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染色体構造とゲノム配列の統合にもとづく新規エピゲノム解析法の開発

研究課題

研究課題/領域番号 25430168
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
研究分野 ゲノム生物学
研究機関静岡県立大学 (2016)
浜松医科大学 (2013-2015)

研究代表者

渡邊 良久  静岡県立大学, 薬学部, 客員共同研究員 (00362187)

研究分担者 前川 真人  浜松医科大学, 医学部, 教授 (20190291)
研究期間 (年度) 2013-04-01 – 2017-03-31
研究課題ステータス 完了 (2016年度)
配分額 *注記
5,200千円 (直接経費: 4,000千円、間接経費: 1,200千円)
2015年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
2014年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
2013年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円)
キーワード染色体バンド / DNA複製 / 染色体バンド境界 / DNA複製タイミング / 神経可塑性 / 脳神経疾患 / ヒトゲノム / 染色体 / バンド境界 / 疾患遺伝子
研究成果の概要

染色体構造とゲノム配列の統合を目指した研究から、ヒト染色体の構造的クロマチン境界と考えられる“染色体バンド境界”を塩基配列レベルで特定し、その境界領域には、がん関連遺伝子群や脳神経疾患遺伝子群が集中して局在するという結果を得た。
本研究においては、これまでの我々の研究グループによる研究成果をもとに開発したヒト染色体“バンド境界”の網羅的なヒトゲノムマッピングにもとづく新規エピゲノム解析法の有効性を実証できた。最終的に、ヒトゲノムの“染色体バンド境界地図”を細胞間で比較解析することは、エピジェネティックな変化を起こしたゲノム部位を網羅的に特定する有効な手段になることを実証することができた。

報告書

(5件)
  • 2016 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2015 実施状況報告書
  • 2014 実施状況報告書
  • 2013 実施状況報告書
  • 研究成果

    (11件)

すべて 2016 2015 2014 2013

すべて 雑誌論文 (6件) (うち国際共著 2件、 査読あり 5件、 オープンアクセス 2件、 謝辞記載あり 3件) 学会発表 (5件)

  • [雑誌論文] pigenetic basis of neuronal plasticity: association with R/G-band boundaries on human chromosomes2016

    • 著者名/発表者名
      Watanabe, Y. and Maekawa, M.
    • 雑誌名

      Neuroepigenetics

      巻: 7 ページ: 1-6

    • DOI

      10.1016/j.nepig.2016.08.001

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Evaluation of serum bone alkaline phosphatase activity in patients with liver disease: Comparison between electrophoresis and chemiluminescent enzyme immunoassay.2016

    • 著者名/発表者名
      Zhan F, Watanabe Y, Shimoda A, Hamada E, Kobayashi Y, Maekawa M
    • 雑誌名

      Clin Chim Acta.

      巻: 460 ページ: 40-45

    • DOI

      10.1016/j.cca.2016.06.008

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] 疾患エピゲノムの新展開:脳神経疾患と神経可塑性との関連2015

    • 著者名/発表者名
      渡辺良久
    • 雑誌名

      臨床化学

      巻: 44 ページ: 154-154

    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Cell line differences in replication timing of human glutamate receptor genes and other large genes associated with neural disease2014

    • 著者名/発表者名
      1.Watanabe, Y., Shibata K. and Maekawa, M.
    • 雑誌名

      Epigenetics

      巻: 9 号: 10 ページ: 1350-1359

    • DOI

      10.4161/15592294.2014.967585

    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] 一般遺伝子検査 『遺伝子検査の進歩:特集/臨床検査値をどう読むか』2013

    • 著者名/発表者名
      渡邊良久
    • 雑誌名

      月刊 臨床と研究

      巻: 90 ページ: 12-15

    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [雑誌論文] R/G-band boundaries: Genomic instability and human disease2013

    • 著者名/発表者名
      Watanabe Y, Maekawa M
    • 雑誌名

      Clinica Chimica Acta

      巻: 419 ページ: 108-112

    • DOI

      10.1016/j.cca.2013.02.011

    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 脳神経疾患遺伝子群のエピゲノム解析:DNA複製タイミングならびに染色体バンド構造との関連2015

    • 著者名/発表者名
      渡邊良久, 前川真人
    • 学会等名
      第55回日本臨床化学会年次学術集会
    • 発表場所
      大阪大学(大阪府吹田市)
    • 年月日
      2015-10-30
    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
  • [学会発表] 脳神経疾患遺伝子群が局在するゲノム領域のエピジェネティク解析2014

    • 著者名/発表者名
      渡邊良久, 前川真人
    • 学会等名
      第21回日本遺伝子診療学会大会
    • 発表場所
      タワーホール船堀(東京都江戸川区)
    • 年月日
      2014-11-19 – 2014-11-22
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
  • [学会発表] 脳神経疾患遺伝子群が局在する染色体領域のエピゲノム解析2014

    • 著者名/発表者名
      渡邊良久, 前川真人
    • 学会等名
      第54回日本臨床化学会年次学術集会
    • 発表場所
      東京大学本郷キャンパス
    • 年月日
      2014-09-05 – 2014-09-07
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
  • [学会発表] がん関連遺伝子群が局在するヒト染色体R/G-バンド境界領域のゲノム機能解析2013

    • 著者名/発表者名
      渡邊良久, 前川真人
    • 学会等名
      第53回日本臨床化学会年次学術集会
    • 発表場所
      あわぎんホール(徳島市)
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] ヒト染色体のR/G-バンド境界に着目した疾患ゲノム解析2013

    • 著者名/発表者名
      渡邊良久, 前川真人
    • 学会等名
      第20回日本遺伝子診療学会大会
    • 発表場所
      アクトシティ浜松コングレスセンター(浜松市)
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書

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公開日: 2014-07-25   更新日: 2019-07-29  

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