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水和数の精密制御による小さなタンパク質の折れ畳みの観測:真の駆動力は何か

研究課題

研究課題/領域番号 25410022
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
研究分野 物理化学
研究機関九州大学

研究代表者

迫田 憲治  九州大学, 理学(系)研究科(研究院), 助教 (80346767)

研究期間 (年度) 2013-04-01 – 2016-03-31
研究課題ステータス 完了 (2015年度)
配分額 *注記
5,200千円 (直接経費: 4,000千円、間接経費: 1,200千円)
2015年度: 1,040千円 (直接経費: 800千円、間接経費: 240千円)
2014年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
2013年度: 2,600千円 (直接経費: 2,000千円、間接経費: 600千円)
キーワードゆらぎ / 水素結合 / 水和 / リボヌクレアーゼA / タンパク質 / 折り畳み / 水和効果 / 赤外分光法 / クラスター / エレクトロスプレーイオン化
研究成果の概要

タンパク質は,水系でその構造を安定化させているので,タンパク質の構造安定性にとって,周りの水和構造は極めて重要である.水和構造形成の主要な駆動力である水素結合は,系が持つ熱エネルギーによって,頻繁に解離と生成を繰り返していると思われる.よって,タンパク質の折れ畳みを理解するには,周囲を取り囲む水和構造の生成と崩壊,及びそれに伴う水和構造の組み替えまで考慮に入れる必要がある.本研究では,水和数を1分子レベルで精密に制御した生体関連分子の水和クラスターを真空中に生成し,このクラスターにレーザー多重共鳴分光法を適用することで,水和構造の動的な組み換えや揺らぎの関する知見を得た.

報告書

(4件)
  • 2015 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2014 実施状況報告書
  • 2013 実施状況報告書
  • 研究成果

    (27件)

すべて 2016 2015 2014 2013 その他

すべて 雑誌論文 (3件) (うち国際共著 1件、 査読あり 3件、 謝辞記載あり 3件) 学会発表 (23件) (うち国際学会 6件、 招待講演 5件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Rearrangements of a Water Molecule in Both Directions between Two Hydrogen-Bonding Sites of 5-Hydroxyindole Cation: Experimental Determination of the Energy Threshold for the Rearrangement2016

    • 著者名/発表者名
      T. Ikeda, K. Sakota, H. Sekiya
    • 雑誌名

      J. Phys. Chem. A

      巻: 120 号: 11 ページ: 1825-1832

    • DOI

      10.1021/acs.jpca.5b12111

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Macromolecular crowding modifies the impact of specific Hofmeister ions on the coil-globule transition of PNIPAM2015

    • 著者名/発表者名
      K. Sakota, D. Tabata, H. Sekiya
    • 雑誌名

      J. Phys. Chem. B

      巻: 119 号: 32 ページ: 10334-10340

    • DOI

      10.1021/acs.jpcb.5b01255

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Simultaneous interaction of hydrophilic and hydrophobic solvents with ethylamino neurotransmitter radical cations: Infrared spectra of tryptamine+-(H2O)m-(N2)n clusters (m, n≤3)2015

    • 著者名/発表者名
      M. Schuts, K. Sakota, R. Moritz, M. Schmies, T. Ikeda, H. Sekiya, O. Dopfer
    • 雑誌名

      J. Phys. Chem. A

      巻: 119 号: 39 ページ: 10035-10051

    • DOI

      10.1021/acs.jpca.5b07408

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著 / 謝辞記載あり
  • [学会発表] 混み合い環境におけるポリ(N-イソプロピルアクリルアミド)の構造転移に対するホフマイスター効果2016

    • 著者名/発表者名
      米山可凜,迫田憲治,関谷 博
    • 学会等名
      日本化学会第96回春季年会
    • 発表場所
      同志社大学
    • 年月日
      2016-03-24
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] ミオグロビンの2状態転移に対するポリエチレングリコールの吸着の効果とその分子量特異性2016

    • 著者名/発表者名
      安冨翔太,迫田憲治,関谷博
    • 学会等名
      日本化学会第96回春季年会
    • 発表場所
      同志社大学
    • 年月日
      2016-03-24
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] Molecular level inspection of H-bond rearrangement and fluctuation in the gas phase2015

    • 著者名/発表者名
      K. Sakota
    • 学会等名
      Pacifichem 2015
    • 発表場所
      Hawaii, USA
    • 年月日
      2015-12-15
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Rearrangement of hydrogen bond network in mono-hydrated 5-hydroxyindole clusters2015

    • 著者名/発表者名
      T. Ikeda, K. Sakota, H. Sekiya
    • 学会等名
      Pacifichem 2015
    • 発表場所
      Hawaii, USA
    • 年月日
      2015-12-15
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] The influence of molecular-weight specific adsorption of polyethylene glycol on two-state transition of myoglobin2015

    • 著者名/発表者名
      S. Yasutomi, K. Sakota, H. Sekiya
    • 学会等名
      Pacifichem 2015
    • 発表場所
      Hawaii, USA
    • 年月日
      2015-12-15
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] IR spectroscopy of 5-hydroxyindole-methanol in the gas phase: Rearrangement of H-bond2015

    • 著者名/発表者名
      K. Yoneyama, K. Sakota, H. Sekiya
    • 学会等名
      Pacifichem 2015
    • 発表場所
      Hawaii, USA
    • 年月日
      2015-12-15
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 超高感度バイオセンシングを目指した単一微小液滴顕微分光装置の開発2015

    • 著者名/発表者名
      迫田憲治,関谷博
    • 学会等名
      第9回分子科学討論会
    • 発表場所
      東京工業大学
    • 年月日
      2015-09-16
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] 5-ヒドロキシインドール水和クラスターカチオンにおける水和構造組み換えの観測2015

    • 著者名/発表者名
      池田貴将,迫田憲治,関谷博
    • 学会等名
      第9回分子科学討論会
    • 発表場所
      東京工業大学
    • 年月日
      2015-09-16
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] ポリ(N-イソプロピルアクリルアミド)の相転移に対する ホフマイスターイオンおよび巨大分子混み合いの複合効果2015

    • 著者名/発表者名
      米山可凜,迫田憲治,関谷 博
    • 学会等名
      第9回分子科学討論会
    • 発表場所
      東京工業大学
    • 年月日
      2015-09-16
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] ミオグロビンの2状態転移に対する ポリエチレングリコールの分子量特異的吸着とその効果2015

    • 著者名/発表者名
      安冨翔太,迫田憲治,関谷博
    • 学会等名
      第9回分子科学討論会
    • 発表場所
      東京工業大学
    • 年月日
      2015-09-16
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] Laser microscopy for a single levitated microdroplet: its application to FRET of simple dyes2015

    • 著者名/発表者名
      K. Sakota
    • 学会等名
      Workshop on Nanoscale Atomic and Molecular Systems
    • 発表場所
      Fukuoka, Japan
    • 年月日
      2015-08-20
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Water shuttling in hydrated molecular clusters2015

    • 著者名/発表者名
      K
    • 学会等名
      Recent Progress in Molecular Science of Korea and Japan
    • 発表場所
      Hiroshima, Japan
    • 年月日
      2015-07-30
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] ミオグロビンの2状態転移に対するポリエチレングリコールの添加効果とその分子量特異性2015

    • 著者名/発表者名
      安冨翔太,迫田憲治,関谷博
    • 学会等名
      九重分子科学セミナー
    • 発表場所
      九重共同研修所
    • 年月日
      2015-07-24
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] The impact of molecular-weight dependent adsorption of polyethylene glycol on two-state transition of myoglobin2015

    • 著者名/発表者名
      安冨翔太,迫田憲治,関谷博
    • 学会等名
      9th mini symposium on liquids
    • 発表場所
      九州大学
    • 年月日
      2015-07-04
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] ミオグロビンの2状態転移に対するポリエチレングリコールの 分子量特異的吸着の効果2015

    • 著者名/発表者名
      安冨翔太,迫田憲治,関谷博
    • 学会等名
      第52回化学関連支部合同九州大会
    • 発表場所
      北九州国際会議場
    • 年月日
      2015-06-27
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] 5-ヒドロキシインドール-メタノールクラスターの気相赤外分光:水素結合組み換えの観測2015

    • 著者名/発表者名
      米山可凜,迫田憲治,関谷 博
    • 学会等名
      第52回化学関連支部合同九州大会
    • 発表場所
      北九州国際会議場
    • 年月日
      2015-06-27
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] Rearrangement and fluctuation of hydrogen-bonded structures in microhydrated molecular clusters2014

    • 著者名/発表者名
      迫田憲治
    • 学会等名
      Core-to-Core international symposium
    • 発表場所
      ベルリン工科大学
    • 年月日
      2014-12-15
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] ポリ(N-イソプロピルアクリルアミド)の構造転移に対する 巨大分子の混み合いと塩添加の複合効果2014

    • 著者名/発表者名
      田端大樹,迫田憲治,関谷博
    • 学会等名
      第37回溶液化学シンポジウム
    • 発表場所
      アバンセ佐賀
    • 年月日
      2014-11-13
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
  • [学会発表] 温度応答性高分子へのアニオン吸着挙動に対する共存巨大分子の混み合い効果:ランダムコイル-グルビュール転移への影響2014

    • 著者名/発表者名
      迫田憲治,田端大樹,関谷博
    • 学会等名
      第7回分子科学討論会
    • 発表場所
      広島大学
    • 年月日
      2014-09-21
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
  • [学会発表] Combined effects of macromolecular crowding and salt-addition on the random coil-globule transition of a thermoresponsive polymer2014

    • 著者名/発表者名
      迫田憲治
    • 学会等名
      8th Mini-Symposium on liquids
    • 発表場所
      岡山大学
    • 年月日
      2014-07-05
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Molecular level inspection of structural fluctuation in hydrogen-bonded clusters2014

    • 著者名/発表者名
      迫田憲治,関谷博
    • 学会等名
      Gordon Research Conference
    • 発表場所
      Renaissance Tuscany Il Ciocco
    • 年月日
      2014-04-29
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
  • [学会発表] 5-ヒドロキシインドール水和クラスターの孤立気相分光:水和構造ゆらぎの観測2013

    • 著者名/発表者名
      迫田憲治,河野友輝,関谷博
    • 学会等名
      分子科学討論会
    • 発表場所
      京都テルサ
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] 孤立気相中における水素結合揺らぎの研究: ベンジルアルコール水和クラスターの赤外分光2013

    • 著者名/発表者名
      池田貴将,迫田憲治,関谷博
    • 学会等名
      分子科学討論会
    • 発表場所
      京都テルサ
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [備考]

    • URL

      http://www.scc.kyushu-u.ac.jp/Kouzou/str3j.html

    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書

URL: 

公開日: 2014-07-25   更新日: 2019-07-29  

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