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量子化学計算によるリボソームにおけるペプチド結合形成の反応機構の解明

研究課題

研究課題/領域番号 25330343
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
研究分野 生命・健康・医療情報学
研究機関兵庫医科大学 (2014-2015)
和歌山県立医科大学 (2013)

研究代表者

福島 和明  兵庫医科大学, 医学部, 教授 (00273730)

研究期間 (年度) 2013-04-01 – 2016-03-31
研究課題ステータス 完了 (2015年度)
配分額 *注記
3,380千円 (直接経費: 2,600千円、間接経費: 780千円)
2015年度: 520千円 (直接経費: 400千円、間接経費: 120千円)
2014年度: 520千円 (直接経費: 400千円、間接経費: 120千円)
2013年度: 2,340千円 (直接経費: 1,800千円、間接経費: 540千円)
キーワードリボソーム / ペプチド結合 / 反応機構 / 量子化学計算 / ONIOM法
研究成果の概要

細胞内では、リボソームでDNAの遺伝情報に基づいて、アミノ酸をつないでタンパク質が合成される。本研究では、量子化学計算を用いてリボソームにおけるペプチド結合形成の反応機構の探索を行った。
その結果、リボソームにおけるペプチド結合の形成は、中間体を経由する段階的な機構で進行すること、活性中心にある水分子を経由して水素原子が移動することで反応がスムーズに進むこと、および、反応の遷移状態が活性中心内の立体的、静電的影響によって安定化されることが明らかになった。

報告書

(4件)
  • 2015 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2014 実施状況報告書
  • 2013 実施状況報告書
  • 研究成果

    (1件)

すべて 2016

すべて 学会発表 (1件)

  • [学会発表] ONIOM Study of Stepwise and Concerted Mechanisms for Peptide Bond Formation in the Ribosome2016

    • 著者名/発表者名
      ○FUKUSHIMA, Kazuaki; ESAKI, Hiroyoshi
    • 学会等名
      日本化学会第96春季年会
    • 発表場所
      同志社大学京田辺キャンパス(京都府、京田辺市)
    • 年月日
      2016-03-24
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書

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公開日: 2014-07-25   更新日: 2019-07-29  

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