研究課題/領域番号 |
25292098
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研究種目 |
基盤研究(B)
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配分区分 | 一部基金 |
応募区分 | 一般 |
研究分野 |
森林科学
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研究機関 | 国立研究開発法人 森林総合研究所 |
研究代表者 |
吉村 研介 国立研究開発法人 森林総合研究所, その他部局等, 研究員 (30353915)
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研究分担者 |
勝木 俊雄 独立行政法人森林総合研究所, 多摩森林科学園, 主任研究員 (10353640)
吉丸 博志 独立行政法人森林総合研究所, 多摩森林科学園, 園長 (20353914)
能城 修一 独立行政法人森林総合研究所, 木材特性研究領域, チーム長 (30343792)
山本 節子(鈴木節子) (山本 節子 / 鈴木 節子) 独立行政法人森林総合研究所, 森林遺伝研究領域, 主任研究員 (70456622)
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研究期間 (年度) |
2013-04-01 – 2016-03-31
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研究課題ステータス |
採択 (2015年度)
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配分額 *注記 |
16,770千円 (直接経費: 12,900千円、間接経費: 3,870千円)
2015年度: 5,330千円 (直接経費: 4,100千円、間接経費: 1,230千円)
2014年度: 5,330千円 (直接経費: 4,100千円、間接経費: 1,230千円)
2013年度: 6,110千円 (直接経費: 4,700千円、間接経費: 1,410千円)
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キーワード | 分類形質 / 遺伝育種 / DNAバーコード / 日本産樹木 |
研究実績の概要 |
DNA バーコードとは、短いDNA 配列情報で、種の同定を行う手法であり、樹木のいかなる部位(葉、材、根、花粉など)からでもDNA が抽出できて、樹種の特定が出来るDNA バーコード情報の構築を目指している。これまで、森林総研と東北大学との共同による木材標本、さく葉標本、さらに大学演習林などに協力して収集した標本等、7000個体、1039種のさく葉標本とそのDNA を収集している。 ユニバーサルなプライマーが無く、解析が困難な葉緑体DNA のmatK 部分遺伝子領域を、累計で747種3500サンプル明らかにした。しかしながら実験に困難を伴うため、新たなプライマーを開発してテスト中である。DNA バーコードの種の識別能力は、rbcL部分配列では45.1%、trnH-psbA で68.8%、matK で65.7% であった。3領域を併せると、日本産樹木では77%程度の種識別が出来る。その結果、ブナ科、クスノキ科などでは、属を識別するのも困難な分類群が存在することが明らかとなった。 標本の個体情報および塩基配列情報は、JBOLI(Japanese Barcode of Life Initiative)が一員であるCBOL(Consortium for the Barcodeof Life)が運営する国際的なデータベースシステムBOLD(Barcode of Life Data Systems)に入力されており、一部の情報は、DNAバーコードデータベース (JBOL-DB)によって公開されている。
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現在までの達成度 (段落) |
26年度が最終年度であるため、記入しない。
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今後の研究の推進方策 |
26年度が最終年度であるため、記入しない。
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次年度使用額の使用計画 |
26年度が最終年度であるため、記入しない。
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