バイオインフォマテック解析を用いた歯周疾患新規バイオマーカーの検索

• 研究課題/領域番号: 25293424
• 研究種目: 基盤研究(B)
• 配分区分: 一部基金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 歯周治療系歯学
• 研究機関: 東京医科歯科大学
• 研究代表者: 和泉 雄一 東京医科歯科大学, 医歯(薬)学総合研究科, 教授 (60159803)
• 研究分担者: 小林 宏明 東京医科歯科大学, 医歯学総合研究科, 非常勤講師 (50396967) ; 竹内 康雄 東京医科歯科大学, 医歯学総合研究科, 助教 (60396968) ; 南原 弘美 東京医科歯科大学, 医歯学総合研究科, 助教 (00632168) ; 田中 敏博 東京医科歯科大学, 疾患バイオリソースセンター, 教授 (50292850)
• 研究期間 (年度): 2013-04-01 – 2016-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2015年度)
• 配分額: 17,680千円 (直接経費: 13,600千円、間接経費: 4,080千円); 2015年度: 5,330千円 (直接経費: 4,100千円、間接経費: 1,230千円); 2014年度: 4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円); 2013年度: 7,670千円 (直接経費: 5,900千円、間接経費: 1,770千円)
• キーワード: エクソームシークエンス / 侵襲性歯周炎 / エクソーム解析 / 歯周炎

研究成果の概要

侵襲性歯周炎は、若くして発症し急速な骨破壊をきたす特殊な歯周炎であるが、その原因因子の特定には至っていない。この侵襲性歯周炎とは、全身的には健康であるが、急速な歯周組織破壊、家族内集積を特徴としており、発症には遺伝的な要因が関与していると考えられている。そこで、我々は侵襲性歯周炎を発症している２家系においてエクソームシークエンスという網羅的な遺伝子解析手法を用いて遺伝子解析を行った。その結果、２家系において特徴的な遺伝子の変異が発見された。その遺伝子の役割を解明することにより、侵襲性歯周炎の早期発見、新たな治療方法の開発に寄与できる可能性がある。

研究成果

• [雑誌論文] Salivary pathogen and serum antibody to assess the progression of chronic periodontitis: a 24-mo prospective multicenter cohort study (2016)
  • 著者名/発表者名: Morozumi T, Nakagawa T, Nomura Y, Sugaya T, Kawanami M, Suzuki F, Takahashi K, Abe Y, Sato S, Makino-Oi A, Saito A, Takano S, Minabe M, Nakayama Y, Ogata Y, Kobayashi H, Izumi Y, Sugano N, …., Yoshimura A, Hara Y, ….
  • 雑誌名: Journal of Periodontal Research 巻: 印刷中 号: 6 ページ: 768-778
  • DOI: 10.1111/jre.12353
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] A Genome-wide Association Study of Periodontitis in a Japanese Population (2015)
  • 著者名/発表者名: S. Shimizu, Y. Momozawa, A. Takahashi, T. Nagasawa, K. Ashikawa, Y. Terada, Y. Izumi, H. Kobayashi, M. Tsuji, M. Kubo, and Y. Furuichi
  • 雑誌名: Journal of Dental Research 巻: 1 号: 4 ページ: 1-7
  • DOI: 10.1177/0022034515570315
  • 査読あり
• [雑誌論文] A candidate enhancer element responsible for high-level expression of the aggrecan gene in chondrocytes. (2014)
  • 著者名/発表者名: Yuichi Ikeda, Kazuo Ito, Yuichi Izumi, Tamayuki Shinomura.
  • 雑誌名: J. Biochem. 巻: 156 号: 1 ページ: 21-28
  • DOI: 10.1093/jb/mvu014
  • NAID: 40020124391
  • 査読あり
• [雑誌論文] Porphyromonas gingivalis promotes neointimal formation after arterial injury through toll-like receptor 2 signaling. (2014)
  • 著者名/発表者名: Kobayashi N, Suzuki J, Ogawa M, Aoyama N, Komuro I, Izumi Y, Isobe M.
  • 雑誌名: Heart Vessels 巻: 29 号: 4 ページ: 542-549
  • DOI: 10.1007/s00380-013-0405-3
  • 査読あり
• [雑誌論文] Intraindividual variation in core microbiota in peri-implantitis and periodontitis. (2014)
  • 著者名/発表者名: N. Maruyama, F. Maruyama, Y. Takeuchi, C. Aikawa, Y. Izumi, I. Nakagawa.
  • 雑誌名: Scientific Reports 巻: 13 号: 1 ページ: 6602-6602
  • DOI: 10.1038/srep06602
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Thrombospondin-1 production is enhanced by Porphyromonas gingivalis lipopolysaccharide in THP-1 cells (2014)
  • 著者名/発表者名: Gokyu M, Kobayashi H, Nanbara H, Sudo T, Ikeda Y, Suda T, Izumi Y
  • 雑誌名: PLoS One 巻: 12 号: 12 ページ: 115107-115107
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0115107
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Application of quantitative proteomic analysis using tandem mass tags for discovery and identification of novel biomarkers in periodontal disease. (2013)
  • 著者名/発表者名: Tsuchida S, Satoh M, Kawashima Y, Sogawa K, Kado S, Sawai S, Nishimura M, Ogita M, Takeuchi Y, Kobyashi H, Aoki A, Kodera Y, Matsushita K. Izumi Y. Nomura F
  • 雑誌名: Proteomics 巻: Vol.13 号: 15 ページ: 2339-2350
  • DOI: 10.1002/pmic.201200510
  • 査読あり
• [雑誌論文] An effective technique for the processing of saliva for the analysis of leptin and adiponectin. (2013)
  • 著者名/発表者名: Thanakun S, Watanabe H, Thaweboon S, Izumi Y
  • 雑誌名: Peptides 巻: 47 ページ: 60-65
  • DOI: 10.1016/j.peptides.2013.06.010
  • 査読あり
• [雑誌論文] Osteoblastic differentiation enhances expression of TRPV4 that is required for calcium oscillation induced by mechanical force (2013)
  • 著者名/発表者名: Takafumi Suzuki
  • 雑誌名: Bone 巻: 54(1) 号: 1 ページ: 172-8
  • DOI: 10.1016/j.bone.2013.01.001
  • 査読あり
• [学会発表] 大規模並列シークエンサーを用いた侵襲性歯周炎のゲノム解析. (2015)
  • 著者名/発表者名: 須藤毅顕, 岡田随象, 小林宏明, 御給美沙, 田中敏博, 和泉雄一.
  • 学会等名: 第143回日本歯科保存学会
  • 発表場所: 文教シビックホール（東京都文京区）
  • 年月日: 2015-11-13
• [学会発表] 侵襲性歯周炎の全エクソーム解析による候補遺伝子の同定 (2015)
  • 著者名/発表者名: 須藤毅顕, 岡田随象, 小林宏明, 御給美沙, 和泉雄一, 田中敏博.
  • 学会等名: 第60回日本人類遺伝学会
  • 発表場所: 京王プラザホテル（東京都新宿区）
  • 年月日: 2015-10-16
• [学会発表] Bacterial evaluation in Periodontal-Endodontic lesion. (2015)
  • 著者名/発表者名: Misa Gokyu, Hiroaki Kobayashi, Nobuyuki Kawashima, Yuichi Ikeda, Hiromi Nanbara, Takeaki Sudo, Tomonari Suda, Yuichi Izumi.
  • 学会等名: The International Association for Dental Research
  • 発表場所: Boston, USA
  • 年月日: 2015-03-14
• [学会発表] Quantitative evaluation for counting bacterial cells using synthesis gene. (2014)
  • 著者名/発表者名: Misa Gokyu, Yuichi Ikeda, Hiroaki Kobayashi, Yuichi Izumi.
  • 学会等名: The 62nd Annual Meeting of Japanese Association for Dental Research
  • 発表場所: 大阪、KKRホテル大阪
  • 年月日: 2014-12-05
• [学会発表] Point of care system for detecting salivary porphyromonas gingivalis. (2013)
  • 著者名/発表者名: Hiroaki Kobayashi,Miho Machigashira,Reiko Suda,Toshiyuki Nagasawa,Yoshie Tanaka, Toshiaki Yoshino,Matsuo Yamamoto,Kazuyuki Noguchi,Yasushi Furuichi,Yuichi lzumi.
  • 学会等名: 10th Asian Pacific Society of Periodontology meeting.
  • 発表場所: Nara Prefectural New Public Hall, Nara, Japan.