古屋大学, 大学院生命農学研究科, 准教授 (60302189)
研究期間 (年度) 2013-04-01 – 2016-03-31
研究課題ステータス 完了 (2015年度)
配分額 *注記
17,030千円 (直接経費: 13,100千円、間接経費: 3,930千円)
2015年度: 4,810千円 (直接経費: 3,700千円、間接経費: 1,110千円)
2014年度: 5,070千円 (直接経費: 3,900千円、間接経費: 1,170千円)
2013年度: 7,150千円 (直接経費: 5,500千円、間接経費: 1,650千円)
キーワードD-アミノ酸 / D-セリン / D-アスパラギン酸 / セリンラセマーゼ / D-セリンデヒドラターゼ / D-アスパラギン酸 / D-セリンデヒドラターゼ / D-アミノ酸スパラギン酸 / ビタミンB6 / 細胞性粘菌 / アスパラギン酸ラセマーゼ / ピリドキサルリン酸
研究成果の概要

D-アミノ酸は様々な生理機能を有するがその分子機構は必ずしも明確ではない。本研究では我々が構築した定量法などを用いて、D-SerやD-Aspなどの機能の分子レベルでの解明とその応用を目指した。具体的には、セリンラセマーゼやD-セリンデヒドラターゼの反応機構解析、細胞性粘菌の発生・分化におけるD-Serとセリンラセマーゼの役割、哺乳動物におけるD-Asp生合成酵素の解明、D-Aspによる動物培養細胞への抗酸化性付与の分子機構、D-Ser定量法の改良、PEG修飾D-セリンデヒドラターゼの投与によるマウス脳内D-セリンの制御、D-アミノ酸を認識するタンパク質構造などを検討し、一定の成果を得た。

報告書

(4件)
  • 2015 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2014 実績報告書
  • 2013 実績報告書
  • 研究成果

    (31件)

すべて 2016 2015 2014 2013

すべて 雑誌論文 (8件) (うち査読あり 8件、 謝辞記載あり 5件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (23件) (うち国際学会 2件、 招待講演 12件)

  • [雑誌論文] A New Member of MocR/GabR-type PLP-Binding Regulator of D-Alanyl-D-Alanine Ligase in Brevibacillus brevis.2015

    • 著者名/発表者名
      Takenaka T., Ito T., Miyahara I., Hemmi H., Yoshimura T.
    • 雑誌名

      FEBS J.

      巻: 282 号: 21 ページ: 4201-4217

    • DOI

      10.1111/febs.13415

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Role of the aminotransferase domain in Bacillus subtilis GabR, a pyridoxal 5'-phosphate-dependent transcriptional regulator2015

    • 著者名/発表者名
      Okuda K., Kato S., Ito T., Shiraki S., Kawase Y., Goto M., Kawashima S., Hemmi H., Fukada H., Yoshimura T
    • 雑誌名

      Molecular Microbiology

      巻: 95 号: 2 ページ: 245-257

    • DOI

      10.1111/mmi.12861

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] PEGylated D-Serine Dehydratase as a D-Serine Reucing Agent2015

    • 著者名/発表者名
      Ito T., Takada H., Isobe K., Suzuki M., Kitaura Y., Hemmi H., Matsuda T., Sasabe J., Yoshimura T.
    • 雑誌名

      Journal of Parmacetuical and Biomedical Analysis

      巻: in press ページ: 34-39

    • DOI

      10.1016/j.jpba.2014.12.044

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Domain characterization of Bacillus subtilis GabR, a pyridoxal 5′-phosphate-dependent transcriptional regulator2015

    • 著者名/発表者名
      Okuda K, Ito T, Goto M, Takenaka T, Hemmi H, Yoshimura T
    • 雑誌名

      J. Biochem.

      巻: to be assigned

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Is D-aspartate produced by glutamic-oxaloacetic transaminase -1 like 1(Got1l1), a putative aspartate racemase?2015

    • 著者名/発表者名
      Tanaka-Hayashi A, Hayashi S, Inoue R, Ito T, Konno K, Yoshida T, Watanabe M, Yoshimura T, Mori H
    • 雑誌名

      Amino Acids

      巻: 47 号: 1 ページ: 79-86

    • DOI

      10.1007/s00726-014-1847-3

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Enzyme assay for pyridoxal 5'-phosphate by apo-D-amino acid aminotransferase2015

    • 著者名/発表者名
      Ota H, Mushiga M, Yoshimura T, Yoshimune K
    • 雑誌名

      J. Biosci. Bioeng.

      巻: to be assigned 号: 1 ページ: 117-119

    • DOI

      10.1016/j.jbiosc.2014.12.006

    • NAID

      110009973295

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Reaction mechanism of Zn2+-dependent D-serine dehydratase: role of a conserved tyrosine residue interacting with pyridine ring nitrogen of pyridoxal 5'-phosphate2014

    • 著者名/発表者名
      Ito T., Matsuoka M., Koga K., Hemmi H., Yoshimura T.
    • 雑誌名

      Journal of Biochemistry

      巻: 156 号: 3 ページ: 173-180

    • DOI

      10.1093/jb/mvu035

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Conserved pyridoxal protein that regulates Ile and Val metabolism.2013

    • 著者名/発表者名
      Ito T, Iimori J, Takayama S, Moriyama A, Yamauchi A, Hemmi H, Yoshimura T.
    • 雑誌名

      J Bacteriol.

      巻: 195 号: 24 ページ: 5439-5449

    • DOI

      10.1128/jb.00593-13

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 新規バイオマーカーとしての D-アミノ酸とその酵素定量法2016

    • 著者名/発表者名
      吉村 徹、邊見 久、伊藤智和
    • 学会等名
      日本農芸化学会 2016年度大会シンポジウム
    • 発表場所
      札幌コンベンションセンター
    • 年月日
      2016-03-27
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Physiological function and metabolizing enzymes of D-amino acids2015

    • 著者名/発表者名
      Tohru Yoshimura, Hisashi Hemmi, Tomokazu Ito
    • 学会等名
      2015 International Symposium on Agricultural Biotechnology
    • 発表場所
      Dong-A University
    • 年月日
      2015-11-13
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] D-セリン分解の生物学と酵素学2015

    • 著者名/発表者名
      吉村 徹
    • 学会等名
      日本アミノ酸学会第9回学術大会
    • 発表場所
      滋賀県立大学
    • 年月日
      2015-10-23
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Properties of GabR, a pyridoxal 5’-phosphate-dependent transcriptional regulator of Bacillus subtilis, and alteration of its ligand specificity2015

    • 著者名/発表者名
      Tohru Yoshimura, Keita Okuda, Shiro Kato, Masaru Goto, Hisashi Hemmi, Harumi Fukada, Tomokzazu Ito
    • 学会等名
      18th Japanese-German Workshop Enzyme Technology
    • 発表場所
      Kyoto University
    • 年月日
      2015-09-13
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 真核生物型セリンラセマーゼが触媒するセリンデヒドレーション反応の機構2015

    • 著者名/発表者名
      吉村 徹、伊藤智和、松岡 舞、邊見久
    • 学会等名
      第11回D-アミノ酸学会学術講演会
    • 発表場所
      シティホールプラザアオーレ長岡
    • 年月日
      2015-08-25
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] セリンラセマーゼが触媒するD-セリンデヒドレーション反応の触媒機構2015

    • 著者名/発表者名
      松岡舞、伊藤智和、邊見 久、吉村 徹
    • 学会等名
      日本農芸化学会2015年度大会
    • 発表場所
      岡山大学
    • 年月日
      2015-03-26 – 2015-03-29
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] キノコに存在するD-アミノ酸の同定と定量2015

    • 著者名/発表者名
      余卓尓、吉野一晴、渡邊彰、伊藤智和、邊見久、麻田恭彦、吉村徹
    • 学会等名
      日本農芸化学会2015年度大会
    • 発表場所
      岡山大学
    • 年月日
      2015-03-26 – 2015-03-29
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Properties of GabR, a pyridoxal 5'-phosphate-dependent transcriptional regulator of Bacillus subtilis2014

    • 著者名/発表者名
      Tohru Yoshimura, Keita Okuda, Shiro Kato, Hisashi Hemmi, Tomokazu Ito
    • 学会等名
      Japan-Italy Joint Symposium: New Trends in Science and Engineering of Enzyme and Microbiology for Sustainable Society
    • 発表場所
      奈良市
    • 年月日
      2014-11-05 – 2014-11-07
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Development of enzymatic D-serine assay method and application to urinary D-serine assay2014

    • 著者名/発表者名
      Saki Ishizuka, Hiroe takada, Tomokazu Ito, Hisashi Hemmi, Katsumi Shibata, Tohru Yoshimura
    • 学会等名
      Japan-Italy Joint Symposium: New Trends in Science and Engineering of Enzyme and Microbiology for Sustainable Society
    • 発表場所
      奈良市
    • 年月日
      2014-11-05 – 2014-11-07
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Serine Racemase in Dictyostelium discoideum2014

    • 著者名/発表者名
      Saki Kobayashi, Natsuki HAMAUCHI, Tomokazu ITO, Hisashi HEMMI, Yukie SATO, Tamao SAITO, Tohru YOSHIMURA
    • 学会等名
      The 2nd International Conference of D-Amino Acid Research
    • 発表場所
      宇都宮市
    • 年月日
      2014-11-05 – 2014-11-07
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Conserved Pyridoxal Protein that Regulates Ile and Val Metabolism2014

    • 著者名/発表者名
      Tomokazu Ito, Hisashi Hemmi, Tohru Yoshimura
    • 学会等名
      Japan-Italy Joint Symposium: New Trends in Science and Engineering of Enzyme and Microbiology for Sustainable Society
    • 発表場所
      奈良市
    • 年月日
      2014-11-05 – 2014-11-07
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] E. coliのビタミンB6結合タンパク質YggSの欠損によるオフタルミン酸の蓄積とその要因2014

    • 著者名/発表者名
      山内綾子、伊藤智和、邊見久、吉村徹
    • 学会等名
      第87回日本生化学会大会
    • 発表場所
      京都市
    • 年月日
      2014-10-15 – 2014-10-18
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Reaction mechanism of eukaryotic serine racemase2014

    • 著者名/発表者名
      Tohru Yoshimura, Mai Matsuoka, Hisashi Hemmi, Tomokazu Ito
    • 学会等名
      The 2nd International Conference of D-Amino acid Research
    • 発表場所
      宇都宮市
    • 年月日
      2014-09-02 – 2014-09-05
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] D-SERINE METABOLISM IN CELLULAR SLIME MOLD AND EFFECTS OF D-SERINE DEHYDRATASE MUTATION2014

    • 著者名/発表者名
      Tomokazu ITO, Natsuki HAMAUCHI, Hisashi HEMMI, Tamao SAITO, Tohru YOSHIMURA
    • 学会等名
      The 2nd International Conference of D-Amino acid Research
    • 発表場所
      宇都宮市
    • 年月日
      2014-09-02 – 2014-09-05
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Catalytic mechanism of PLP- and Zn2+-dependent D-serine dehydratase2014

    • 著者名/発表者名
      Tomokazu Ito, Mai Matsuoka, Hisashi Hemmi, Tohru Yoshimura
    • 学会等名
      4th International Conference on Cofactors (ICC-04)
    • 発表場所
      Parma,Italy
    • 年月日
      2014-08-25 – 2014-08-28
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] ビタミンB 6 酵素の構造,機能進化に関する研究2014

    • 著者名/発表者名
      吉村 徹
    • 学会等名
      日本ビタミン学会第66回大会
    • 発表場所
      姫路市
    • 年月日
      2014-06-13 – 2014-06-14
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 亜鉛依存性D-セリンデヒドラターゼの反応機構:PLPピリジン環窒素の相互作用残基(Y203)の変異体解析2014

    • 著者名/発表者名
      伊藤智和、松岡舞、邊見久、吉村徹
    • 学会等名
      日本ビタミン学会第 66回大会
    • 発表場所
      姫路市
    • 年月日
      2014-06-13 – 2014-06-14
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] D-アミノ酸:基礎研究から応用へ2014

    • 著者名/発表者名
      吉村 徹
    • 学会等名
      第2回置賜マイクロ・ナノバイオフォーラム
    • 発表場所
      米沢市・置賜文化ホール
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] ビタミンB6が担うD-セリンの代謝と機能:セリンラセマーゼとD-セリンデヒドラターゼ2014

    • 著者名/発表者名
      吉村 徹
    • 学会等名
      ビタミンB研究委員会平成25年度シンポジウム
    • 発表場所
      大阪大学中之島センター
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 細胞性粘菌におけるD-セリン代謝酵素欠損の影響2014

    • 著者名/発表者名
      伊藤智和、濱内菜月、邊見久、吉村徹
    • 学会等名
      2014年度日本農芸化学会大会
    • 発表場所
      明治大学生田キャンパス
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] D-アミノ酸の新機能とその代謝関連酵素の応用2013

    • 著者名/発表者名
      吉村 徹
    • 学会等名
      酵素工学研究会 第69回講演会
    • 発表場所
      名古屋大学
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Eucaryotic D-serine dehydratase: reaction mechanism and application to D-serine assay2013

    • 著者名/発表者名
      Tohru Yoshimura
    • 学会等名
      17thGerman-Japan Workshop on Enzyme Technology
    • 発表場所
      Technical University, Hamburg
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] D-アミノ酸オキシダーゼとその応用2013

    • 著者名/発表者名
      吉村 徹、邊見久、加藤志郎
    • 学会等名
      第65回日本生物工学会大会シンポジウム
    • 発表場所
      広島国際会議場
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 招待講演

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公開日: 2013-05-21   更新日: 2019-07-29  

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