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新規網羅的全ゲノム解析法に基づくアジアのロタウイルスの分子疫学と集団流行動態

研究課題

研究課題/領域番号 25305022
研究種目

基盤研究(B)

配分区分一部基金
応募区分海外学術
研究分野 衛生学・公衆衛生学
研究機関札幌医科大学

研究代表者

小林 宣道  札幌医科大学, 医学部, 教授 (80186759)

研究分担者 鷲見 紋子  札幌医科大学, 医学部, 准教授 (10363699)
漆原 範子  札幌医科大学, 医学部, 講師 (80396308)
ゴッシュ ソウビック  札幌医科大学, 医学部, 助教 (30597175)
研究協力者 合田 悟  
ワン ユアンホン  
パウル シャマル  
研究期間 (年度) 2013-04-01 – 2017-03-31
研究課題ステータス 完了 (2016年度)
配分額 *注記
17,550千円 (直接経費: 13,500千円、間接経費: 4,050千円)
2016年度: 3,250千円 (直接経費: 2,500千円、間接経費: 750千円)
2015年度: 4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円)
2014年度: 4,030千円 (直接経費: 3,100千円、間接経費: 930千円)
2013年度: 6,110千円 (直接経費: 4,700千円、間接経費: 1,410千円)
キーワードロタウイルス / ゲノム / 分子疫学 / 遺伝子分節 / 遺伝子交雑 / アジア / 下痢症 / 遺伝子型 / 中国 / バングラデシュ / 系統
研究成果の概要

アジアにおけるヒトロタウイルスの長期間にわたる流行動態を全ゲノム(11遺伝子分節)に基づいて分子疫学的に解析した。中国・武漢市で10年以上優勢であったG3P[8]型、その後優勢となったG9P[8]型株では、時間の経過とともに多くの遺伝子分節の系統が変化していた。バングラデシュで優勢なG2P[4]型では、2010年に見られた2つの遺伝学的系統が3年後には新たな別の系統に入れ替わっていた。以上の結果から、ロタウイルス主流行型ウイルス株では、遺伝子分節のリアソートメント(遺伝子交雑)による置換および変異が継時的に起きており、同じ遺伝子型のウイルスでも遺伝子学的には常に変化していることが示唆された。

報告書

(5件)
  • 2016 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2015 実績報告書
  • 2014 実績報告書
  • 2013 実績報告書
  • 研究成果

    (28件)

すべて 2017 2016 2015 2014 2013 その他

すべて 国際共同研究 (5件) 雑誌論文 (12件) (うち国際共著 6件、 査読あり 12件、 オープンアクセス 3件、 謝辞記載あり 4件) 学会発表 (11件) (うち国際学会 2件、 招待講演 1件)

  • [国際共同研究] 武漢市疾病対策制御センター(中国)

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [国際共同研究] マイメンシン医科大学(バングラデシュ)

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [国際共同研究] 武漢市疾病対策制御センター(中国)

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [国際共同研究] マイメンシン医科大学(バングラデシュ)

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [国際共同研究] ヤンゴン第二医科大学(ミャンマー)

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [雑誌論文] Distribution of two distinct Rotavirus B (RVB) strains in the north-central Bangladesh and evidence for reassortment event among human RVB revealed by whole genomic analysis2017

    • 著者名/発表者名
      Aung MS, Nahar S, Aida S, Paul SK , Hossain MA, Ahmed S, Haque N, Ghosh S, Malik YS , Urushibara N, Kawaguchiya M, Sumi A, Kobayashi N
    • 雑誌名

      Infection Genetics and Evolution

      巻: 47 ページ: 77-86

    • DOI

      10.1016/j.meegid.2016.11.001

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著 / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Multispecies reassortant bovine rotavirus strain carries a novel simian G3-like VP7 genotype2016

    • 著者名/発表者名
      Malik YS , Kumar N, Sharma K, Saurabh S, Dhama K, Prasad M, Ghosh S, Bányai K, Kobayashi N, Singh RK.
    • 雑誌名

      Infection Genetics and Evolution

      巻: 41 ページ: 63-72

    • DOI

      10.1016/j.meegid.2016.03.023

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Whole genomic analysis of G2P[4] human Rotaviruses in Mymensingh, north-central Bangladesh2016

    • 著者名/発表者名
      Aida S, Nahar S, Paul SK, Hossain MA, Kabir MR, Sarkar SR, Ahmed S, Ghosh S, Urushibara N, Kawaguchiya M, Aung MS, Sumi A, Kobayashi N
    • 雑誌名

      Heliyon

      巻: 2 号: 9 ページ: e00168-e00168

    • DOI

      10.1016/j.heliyon.2016.e00168

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Genomic characterization of G3P[6], G4P[6] and G4P[8] human rotaviruses from Wuhan, China: Evidence for interspecies transmission and reassortment events.2015

    • 著者名/発表者名
      Zhou X, Wang Y-H, Ghosh S, Tang W-F, Pang B-B, Liu M-Q, Peng J-S, ZhouD-J, Kobayashi N.
    • 雑誌名

      Infection Genetics and Evolution

      巻: 33 ページ: 55-71

    • DOI

      10.1016/j.meegid.2015.04.010

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著 / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Analysis of codon usage pattern evolution in avian rotaviruses and their preferred host.2015

    • 著者名/発表者名
      Kattoor JJ, Malik YS, Sasidharan A, Rajan VM, Dhama K, Ghosh S, Bányai K, Kobayashi N, Singh RK
    • 雑誌名

      Infection Genetics and Evolution

      巻: 34 ページ: 17-25

    • DOI

      10.1016/j.meegid.2015.06.018

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Whole genomic analysis of a porcine G6P[13] rotavirus strain.2015

    • 著者名/発表者名
      Ghosh S, Navarro R, Malik YS, Willingham AL, Kobayashi N
    • 雑誌名

      Veterinary Microbiology

      巻: 18 号: 3-4 ページ: 286-298

    • DOI

      10.1016/j.vetmic.2015.09.017

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Exotic rotaviruses in animals and rotaviruses in exotic animals.2014

    • 著者名/発表者名
      Ghosh S, Kobayashi N
    • 雑誌名

      VirusDisease

      巻: 25 号: 2 ページ: 158-172

    • DOI

      10.1007/s13337-014-0194-z

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Molecular epidemiology and genetic evolution of the whole genome of G3P[8] human rotavirus in Wuhan, China, from 2000 through 20132014

    • 著者名/発表者名
      Wang YH, Pang BB, Ghosh S, Zhou X, Shintani T, Urushibara N, Song YW, He MY, Liu MQ, Tang WF, Peng JS, Hu Q, Zhou DJ, Kobayashi N
    • 雑誌名

      Plos ONE

      巻: 9 号: 3 ページ: e88850-e88850

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0088850

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Hospital based surveillance and genetic characterization of rotavirusstrains in children (2014

    • 著者名/発表者名
      Mullick S, Mandal P, Nayak MK, Ghosh S, De P, Rajendran K, Bhattacharya MK, Mitra U, Ramamurthy T, Kobayashi N, Chawla-Sarkar M.
    • 雑誌名

      Vaccine

      巻: 32 Suppl 1 ページ: A20-A28

    • DOI

      10.1016/j.vaccine.2014.03.018

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Complex evolutionary patterns of two rare human G3P[9] rotavirus strains possessing a feline/canine-like H6 genotype on an AU-1-like genotype constellation.2013

    • 著者名/発表者名
      Wang YH, Pang BB, Zhou X, Ghosh S, Tang WF, Peng JS, Hu Q, Zhou DJ, Kobayashi N.
    • 雑誌名

      Infect Genet Evol

      巻: 16C ページ: 103-112

    • DOI

      10.1016/j.meegid.2013.01.016

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Whole genomic analyses of asymptomatic human G1P[6], G2P[6] and G3P[6] rotavirus strains reveal intergenogroup reassortment events and genome segments of artiodactyl origin.2013

    • 著者名/発表者名
      Ghosh S, Urushibara N, Chawla-Sarkar M, Krishnan T, Kobayashi N.
    • 雑誌名

      Infect Genet Evol

      巻: 16C ページ: 165-173

    • DOI

      10.1016/j.meegid.2012.12.019

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] The origin of two rare human P[10] rotavirus strains2013

    • 著者名/発表者名
      Ghosh S, Urushibara N, Kawaguchiya M, Shintani T, Kobayashi N
    • 雑誌名

      Infect Genet Evol

      巻: 13 ページ: 292-300

    • DOI

      10.1016/j.meegid.2012.10.021

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] Whole genomic analysis of human Rotavirus B in Bangladesh: evidence for co-circulation of genetically distinct strains.2016

    • 著者名/発表者名
      Kobayashi N, Aung MS, Aida S, Urushibara N, Kawaguchiya M, Sumi A, Paul SK, Nahar S, Hossain MA.
    • 学会等名
      50th Joint Working Conference on Viral Diseases US-Japan Cooperative Medical Science Program
    • 発表場所
      米国(ベセスダ)
    • 年月日
      2016-01-13
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Whole genomic analysis of a porcine G5P[13] Rotavirus strain2016

    • 著者名/発表者名
      Navarro R, Aung MS, Kobayashi N, Ghosh S
    • 学会等名
      First Joint AITVM-STVM conference (the Association of Institutions for Tropical Veterinary Medicine (AITVM) and the Society for Tropical Veterinary Medicine (STVM))
    • 発表場所
      ベルリン(ドイツ)
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Genetic diversity of human Rotavirus B detected in Bangladesh.2015

    • 著者名/発表者名
      Aung Meijisoe, Satoru Aida, Samsoon Nahar, Mitsuyo Kawaguchiya, Noriko Urushibara, Shyamal Kumar Paul, Muhammad Akram Hossain, Nobumichi Kobayashi.
    • 学会等名
      第63回日本ウイルス学会総会
    • 発表場所
      福岡国際会議場(福岡市)
    • 年月日
      2015-11-23
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] バングラデシュにおけるG2P[4]ヒトロタウイルス株の全遺伝子配列に基づく分子疫学的解析.2015

    • 著者名/発表者名
      Satoru Aida, Souvik Ghosh, Noriko Urushibara, Aung Meijisoe, Shyamal Kumar Paul, Nobumichi Kobayashi.
    • 学会等名
      第63回日本ウイルス学会総会
    • 発表場所
      福岡国際会議場(福岡市)
    • 年月日
      2015-11-23
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] Analysis on genomic makeup of G3P[6], G4P[6] and G4P[8] rotavirus strains in China.2015

    • 著者名/発表者名
      Kobayashi N, Zhou X, Wang YH, Ghosh S.
    • 学会等名
      17th International Conference on Emerging Infectious Diseases
    • 発表場所
      Taipei, Taiwan
    • 年月日
      2015-01-26 – 2015-01-27
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Predominance of G9P[8] rotavirus among patients with gastroenteritis in Wuhan, China, during 2011-2014.2014

    • 著者名/発表者名
      Wang YH, Zhou X, Pang BB, Tang WF, Peng JS, Hu Q, Zhou DJ, Kobayashi N.
    • 学会等名
      7th Asian Congress of Pediatric Infectious Diseases
    • 発表場所
      Beijing, China
    • 年月日
      2014-10-13
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Whole genomic analysis of human rotavirus strains causing asymptomatic infections in humans.2014

    • 著者名/発表者名
      Kobayashi N, Ghosh S, Sumi A, Taniguchi K, Wang YH.
    • 学会等名
      10th China-Japan International Conference of Virology.
    • 発表場所
      Changchun, China
    • 年月日
      2014-08-24
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Whole genomic analysis of G3P[6], G4P[6] and G4P[8] rotavirus strains in Wuhan, China.2014

    • 著者名/発表者名
      Kobayashi N, Zhou X, Wang YH, Ghosh S, Liu MQ, Pang BB, Tang WF, Peng JS, Hu Q, Zhou DJ.
    • 学会等名
      International Congress of Virology (IUMS, 2014)
    • 発表場所
      Montreal, Canada
    • 年月日
      2014-07-30
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] 全ゲノム解析からみた世界のヒトロタウイルスの分子進化と感染伝播の様態2014

    • 著者名/発表者名
      小林宣道
    • 学会等名
      第55回日本臨床ウイルス学会
    • 発表場所
      札幌
    • 年月日
      2014-06-15
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 全遺伝子配列に基づく中国の主流行型G3P[8]ヒトロタウイルスの12年間にわたる分子進化様態の解析2013

    • 著者名/発表者名
      小林宣道、Ghosh S、新谷つづみ、Wang Y-H、Zhou X、Pang BB
    • 学会等名
      第61回日本ウイルス学会学術集会
    • 発表場所
      神戸
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] Whole genomic analysis of common and unusual equine group A rotavirus strains detected in Japan2013

    • 著者名/発表者名
      Ghosh S、谷口孝喜、合田悟、小林宣道
    • 学会等名
      第61回日本ウイルス学会学術集会
    • 発表場所
      神戸
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書

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公開日: 2013-05-21   更新日: 2019-07-29  

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