関節リウマチ関連遺伝子におけるrare variantの包括的解析

• 研究課題/領域番号: 25293225
• 研究種目: 基盤研究(B)
• 配分区分: 一部基金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 膠原病・アレルギー内科学
• 研究機関: 国立研究開発法人理化学研究所
• 研究代表者: 高地 雄太 国立研究開発法人理化学研究所, 統合生命医科学研究センター, 副チームリーダー (60415156)
• 連携研究者: 明前 敬子 国立研究開発法人理化学研究所, 統合生命医科学研究センター, リサーチアソシエイ (80462737)
• 研究期間 (年度): 2013-04-01 – 2017-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2016年度)
• 配分額: 17,940千円 (直接経費: 13,800千円、間接経費: 4,140千円); 2015年度: 5,590千円 (直接経費: 4,300千円、間接経費: 1,290千円); 2014年度: 5,590千円 (直接経費: 4,300千円、間接経費: 1,290千円); 2013年度: 6,760千円 (直接経費: 5,200千円、間接経費: 1,560千円)
• キーワード: 関節リウマチ / rare variant / ケースコントロール関連解析 / 次世代シークエンサー

研究成果の概要

本研究は、関節リウマチ発症におけるrare variantの役割を明らかにすること目的とした．ゲノムワイド関連解析で同定された遺伝子およびNF-κBシグナルにおける主要16遺伝子 についてrare variantの同定を行ったところ，NF-κB関連遺伝子にrare variantが集積していることが明らかになった．特にRELA遺伝子に注目して，同定されたvariantの機能を解析したところ，患者群で特異的に認められたものの多くはNF-κB活性を上昇させるものであった．したがって，関節リウマチの病態には，少なからずrare variantが寄与していると考えられた．

研究成果

• [雑誌論文] olygenic burdens on cell-specific pathways underlie the risk of rheumatoid arthritis (2017)
  • 著者名/発表者名: Ishigaki K, Kochi Y, and et al.
  • 雑誌名: Nat Genet 巻: 印刷中
  • 査読あり
• [雑誌論文] 関節リウマチ (2016)
  • 著者名/発表者名: 高地 雄太
  • 雑誌名: Clinical Calcium 巻: 26(4) ページ: 55-59
• [雑誌論文] Genetics of autoimmune diseases: perspectives from genome-wide association studies. (2016)
  • 著者名/発表者名: Kochi Y
  • 雑誌名: Int Immunol. 巻: 28(4) 号: 4 ページ: 155-161
  • DOI: 10.1093/intimm/dxw002
  • 査読あり
• [雑誌論文] High-density genotyping of immune-related loci identifies new SLE risk variants in individuals with Asian ancestry (2016)
  • 著者名/発表者名: 76.Imamura M, Takahashi A, Yamauchi T, Hara K, Yasuda K, ... Okada Y et al.
  • 雑誌名: Nat Genet 巻: 48 号: 3 ページ: 323-330
  • DOI: 10.1038/ng.3496
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Genetics of rheumatoid arthritis in Asia-present and future. (2015)
  • 著者名/発表者名: Yamamoto K, Okada Y, Suzuki A, Kochi Y.
  • 雑誌名: Nat Rev Rheumatol 巻: AOP 号: 6 ページ: 375-379
  • DOI: 10.1038/nrrheum.2015.7
  • 査読あり
• [雑誌論文] Genetic basis of rheumatoid arthritis: a current review. (2014)
  • 著者名/発表者名: Kochi Y, Suzuki A, Yamamoto K.
  • 雑誌名: Biochem Biophys Res Commun 巻: 452 号: 2 ページ: 254-262
  • DOI: 10.1016/j.bbrc.2014.07.085
  • 査読あり
• [雑誌論文] Genetics of rheumatoid arthritis contributes to biology and drug discovery. (2014)
  • 著者名/発表者名: Okada Y, Wu D, Trynka G, Raj T, Terao C, Ikari K, Kochi Y, Ohmura K, Suzuki A, Yoshida S, Graham RR, Manoharan A, Ortmann W, Bhangale T, Denny JC, （省略）, GARNET consortium, （以下省略）.
  • 雑誌名: Nature 巻: 506 号: 7488 ページ: 376-381
  • DOI: 10.1038/nature12873
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] 関節リウマチの発症要因と発症メカニズム：遺伝要因 (2014)
  • 著者名/発表者名: 高地 雄太
  • 雑誌名: 日本臨牀 巻: 72 ページ: 40-43
• [学会発表] GWAS and functional genomics of autoimmune diseases (2016)
  • 著者名/発表者名: Kochi Y
  • 学会等名: 13th International Congress of Human Genetics
  • 発表場所: 京都国際会議場
  • 年月日: 2016-04-05
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Genetics of rheumatoid arthritis: insights from GWAS (2014)
  • 著者名/発表者名: Kochi Y
  • 学会等名: 日本人類遺伝学会
  • 発表場所: 東京都・タワーホール船堀
  • 年月日: 2014-11-21
  • 招待講演