| 研究課題/領域番号 |
25330054
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| 研究種目 |
基盤研究(C)
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| 配分区分 | 基金 |
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| 応募区分 | 一般 |
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| 研究分野 |
統計科学
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| 研究機関 | 公益財団法人がん研究会 |
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研究代表者 |
牛嶋 大 公益財団法人がん研究会, ゲノムセンター, 研究員 (60328565)
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| 連携研究者 |
松浦 正明 帝京大学, 大学院公衆衛生学研究科, 教授 (40173794)
三木 義男 東京医科歯科大学, 難治疾患研究所, 教授 (10281594)
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| 研究協力者 |
旦 慎吾 がん研究会, がん化学療法センター, 副部長 (70332202)
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| 研究期間 (年度) |
2013-04-01 – 2016-03-31
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| 研究課題ステータス |
完了 (2015年度)
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| 配分額 *注記 |
4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円)
2015年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2014年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
2013年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
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| キーワード | 多重検定 / SNP / ゲノムワイド関連解析 / 遺伝子間相互作用 / マイクロアレイ / クラスタリング / 遺伝子発現解析 / SNP解析 / 多重検定法 / False Discovery Rate |
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| 研究成果の概要 |
網羅的なSNP情報から遺伝子間相互作用を探索する際に、簡単な統計量を用いることによって従来より20倍程度高速に探索できるアルゴリズムを開発した。同様の方法を用いて、遺伝子発現データからの遺伝子間相互作用の検出、3遺伝子の相互作用を検出するアルゴリズムも開発した。応用として、Lassoクラスタリング法を用いて乳がんマイクロアレイデータの解析を行い、新規のサブタイプ分類や関連遺伝子の探索を行った。
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