| 研究課題/領域番号 |
25292081
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| 研究種目 |
基盤研究(B)
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| 配分区分 | 一部基金 |
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| 応募区分 | 一般 |
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| 研究分野 |
森林科学
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| 研究機関 | 東京大学 |
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研究代表者 |
後藤 晋 東京大学, 農学生命科学研究科, 准教授 (60323474)
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| 研究分担者 |
北村 系子 国立研究開発法人・森林総合研究所, 北海道支所・森林育成研究グループ, 主任研究員 (00343814)
岩田 洋佳 東京大学, 農学生命科学研究科, 准教授 (00355489)
上野 真義 国立研究開発法人・森林総合研究所, 樹木分子遺伝研究領域, 主任研究員 (40414479)
久本 洋子 東京大学, 農学生命科学研究科, 助教 (60586014)
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| 研究期間 (年度) |
2013-04-01 – 2016-03-31
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| 研究課題ステータス |
完了 (2015年度)
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| 配分額 *注記 |
17,420千円 (直接経費: 13,400千円、間接経費: 4,020千円)
2015年度: 3,770千円 (直接経費: 2,900千円、間接経費: 870千円)
2014年度: 7,150千円 (直接経費: 5,500千円、間接経費: 1,650千円)
2013年度: 6,500千円 (直接経費: 5,000千円、間接経費: 1,500千円)
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| キーワード | QTL / フェノロジー / RADseq / SNPマーカー / リアルタイムPCR / トドマツ / トランスクリプトーム / データベース / 標高適応 / 連鎖地図 / ESTライブラリ / 耐凍性 / 適応的遺伝子 / 標高 / RAD-seq / 分離集団 / 遺伝子発現 / F2個体群 / マイクロサテライト / SNP / RNA / 次世代シーケンサー |
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| 研究成果の概要 |
トドマツの高標高×低標高交配家系から作出した分離集団240個体について、フェノロジーと成長形質を測定し、約500個のSNPマーカーを用いて連鎖地図を作成した結果、染色体数と同じ１2連鎖群に収束した。作成した連鎖地図を用いてQTL解析を行った結果、4形質について有意なQTLを検出できた。さらに、部位別に抽出したRNAを利用してトランスクリプトーム解析を行った結果、223,621本のトランスクリプトと71,707個の遺伝子が検出され、トドマツの遺伝子カタログデータベースを作成した。また、適応的遺伝子の季節変動を調べた結果、一部の遺伝子が強い周期性を持つことが判明した。
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