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集団遺伝学の確率モデルに関連した確率解析

研究課題

研究課題/領域番号 25400143
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
研究分野 解析学基礎
研究機関福岡女子大学 (2016)
九州歯科大学 (2013-2015)

研究代表者

飯塚 勝  福岡女子大学, 国際文理学部, 学術研究員 (20202830)

研究期間 (年度) 2013-04-01 – 2017-03-31
研究課題ステータス 完了 (2016年度)
配分額 *注記
2,340千円 (直接経費: 1,800千円、間接経費: 540千円)
2015年度: 650千円 (直接経費: 500千円、間接経費: 150千円)
2014年度: 780千円 (直接経費: 600千円、間接経費: 180千円)
2013年度: 910千円 (直接経費: 700千円、間接経費: 210千円)
キーワード集団遺伝学 / 分子進化 / 確率モデル / 確率過程 / マルコフ過程 / 出生死滅過程 / 拡散過程 / 遺伝子重複 / 遺伝子変更 / モラン・モデル / ライト=フィッシャー・モデル / 拡散近似
研究成果の概要

確率的要因を含む様々な集団遺伝学モデルに対して、以下の研究を行った。ランダムな環境変動(確率的自然淘汰)を第2の確率的要因とする2つの確率モデル(ライト=フィッシャー・モデルとモラン・モデル)の解析とこれらのモデル間の関係を明らかにした。また、互助的相互作用を伴う多次元確率モデルを間接的な互助的相互作用の効果や遺伝子重複を含む場合に拡張し、境界点への初期到達時間に関する諸性質を明らかにした。さらに、モラン・モデルの強自然淘汰・弱突然変異極限の諸性質を解明した。

報告書

(5件)
  • 2016 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2015 実施状況報告書
  • 2014 実施状況報告書
  • 2013 実施状況報告書
  • 研究成果

    (9件)

すべて 2016 2015 2014 その他

すべて 雑誌論文 (3件) (うち国際共著 1件、 査読あり 3件、 オープンアクセス 1件、 謝辞記載あり 1件) 学会発表 (6件) (うち招待講演 4件)

  • [雑誌論文] A model of compensatory molecular evolution involving multiple sites in RNA molecules2016

    • 著者名/発表者名
      Junko Kusumi, Motoshi Ichinose, Masasuke Takefu, Robert Piskol, Wolfgang Stephan and Masaru Iizuka
    • 雑誌名

      Journal of Theoretical Biology

      巻: 388 ページ: 96-107

    • DOI

      10.1016/j.jtbi.2015.10.008

    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] The weak mutation and strong selection limit of the Moran model satisfies the strong Markov property2015

    • 著者名/発表者名
      T. Takemura, M. Tomisaki and M. Iizuka
    • 雑誌名

      Ann. Reports of Graduate School of Humanities and Sciences, Nara Women ’s University

      巻: 30

    • NAID

      120006657952

    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] On the convergence of weak mutation limits of the Moran model in population genetics2014

    • 著者名/発表者名
      T. Takemura, M. Tomisaki and M. Iizuka
    • 雑誌名

      Ann. Reports of Graduate School of Humanities and Sciences, Nara Women ’s University

      巻: 29

    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 遺伝子変更が互助的相互作用による分子進化に及ぼす効果の数理的解析2016

    • 著者名/発表者名
      飯塚 勝
    • 学会等名
      九州分子進化セミナー
    • 発表場所
      九州大学・伊都キャンパス
    • 年月日
      2016-11-11
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] 遺伝子重複の効果を含む互助的相互作用による分子進化機構の確率モデルの定式化2016

    • 著者名/発表者名
      飯塚 勝
    • 学会等名
      九州分子進化セミナー
    • 発表場所
      九州大学・伊都キャンパス
    • 年月日
      2016-07-01
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] Model of Compensatory Molecular Evolution with Direct and Indirect Compensation2014

    • 著者名/発表者名
      M. Iizuka
    • 学会等名
      ミュンヘン大学バイオセンター (Biocenter, University of Munich) ・セミナー
    • 発表場所
      ミュンヘン大学(ドイツ・ミュンヘン市)
    • 年月日
      2014-09-04
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 集団遺伝学に現れる確率モデルの弱突然変異極限

    • 著者名/発表者名
      飯塚勝
    • 学会等名
      九州確率論セミナー
    • 発表場所
      九州大学・伊都キャンパス(福岡市)
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Model of compensatory molecular evolution with indirect compensation

    • 著者名/発表者名
      M. Iizuka
    • 学会等名
      ミュンヘン大学バイオセンター・セミナー
    • 発表場所
      ミュンヘン大学(ドイツ、ミュンヘン市)
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] A model of compensatory molecular evolution with indirect compensation

    • 著者名/発表者名
      J. Kusumi, M. Ichinose, M. Takefu, W. Wtephan, and M. Iizuka
    • 学会等名
      SMBE Satellite Meeting/ NIG International Symposium ''The Causes of Genome Evolution"
    • 発表場所
      Toray Conference Center(三島市)
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
    • 招待講演

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公開日: 2014-07-25   更新日: 2019-07-29  

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