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メチル化シグナルによる長鎖非コードRNA機能の発現機構の解明

研究課題

研究課題/領域番号 25293073
研究種目

基盤研究(B)

配分区分一部基金
応募区分一般
研究分野 医化学一般
研究機関埼玉医科大学

研究代表者

黒川 理樹  埼玉医科大学, 医学部, 教授 (70170107)

研究分担者 藤本 健太  埼玉医科大学, 医学部, 助教 (50403580)
連携研究者 松下 明生  埼玉医科大学, 医学部, 客員講師 (50402269)
小川 純人  東京大学, 医学部附属病院, 准教授 (20323579)
研究期間 (年度) 2013-04-01 – 2016-03-31
研究課題ステータス 完了 (2015年度)
配分額 *注記
17,290千円 (直接経費: 13,300千円、間接経費: 3,990千円)
2015年度: 4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円)
2014年度: 4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円)
2013年度: 8,710千円 (直接経費: 6,700千円、間接経費: 2,010千円)
キーワード酵素 / 遺伝子 / 核酸 / 生体分子 / 発現制御 / メチル化 / 長鎖非コードRNA
研究成果の概要

我々はcyclin D1遺伝子プロモーターから転写される非コードRNA(プロモーター由来ncRNA-D)が、RNA結合タンパク質TLSとの結合を介してその遺伝子発現を抑制することを示した(Nature 454:126-30,2008)。TLSはpncRNA-Dの5末端側32-62を標的としていた。この領域は3末端側でステム-ループ構造をとるが、TLSは5末端32-44の直鎖状部分に強く結合していた。さらに、HeLa細胞の高浸透圧処理により、pncRNA-Dのアデノシン特異的メチル化が低下すると、逆にTLS結合が上昇した。現在、TLSのメチル化とRNA結合についても鋭意解析を進めている。

報告書

(4件)
  • 2015 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2014 実績報告書
  • 2013 実績報告書
  • 研究成果

    (24件)

すべて 2016 2015 2014 2013 その他

すべて 雑誌論文 (12件) (うち査読あり 5件、 オープンアクセス 2件) 学会発表 (6件) (うち招待講演 3件) 図書 (1件) 備考 (4件) 産業財産権 (1件)

  • [雑誌論文] Histone Methylation and STAT-3 Differentially Regulate Interleukin-6-Induced Matrix Metalloproteinase Gene Activation in Rheumatoid Arthritis Synovial Fibroblasts.2016

    • 著者名/発表者名
      Araki Y, Tsuzuki Wada T, Aizaki Y, Sato K, Yokota K, Fujimoto K, Kim YT, Oda H, Kurokawa R, Mimura
    • 雑誌名

      Arthritis Rheumatol.

      巻: 68 号: 5 ページ: 1111-23

    • DOI

      10.1002/art.39563

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] The binding specificity of translocated in liposarcoma/fused in sarcoma with lncRNA transcribed from the promoter region of cyclin D12016

    • 著者名/発表者名
      Yoneda, R., Suzuki, S., Mashima, T., Kondo, K., Nagata, T., Katahira, M. and Kurokawa, R.
    • 雑誌名

      Cell Biosci.

      巻: 6(4) 号: 1 ページ: 1-12

    • DOI

      10.1186/s13578-016-0068-8

    • NAID

      120005763383

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] アミロイド様凝集体は翻訳抑制により配偶子形成を制御していた2016

    • 著者名/発表者名
      黒川理樹
    • 雑誌名

      実験医学

      巻: 34 ページ: 69-71

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [雑誌論文] ポストゲノム時代に同定された転写活性化型lncRNA群―eRNAによる転写活性化のメカニズム2015

    • 著者名/発表者名
      米田竜馬、黒川理樹
    • 雑誌名

      実験医学 増刊

      巻: 33 ページ: 3284-3285

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [雑誌論文] 細胞内の生理的なRNA構造をゲノムワイドで解析する2015

    • 著者名/発表者名
      黒川理樹
    • 雑誌名

      実験医学

      巻: 33 ページ: 1757-1759

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [雑誌論文] Initiation of Transcription Generates Divergence of Long Noncoding RNAs.2015

    • 著者名/発表者名
      Kurokawa, R.
    • 雑誌名

      Long Noncoding RNAs: Structures and Functions,

      巻: 5 ページ: 69-91

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 巨大転写因子(MegaTrans)複合体によるエンハンサーの活性化2015

    • 著者名/発表者名
      黒川 理樹
    • 雑誌名

      実験医学

      巻: Vol.33 ページ: 54-55

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [雑誌論文] poly(A)鎖が翻訳効率を上げるのは胚発生初期のみだった2014

    • 著者名/発表者名
      黒川 理樹
    • 雑誌名

      実験医学

      巻: Vol.32 ページ: 1751-1753

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [雑誌論文] Development of a mouse monoclonal antibody for the detection of asymmetric dimethylarginine of Translocated in LipoSarcoma/FUsed in Sarcoma and its application in analyzing methylated TLS.2014

    • 著者名/発表者名
      Fujimoto, K., and Kurokawa, R.
    • 雑誌名

      Cell & Bioscience

      巻: 4 号: 1 ページ: 77-77

    • DOI

      10.1186/2045-3701-4-77

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Aberrant histone acetylation contributes to elevated interleukin-6 production in rheumatoid arthritis synovial fibroblasts2014

    • 著者名/発表者名
      Wada TT, Araki Y, Sato K, Aizaki Y, Yokota K, Kim YT, Oda H, Kurokawa R, Mimura T.
    • 雑誌名

      Biochem Biophys Res Commun.

      巻: 444 号: 4 ページ: 682-686

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2014.01.195

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] RNAがDNAメチル化を制御していた-長鎖非コードRNAの新たな機能2014

    • 著者名/発表者名
      黒川 理樹
    • 雑誌名

      実験医学

      巻: Vol.32 ページ: 63-65

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [雑誌論文] 低温電子顕微鏡と擬似原子モデルが解く転写開始の未解決問題2013

    • 著者名/発表者名
      黒川 理樹
    • 雑誌名

      実験医学

      巻: Vol.31 ページ: 1751-1752

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] 特異的結合タンパク質の解析から長鎖非コードRNAの機能を探索する2015

    • 著者名/発表者名
      黒川理樹
    • 学会等名
      第38回日本分子生物学会年会ワークショップ「長鎖非コードRNAのフロンティア:生化学、分子生物学、医学からのアプローチ」
    • 発表場所
      兵庫県神戸市(神戸国際会議場)
    • 年月日
      2015-12-02
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Transcriptional regulation by the long non-coding RNA transcribed from cyclin D1 promoter via protein arginine methylation of RNA-biding protein TLS.2014

    • 著者名/発表者名
      Fujimoto, K., Suzuki, S., Kurokawa, R.
    • 学会等名
      IIAS Research Conference 2014 Chromatin Decoding
    • 発表場所
      京都府木津川市(国際高等研究所)
    • 年月日
      2014-05-13
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Long noncoding RNAによる遺伝子発現制御2014

    • 著者名/発表者名
      黒川 理樹
    • 学会等名
      第51回日本臨床分子医学会学術集会シンポジウム
    • 発表場所
      東京都千代田区(東京国際フォーラム)
    • 年月日
      2014-04-11
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Mechanism of Transcription of Long Noncoding RNA.2014

    • 著者名/発表者名
      Kurokawa, R.
    • 学会等名
      Keystone Symposia
    • 発表場所
      Santa Fe, New Mexico, USA
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Transcriptional regulation by the long non-coding RNA transcribed from cyclin D1 promoter via protein arginine methylation of nuclear hormone receptor-cofactor TLS.2013

    • 著者名/発表者名
      Fujimoto, K., Suzuki, S., and Kurokawa, R.
    • 学会等名
      ENDO2013
    • 発表場所
      San Francisco, California, USA
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] 長鎖非コードRNA作用の分子機構の解析2013

    • 著者名/発表者名
      黒川 理樹
    • 学会等名
      第36回日本分子生物学会年会 ワークショップ主催
    • 発表場所
      兵庫県神戸市
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 招待講演
  • [図書] Long Noncoding RNAs: Structures and Functions In: Kurokawa,R. (eds.)2015

    • 著者名/発表者名
      Kurokawa, R.
    • 総ページ数
      257
    • 出版者
      Springer-Japan
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [備考] 埼玉医科大学ゲノム医学研究センター

    • URL

      http://www.saitama-med.ac.jp/genome/

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [備考] 埼玉医科大学ゲノム医学研究センター遺伝子構造機能部門

    • URL

      http://space.geocities.jp/idensikouzou/index.html

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [備考] 埼玉医科大学ゲノム医学研究センター

    • URL

      http://www.saitama-med.ac.jp/genome/

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [備考] 埼玉医科大学ゲノム医学研究センター遺伝子構造機能部門

    • URL

      http://space.geocities.jp/idensikouzou/index.html

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [産業財産権] 抗TLSモノクローナル抗体及びその製造方法、ハイブリドーマ及びその製造方法、並びに抗TLSモノクローナル抗体含有組成物2013

    • 発明者名
      黒川理樹、藤本健太
    • 権利者名
      黒川理樹、藤本健太
    • 産業財産権種類
      特許
    • 産業財産権番号
      2013-099962
    • 出願年月日
      2013-05-10
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書

URL: 

公開日: 2013-05-21   更新日: 2019-07-29  

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